双环[1.1.1]戊烷-1,3-二羧酸:性质与实验室应用
双环[1.1.1]戊烷-1,3-二羧酸:性质与实验室应用
Bicyclo[1.1.1]pentane-1,3-dicarboxylic acid是一种具有张力的笼状二羧酸,在现代药物化学和药物发现中作为多功能构建模块及对位苯基生物等排体而广泛应用。
- IUPAC命名
- 双环[1.1.1]戊烷-1,3-二羧酸
- 分子式
- C7H10O4
- 分子量
- 158.15 g/mol
- 核心结构
- 双环[1.1.1]戊烷(BCP)笼状结构,C-1和C-3位各含一个羧酸基团
- 主要应用
- 在药物发现中用作对位苯基/叔丁基生物等排体;在多肽及材料化学中用作双功能连接体
- CAS号
- 需审核——源材料未提供
- 储存建议
- 储存于阴凉、干燥、通风良好的环境中,远离潮湿及不相容物质;具体条件需进一步确认
什么是Bicyclo[1.1.1]pentane-1,3-二羧酸?
Bicyclo[1.1.1]pentane-1,3-二羧酸(BCP二酸)属于双环[1.1.1]戊烷(BCP)化合物家族,是有机化学中最小且几何张力最大的碳环笼状体系之一。BCP骨架由三个亚甲基桥连接两个桥头碳原子构成,形成刚性三维结构,桥头原子间的C–C距离约为1.87 Å。
在该二羧酸衍生物中,两个桥头位置(C-1和C-3)均连接羧酸(–COOH)基团,使该分子成为对称的双功能试剂。两个酸基团之间被强制保持的anti空间关系,以及桥头位置高度的sp3特征,使BCP二酸与芳香族或线性脂肪族二酸有显著区别。
该化合物在制药和农药化学研究中备受关注,作为构建模块可赋予分子良好的理化性质——与其所替代的芳香族类似物相比,具有显著改善的水溶性、代谢稳定性及更低的亲脂性。
理化性质与结构意义
BCP笼状结构施加了严格的几何约束。桥头C–H键沿分子轴方向排列,环体系的三重对称性使C-1和C-3位的取代基呈现完美的线性棒状排列。这一几何构型与对位双取代苯环所呈现的空间矢量高度吻合,这也是BCP作为对位苯基生物等排体的主要依据。
与芳香族类似物相比,基于BCP的化合物具有以下关键理化特性:
- 水溶性提高:由于缺少平面芳香环,晶体堆积能和π–π堆积减弱,通常溶解度更高。
- logP值更低:BCP比苯或环己烷类似物具有更强的亲水性,有利于改善吸收和分布特征。
- 代谢稳定性改善:BCP笼状结构中的张力C–C键不易受细胞色素P450介导的芳香羟化反应影响。
- 刚性结构:构象限制降低了与靶标结合时的熵损失,可能提高结合亲和力。
二羧酸官能团提供了两个可进一步化学修饰的活性位点——两者可选择性或同时转化为酯、酰胺、酰氯或其他活化衍生物,从而构建多种连接体架构。
研究与合成应用
BCP-1,3-二羧酸在多个研究领域中充当关键中间体:
1. 药物化学——生物等排体替换
该化合物常用于替代先导化合物中的对位取代苯环或叔丁基。通过以BCP二酸衍生的连接体替代芳香核心,药物化学家可在不根本改变两个关键官能团间药效团距离的前提下,系统探索药效、选择性、ADME性质及安全性的变化。
2. 多肽与拟肽化学
两个羧酸均可通过标准多肽偶联试剂(如HATU、DIC/HOBt、EDC)与含胺片段偶联。BCP单元引入的刚性间隔臂可约束多肽骨架几何构象,有助于设计构象受限的拟肽分子,并提高其对蛋白酶的抗性。
3. 聚合物与材料科学
作为具有张力的双官能单体,BCP二酸可引入聚酰胺、聚酯或配位聚合物中。BCP单元的刚性和三维形状可赋予所得材料独特的力学性能和传输特性。
4. 探针与连接体合成
在化学生物学领域,BCP二酸用于构建双功能探针、PROTAC分子及其他需要具有确定长度、刚性且代谢稳定连接体的双功能降解分子。
操作、安全与储存指南
虽然BCP-1,3-二羧酸在标准实验室条件下未被归类为急性危害品,但研究人员在操作所有研究级试剂时应遵循良好实验室规范(GLP):
- 个人防护装备(PPE):佩戴适当手套(推荐丁腈手套)、护目镜及实验服。处理粉末时应佩戴防尘口罩或在通风橱内操作,以避免吸入细小颗粒。
- 储存:密封储存于阴凉(通常为室温或以下)、干燥、通风良好的环境中,避免直射阳光和潮湿。具体储存温度要求请参阅产品质量检验报告(CoA)。
- 稳定性:作为羧酸类化合物,应避免与强碱、强氧化剂及活性胺接触,以防止储存过程中发生意外的成盐或酰胺偶联反应。
