计算溶液所需的质量、体积或浓度。
ActiBioPure™,EnzymoPure™,无RNA酶,无动物源,无菌,无载体,生物活性 级 ,适用于对基线干扰要求严格的色谱和分析工作流程。
-20°C储存,避免反复冻融。超低温运输 。请查阅批次 COA 获取详细规格。
SDS、COA、产品数据表及规格说明书均可下载。可通过批号查询获取批次 COA。
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
本公司生产的 AlkB (RNA/DNA 去甲基化酶, Nuclease-free) 即 AlkB (RNA/DNA demethylase, Nuclease-free)是由本公司自主研发的技术平台 通过大肠杆菌表达、纯化获得的不含 DNase 和 RNase 的高品质重组酶。AlkB 是一种α-酮戊二酸(α-Ketoglutarate, α-KG)和 Fe(II)依赖的双加氧 酶(Dioxygenase),可以有效地修复单链或双链 DNA 和 RNA 中的各种烷基化损伤(Alkylation damage),常被用于去除 RNA 中的 m6A 等甲基化 修饰,去除 DNA 中的 m1A、m3C、m6A 等修饰,并进一步用于后续的 qPCR 或高通量测序分析。N6-Methyladenosine (m6A)是真核生物中一 种最普遍和丰富的 RNA 转录后修饰,存在于各类真核或病毒 RNA,包括 mRNA、rRNA、tRNA、snRNA、microRNA (miRNA)和长链非编码 RNA (Long non-coding RNA, lncRNA)中,这种修饰被认为占据了超过 80%的 RNA 甲基化修饰。mRNA 转录物中 m6A 的丰度会影响 RNA 的多种代谢 过程,例如剪接(Splicing)、出核(Nuclear export)、翻译的能力及稳定性以及 RNA 转录。AlkB 可以在体外以α-酮戊二酸和 Fe(II)依赖的方式催化 RNA 的 m6A 去甲基化,通过生成 6-羟甲基衍生物(HO-m6A)并进一步转化为腺嘌呤(Adenine)。AlkB 是细菌暴露于甲基化试剂环境时产生的一种 适应性应激反应蛋白,不仅可以修复 RNA 的甲基化损伤,还可以修复 DNA 的甲基化损伤。AlkB 催化 DNA 中 1-甲基腺嘌呤(m1A)和 3-甲基胞嘧 啶(m3C)的去甲基化需要 O2、Fe2+和α-酮戊二酸的参与;AlkB 在催化 DNA 去甲基化修饰的同时,将α-酮戊二酸转化为琥珀酸和 CO2,并生成不 稳定的羟甲基,被羟基化的甲基再以甲醛的形式释放。单链 DNA (ssDNA)比双链 DNA (dsDNA)中的腺嘌呤的 N1 和胞嘧啶的 N3 更容易受到甲基 化影响,因此,相比 dsDNA,AlkB 对 ssDNA 中的损伤修复更为高效。
纯度(Purity) 不含 DNA 内切酶和外切酶,不含 RNA 酶,不含磷酸酯酶。
组分和说明
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产品应用
RNA 的 m6A、m1A、m3C 或 m1G 去甲基化;ARM-seq、PANDORA-seq 等;DNA 的 m1A、m3C 和 m6A 的去甲基化。
产品优势
AlkB 不含 RNase,可以更好地用于去甲基化修饰及后续的建库和高通量测序
使用说明
1.AlkB 对 total RNA 的 N6-methyladenosine (m6A)修饰的去甲基化反应:
a.AlkB 的去甲基化反应。
参考下表在冰浴中配制如下反应体系。
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注 1:按上表设置好反应体系后,轻轻混匀(可以用移液器吹打混匀或用 Vortex 在最低速度轻轻混匀),随后低速离心沉淀液体。RNA 和 AlkB 用量的微克数保持相同即可。AlkB 用量很少时,可以取适量先使用 Reaction Buffer (1X)进行稀释。如果希望去甲基化程度更加充 分,AlkB 的用量可以适当加大一些。
注 2:由于涉及 RNA 操作,需要严格按照 RNA 操作的规范进行,避免 RNase 污染,相关试剂和耗材需要经过 DEPC 处理去除 RNase 或者确保是 RNase free 的。
b.反应条件:37℃孵育 100min。
说明:为避免环境中 RNase 污染导致的样品 RNA 降解,可以考虑适当加大 AlkB 的用量并适当缩短孵 育时间。
c.终止反应:加入与反应体系等体积的含 11mM EDTA 和 200mM 乙酸铵的缓冲液可终止反应,或进行酚氯仿抽提。
保存条件: -20℃保存,≤0℃运输
注意事项:
(1)使用时宜放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20℃保存。
(2)本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
(3)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
通过匹配包装上的批号来查找并下载产品的 COA,每批产品都进行了严格的验证,您可放心使用!
| 批号(Lot Number) | 证书类型 | 货号 |
|---|---|---|
| 分析证书 | A743741 | |
| 分析证书 | A743741 |
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