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苄基氨基甲酸酯嘧啶酮:性质与研究用途

Benzyl [1-[4-[[(4-fluorobenzyl)amino]carbonyl]-5-hydroxy-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl]-1-methylethyl]carbamate是一种结构复杂的杂环科研试剂,以5-羟基-1,6-二氢嘧啶-2-酮为核心骨架,兼具4-氟苄基酰胺侧链和Cbz保护的季铵基团,是药物化学和新药发现领域中极具价值的构建模块。

IUPAC命名
Benzyl [1-[4-[[(4-fluorobenzyl)amino]carbonyl]-5-hydroxy-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl]-1-methylethyl]carbamate
货号
B193707
核心骨架
5-羟基-1-甲基-6-氧代-1,6-二氢嘧啶(二氢嘧啶酮)
关键官能团
氨基甲酸酯(Cbz)、酰胺(CONH)、羟基(C-5 OH)、氟苯基、内酰胺羰基
含氮杂环
嘧啶-2(1H)-酮环系
保护基策略
季碳胺上采用Cbz(苄氧羰基)氨基甲酸酯保护基;可通过氢解脱保护

化学结构与组成

Benzyl [1-[4-[[(4-fluorobenzyl)amino]carbonyl]-5-hydroxy-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl]-1-methylethyl]carbamate(Aladdin货号B193707)是一种多官能团小分子,以5-羟基-1-甲基-6-氧代-1,6-二氢嘧啶(二氢嘧啶酮)为核心骨架,分子内融合了三种独特的药效团元素:

  • 二氢嘧啶酮核心:1,6-二氢嘧啶-2-酮环提供了富含氢键的平面杂环框架,广泛存在于生物活性天然产物和药物先导化合物中。
  • C-5羟基:环5位的羟基取代基增强了氢键供体能力,可参与金属配位或分子内相互作用,与酶活性位点结合密切相关。
  • 4-氟苄基酰胺:C-4位的4-氟苄胺衍生酰胺引入了脂溶性强、代谢稳定的氟代芳香基团,常用于药物设计中调节pKa、膜通透性和代谢稳定性。
  • Cbz保护的季碳胺:C-2取代基为含苄氧羰基(Cbz)氨基甲酸酯保护基的2-氨基丙-2-基,这是一种标准胺保护策略,可在温和氢解条件下选择性脱保护。

上述官能团的汇聚使该化合物成为合成化学和药物化学工作流程中多用途的中间体或探针分子。

理化性质与操作注意事项

深入了解该化合物的理化特性对于实验设计和实验室安全操作至关重要。

溶解性与储存

作为同时含有极性(羟基、酰胺、氨基甲酸酯)和亲脂性(氟苄基、苄基)区域的多环杂环化合物,预计该分子具有中等极性。DMSO、DMF和二氯甲烷等常用研究级溶剂适合配制储备液。由于含有亲脂性芳香取代基,水溶性可能有限;生物活性测定中建议采用共溶剂策略。储备液应在惰性气氛下低温保存(建议−20°C),以防止氨基甲酸酯键水解或烯醇/羟基基团氧化。

稳定性注意事项

Cbz氨基甲酸酯在室温酸性和碱性水溶液条件下稳定,但对催化氢解(如Pd/C、H2或甲酸铵)敏感。5-羟基-二氢嘧啶酮可能在羟基和羰基(酮式-烯醇式)之间发生互变异构;建议在DMSO-d6中进行NMR表征以确认溶液中的互变异构体状态。研究人员应避免长时间接触强酸或强碱,以防止酰胺或氨基甲酸酯官能团水解。

分析表征

化合物鉴定应包括1H NMR、13C NMR、HRMS和HPLC纯度检测。4-氟苄基的19F NMR信号为在合成序列中追踪该化合物提供了便利的分析手段。

科研与合成应用

该化合物的结构特征使其在多个研究领域具有应用价值:

药物化学与新药发现

二氢嘧啶酮(DHPM)骨架是药物化学中的优势杂环,在相关化合物系列中与降压、抗病毒、抗菌和抗肿瘤等多种生物活性相关。本化合物在C-2和C-4位具有精细修饰的取代基,可用作先导化合物、构效关系(SAR)研究的高级中间体或检测方法开发的参考标准品。4-氟苄基基团尤为值得关注,因为芳环上的氟取代是药物化学中广泛采用的策略,可改善代谢稳定性并精细调节亲脂性。