- 废弃物处置:按照适用的地方、区域及国家法规处置废弃物,未经处理不得倒入下水道。
- 急救措施:如皮肤或眼睛接触,立即用水充分冲洗。如刺激持续存在,请就医。全面的危害信息请参阅产品安全数据表(SDS)。
注意:使用前请务必查阅Aladdin Scientific提供的产品专属SDS和CoA。具体危害分类及储存条件须以官方文件为准。
订购与规格信息
Aladdin Scientific以SKU B176816提供Bicyclo[1.1.1]pentane-1,3-二羧酸。订购时,研究人员和采购团队应考虑以下事项:
- 纯度:请通过质量检验报告(CoA)确认批次纯度。对于要求较高的合成应用,建议选用高纯度(≥95%或≥98%)规格。
- 数量:BCP二酸通常以毫克至克级别提供。请根据项目规模合理订购,以减少反复冻融和长期储存。
- 文件资料:在受监管的研究环境中使用前,应索取并审阅完整的CoA、SDS及结构确认数据(NMR、HPLC或MS)。
- 法规注意事项:BCP-1,3-二羧酸为仅供实验室使用的研究试剂,不适用于治疗、兽医或食品添加剂用途。
如需大宗询价、定制包装或技术支持,请通过产品页面或客服渠道直接联系Aladdin Scientific。
常见问题
BCP-1,3-二羧酸作为生物等排体的优势是什么?
双环[1.1.1]戊烷骨架以与对位双取代苯环高度相似的几何构型呈现两个桥头取代基,保持相近的药效团矢量。以BCP替代芳香环通常可改善水溶性、降低亲脂性,并消除细胞色素P450酶介导的芳香氧化敏感性,这些均是药物候选分子的理想特性。
BCP二酸的两个羧酸基团能否独立官能化?
原则上,利用保护基策略或在受控条件下利用反应性差异可实现选择性单官能化。然而,由于该分子具有对称性(C1和C3化学等价),实现真正的选择性需要仔细设计反应方案。在连接体合成中,更常见的做法是使用过量偶联试剂同时对两个基团进行官能化。
BCP-1,3-二羧酸在反应中应如何溶解?
BCP二酸通常可溶于极性非质子溶剂(如DMF和DMSO),以及碱性水溶液(如稀NaOH或K2CO3溶液,因其含有羧酸基团)。在极性较低的有机溶剂(如二氯甲烷或乙酸乙酯)中溶解度可能有限。请在您的具体条件下通过实验验证溶解度,并参阅CoA或SDS获取更多指导。
BCP-1,3-二羧酸是否适用于固相多肽合成(SPPS)?
是的,BCP-1,3-二羧酸原则上可作为刚性双功能间隔臂引入SPPS工作流程。适用基于Fmoc或Boc的标准SPPS偶联方案,可使用HATU或HBTU等试剂。应针对特定树脂和序列优化反应条件,并建议在大规模合成前进行相容性测试。
参考文献
- Stepan, A. F. et al. Application of the Bicyclo[1.1.1]pentane Motif as a Nonclassical Phenyl Ring Bioisostere in the Design of a Potent and Orally Active γ-Secretase Inhibitor. Journal of Medicinal Chemistry, 2012. doi:10.1021/jm300166q
- Nicolaou, K. C.; Rigol, S. The Role of Organic Synthesis in the Emergence and Development of Molecular Medicine. Chemical Society Reviews, 2018.
- Measom, N. D. et al. Investigation of a Bicyclo[1.1.1]pentane as a Phenyl Bioisostere in a Series of Antimicrobial Agents. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2017. doi:10.1021/acsmedchemlett.6b00504
- Gianatassio, R. et al. Strain-release amination. Science, 2016. doi:10.1126/science.aaf6326
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