2'-脱氧肌苷

CAS: 890-38-0 货号: D426699 分子式: C10H12N4O4 分子量: 252.23 Beilstein号: 33517 EC号: 212-964-1
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级别和纯度: Moligand™ ? Moligand™ —— 阿拉丁的配体和生物活性小分子系列。适用于需要明确小分子工具的受体、通路和结合研究。 10mM in DMSO
别名
2'-脱氧肌苷 | 9-(2-脱氧-β-D-呋喃核糖基)次黄嘌呤
储存条件
-80℃储存
运输条件
特低温运输
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规格
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文献证明

在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 8 篇同行评审文献引用。

概述

应用:

2′-脱氧肌苷已被用于通过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)对单个DNA样品中的核苷形式DNA损伤进行定量。它也被用作高效液相色谱分析的标准品。

2′-Deoxyinosine is a nucleoside composed of hypoxanthine attached to 2′-deoxyribose via a β-N9-glycosidic bond. 2′-Deoxyinosine in DNA can arise from deamination of adenosine. 2′-deoxyinsine can be used as a model compound to study the chemistry of adduct formation and radical chemistry that may affect DNA structures. 2′-Deoxyinosine is used to produce hybridization-sensitive fluorescent DNA probes with self-avoidance ability.

规格

别名
2'-脱氧肌苷 | 9-(2-脱氧-β-D-呋喃核糖基)次黄嘌呤
英文别名
9-(2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranosyl)-Hypoxanthine | 9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-3H-purin-6-one | bmse000942 | 1871BC26-669C-4B3A-8203-11AAECAA0F70 | 9-(2-Deoxy-b-D-erythro-pentofuranosyl)-1,9-dihydro-6H-purin-6-one | BDBM504
规格或纯度
Moligand™, 10mM in DMSO
英文名称
2′-Deoxyinosine
生化机理
2′-脱氧肌苷是一种由次黄嘌呤通过β-N9-糖苷键与2′-脱氧核糖连接而组成的核苷。DNA中的2′-脱氧肌苷可来自于腺苷的脱氨作用。2′-脱氧肌苷可作为模型化合物用于研究可能影响DNA结构的加合物形成和自由基化学。2′-脱氧肌苷可用于产生具有自我回避能力的杂交敏感型荧光DNA探针。 2′-脱氧肌苷是次黄嘌呤的一种核苷形式。它是由活性氮引起的DNA损害的一种DNA损伤产物。2′-脱氧肌苷是通过N2O3由亚硝化脱氨而形成的。
储存条件
-80℃储存
运输条件
特低温运输
名称和识别符
PubChem SID
EC号
212-964-1
分子类型
小分子
IUPAC Name
9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-purin-6-one
INCHI
1S/C10H12N4O4/c15-2-6-5(16)1-7(18-6)14-4-13-8-9(14)11-3-12-10(8)17/h3-7,15-16H,1-2H2,(H,11,12,17)/t5-,6+,7+/m0/s1
InChi Key
VGONTNSXDCQUGY-RRKCRQDMSA-N
Smiles
C1C(C(OC1N2C=NC3=C2N=CNC3=O)CO)O
Isomeric SMILES
C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=NC3=C2N=CNC3=O)CO)O
分子量
252.23
Beilstein号
33517
Reaxy-Rn
25897708
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=25897708&ln=

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高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 核苷、核苷酸及其类似物
类(Class) 嘌呤核苷
亚类(Subclass) 嘌呤2'-脱氧核糖核苷
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 嘌呤2'-脱氧核糖核苷
其他上位类(Alternative Parents) 次黄嘌呤  羟基嘧啶  N-取代咪唑  四氢呋喃  杂芳族化合物  仲醇  氧环化合物  氮杂环化合物  伯醇  有机光子化合物  有机氮化合物  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents) 羟基苯甲酸酯 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 吡唑 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 羟基嘧啶 - 嘌呤 - 咪唑 - 咪唑哌啶 - N-取代咪唑 - 有机硝基化合物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 初级醇 - 鸟苷酸 - 嘌呤-2'-脱氧核糖核苷 - 嘧啶 - 醛基 - 四氢呋喃
描述(Description) 该化合物属于嘌呤2'-脱氧核糖核苷类有机化合物。这类化合物由嘌呤与核糖连接而成,其核糖分子2位缺失羟基。
外部描述符(External Descriptors) purine 2'-deoxyribonucleoside
三维结构
交互式化学结构模型





关联靶点(人)
ADA Tclin Adenosine deaminase (129 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
VDR Tclin Vitamin D receptor (26531 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
作用机制
作用机制 Action Type target ID Target Name Target Type Target Organism Binding Site Name 参考文献
化学和物理性质
比旋光度
-16° (C=1,H2O)
熔点
220°C(dec.)(lit.)
分子量
252.230 g/mol
XLogP3
-1.700
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
3
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
6
可旋转键计数Rotatable Bond Count
2
精确质量Exact Mass
252.086 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
252.086 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
109.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
18
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
377.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
3
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
安全和危险性(GHS)
WGK Germany
3
个人防护装备
Eyeshields, Gloves, type N95 (US), type P1 (EN143) respirator filter
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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批号(Lot Number) 证书类型 货号
K2215053 分析证书 D426699
此产品的引用文献
溶液计算器