Deltarasin

CAS: 1440898-61-2 货号: D421620 分子式: C40H37N5O 分子量: 603.75
有货
级别和纯度: 10mM in DMSO
别名
达塔拉辛
储存条件
-80℃储存
运输条件
特低温运输
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规格
库存
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1ml
D421620-1ml
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文献证明

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概述

Deltarasin 是一种 KRAS-PDEδ 相互作用的抑制剂,能够与 PDEδ 结合,Kd 值为 38 nM。

Product introduction

Deltarasin is an inhibitor of KRAS-PDEδ interaction with Kd of 38 nM for binding to purified PDEδ.

规格

别名
达塔拉辛
英文别名
2-[4-[(2S)-2-(2-Phenyl-1H-benzimidazol-1-yl)-2-(4-piperidinyl)ethoxy]phenyl]-1-(phenylmethyl)-1H-benzimidazole
规格或纯度
10mM in DMSO
英文名称
Deltarasin
生化机理
说明:IC50 值:通过小分子干扰哺乳动物 PDEδ 与 KRAS 的结合,为通过改变 RAS 在内膜的定位来抑制其致癌信号提供了一个新的机会。生化筛选和随后的基于结构的命中优化产生了 KRAS-PDEδ 相互作用的抑制剂,这些抑制剂以纳摩尔级的亲和力选择性地与 PDEδ 的预烯基结合袋结合,抑制致癌 RAS 信号,并抑制依赖于致癌 KRAS 的人胰腺导管腺癌细胞在体外和体内的增殖。
储存条件
-80℃储存
运输条件
特低温运输
作用类型
抑制剂
名称和识别符
PubChem SID
分子类型
小分子
IUPAC Name
1-benzyl-2-[4-[(2S)-2-(2-phenylbenzimidazol-1-yl)-2-piperidin-4-ylethoxy]phenyl]benzimidazole
INCHI
1S/C40H37N5O/c1-3-11-29(12-4-1)27-44-36-17-9-7-15-34(36)42-39(44)32-19-21-33(22-20-32)46-28-38(30-23-25-41-26-24-30)45-37-18-10-8-16-35(37)43-40(45)31-13-5-2-6-14-31/h1-22,30,38,41H,23-28H2/t38-/m1/s1
InChi Key
LTZKEDSUXKTTTC-KXQOOQHDSA-N
Smiles
C1CNCCC1C(COC2=CC=C(C=C2)C3=NC4=CC=CC=C4N3CC5=CC=CC=C5)N6C7=CC=CC=C7N=C6C8=CC=CC=C8
Isomeric SMILES
C1CNCCC1[C@@H](COC2=CC=C(C=C2)C3=NC4=CC=CC=C4N3CC5=CC=CC=C5)N6C7=CC=CC=C7N=C6C8=CC=CC=C8
关联CAS
分子量
603.75
Reaxy-Rn
26566983
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=26566983&ln=

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高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机杂环化合物
类(Class) 苯并咪唑类
亚类(Subclass) 苯基苯并咪唑
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 苯基苯并咪唑
其他上位类(Alternative Parents) 苯基咪唑类  苯氧基化合物  酚醚  烷基芳基醚  哌啶类  N-取代咪唑  杂芳族化合物  二烷基胺  氮杂环化合物  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents) 2-苯基咪唑 - 芳基醚 - 氨基酸 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 吡唑 - 苯基化合物 - 乙醚 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 咪唑 - 单环苯基基团 - N-取代咪唑 - 有机硝基化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 苯酚醚 - 苯氧基化合物 - 苯基苯并咪唑 - 哌嗪 - 二级脂肪胺 - 醛基
描述(Description) 该化合物属于苯基苯并咪唑类有机化合物。这类化合物具有苯基苯并咪唑骨架,其结构特征在于苯并咪唑单元中的咪唑环与苯基相连。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





关联靶点(人)
PDE6D Tclin 视网膜视杆视紫红质敏感的 cGMP 3',5'-环磷酸二酯酶亚基 delta(Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta) (4 活性数据)
活性类型 活性值-log(M) 作用机制 期刊 参考文献(PubMed IDs)
PDE6D Tclin Phosphodiesterase 6D (241 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
A549 (127892 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
HepG2 (196354 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
关联靶点(其它种属)
Hdac6 Histone deacetylase 6 (222 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
rep Replicase polyprotein 1ab (378 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
PDE6D Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta (1 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
SARS-CoV-2 (38078 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
作用机制
作用机制 Action Type target ID Target Name Target Type Target Organism Binding Site Name 参考文献
化学和物理性质
分子量
603.800 g/mol
XLogP3
7.800
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
1
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
4
可旋转键计数Rotatable Bond Count
9
精确质量Exact Mass
603.3 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
603.3 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
56.900 Ų
重原子数Heavy Atom Count
46
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
923.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
1
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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