合成中间体与Cbz脱保护

作为季碳中心上含Cbz保护胺的化合物,该分子是合成游离胺类似物的有用中间体。Cbz基团可在标准条件下经钯催化氢解脱除,释放伯胺以供进一步功能化(如酰化、还原胺化、偶联反应),使其在以相关嘧啶酮胺为目标的多步合成方案中具有重要价值。

化学生物学探针

整合了氟苄基基团和二氢嘧啶酮的化合物可作为开发标记探针或基于片段筛选库的候选骨架。从事酶抑制或蛋白质-配体相互作用研究的科研人员可将该化合物作为片段苗头化合物或优化的起始结构加以利用。

订购、包装与质量保证

Aladdin Scientific以货号B193707供应Benzyl [1-[4-[[(4-fluorobenzyl)amino]carbonyl]-5-hydroxy-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl]-1-methylethyl]carbamate。研究人员应查阅当前产品页面,获取最新的包装规格、价格、纯度规格及质量检验报告(CoA)信息。

每批产品均经过质量控制,并附有CoA,详细说明纯度(通常由HPLC评估)、外观及可用的光谱数据。对于生物筛选或参考标准品等敏感应用,建议客户在使用前索取CoA,并在收货后通过独立NMR或MS分析验证化合物身份。

如需大批量订购、定制合成咨询或特殊纯度等级,请直接联系Aladdin Scientific技术销售团队。此类化合物的标准运输条件通常包括常温或冷链包装;请参阅产品SDS(安全数据表)了解正确的运输和储存要求。

常见问题

配制B193707储备液推荐使用哪种溶剂?

对于此类多官能团杂环化合物,通常推荐DMSO和DMF作为首选溶剂,因为它们能够溶解极性和亲脂性基团。二氯甲烷适用于合成应用。预计水溶性有限,生物活性测定应评估共溶剂方案(如DMSO/PBS)。

如何脱除该化合物上的Cbz保护基?

苄氧羰基(Cbz)基团最常用的脱除方法是在乙醇或乙酸乙酯等溶剂中,以Pd/C为催化剂,在氢气气氛(1 atm,室温)下进行催化氢解。对于需要避免压力操作的反应,可采用甲酸铵与Pd/C的转移氢化法作为替代。研究人员在操作前应确认分子中其他官能团(尤其是氟苄基)与上述条件兼容。

B193707是否适合用于生物活性筛选?

B193707中的二氢嘧啶酮骨架广泛存在于文献报道的多种生物活性化合物系列中,使该化合物成为探索性筛选中结构上值得关注的候选物。但是,Aladdin Scientific仅以科研试剂形式供应B193707;其具体生物活性、在细胞或体内系统中的安全性以及对特定检测方法的适用性均未经Aladdin独立验证。研究人员在用于生物系统之前,应自行进行实验验证并查阅相关文献。

B193707的推荐储存条件是什么?

该化合物应在惰性气氛(氮气或氩气)下密封保存于−20°C,以最大限度减少氨基甲酸酯键的水解并防止羟基/烯醇基团氧化。DMSO储备液应避免反复冻融。请务必查阅每批次随附的质量检验报告和安全数据表,获取批次特定的储存说明。

参考文献

  1. Kappe, C. O. Biologically active dihydropyrimidones of the Biginelli-type – a literature survey. European Journal of Medicinal Chemistry, 2000, 35(12), 1043–1052. doi:10.1016/S0223-5234(00)01172-7
  2. Roughley, S. D.; Jordan, A. M. The Medicinal Chemist's Toolbox: An Analysis of Reactions Used in the Pursuit of Drug Candidates. Journal of Medicinal Chemistry, 2011, 54(10), 3451–3479. doi:10.1021/jm200187y
  3. Müller, K.; Faeh, C.; Diederich, F. Fluorine in Pharmaceuticals: Looking Beyond Intuition. Science, 2007, 317(5846), 1881–1886. doi:10.1126/science.1131943

产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。

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Da — 若无特别说明,分子量单位默认为道尔顿。   Mw — 重均分子量。   Mn — 数均分子量。

产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。

引用本文

阿拉丁科学.《苄基氨基甲酸酯嘧啶酮:性质与研究用途》. 阿拉丁知识库,更新于 2026年10月9日。 https://www.aladdin-e.com/zh_cn/faqs/benzyl-1-4-fluorobenzyl-aminocarbonyl-hydroxy-methyl-oxo-dihydropyrimidinyl-methylethyl-carbamate.html
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