Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸:性质、操作与合成应用
Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸:性质、操作与合成应用
Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸是一种侧链受保护的D-半胱氨酸构建单元,同时携带叔丁氧羰基(Boc)α-氨基保护基和乙酰氨甲基(Acm)巯基保护基,特别适用于通过固相肽合成正交组装含二硫键肽段。
- IUPAC全称
- (R)-2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-((乙酰氨甲基)硫基)丙酸
- 货号
- B356470
- 立体化学
- α碳为D构型(R构型)
- α-氨基保护基
- Boc(叔丁氧羰基),用TFA或强酸脱除
- 巯基保护基
- Acm(乙酰氨甲基),可由汞(II)、银(I)、碘或铊(III)选择性脱除
- 推荐储存条件
- 于2–8 °C避光防潮储存,条件允许时在惰性气氛下保存
- 主要应用
- 在Boc固相肽合成中用于正交巯基保护策略,实现选择性二硫键形成
化学特性与结构特征
Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸(通常缩写为Boc-D-Cys(Acm)-OH)是D-半胱氨酸的双重保护氨基酸衍生物,在两个不同位置携带两种不同的保护基:
- α-氨基上的Boc基团:叔丁氧羰基(Boc)是一种酸不稳定氨基甲酸酯,广泛用于经典Boc固相肽合成(SPPS)。在标准条件下,可用三氟乙酸(TFA)或无水HF将其干净脱除,且不影响Acm基团。
- 巯基(侧链)上的Acm基团:乙酰氨甲基(Acm)是一种对碱和酸均稳定的巯基保护基。它在TFA脱除Boc及多种偶联条件下均保持完整,从而可在链组装期间保留,直至合成后明确脱除。
α-碳的D构型使该构建单元有别于其L型对映体,对于需要非天然肽立体化学的应用至关重要,例如抗蛋白酶降解类似物或镜像(D-肽)文库合成。
Acm基团在正交二硫键形成中的作用
乙酰氨甲基(Acm)保护基是正交半胱氨酸保护策略的核心,尤其适用于含多个半胱氨酸残基、需要形成特定区域选择性二硫键的肽段。
正交保护的重要性:在含两个或多个二硫键的肽中,随机氧化会产生半胱氨酸配对错误的统计混合物。通过使用具有正交脱除条件的不同巯基保护基,化学家可以逐步、可控地引导二硫键的形成。
Acm脱除与同步二硫键形成:Acm基团可被以下试剂选择性裂解:
- 碘(I₂)/含水乙酸——同步氧化脱除并形成二硫键
- 醋酸汞(II)处理后再用H₂S还原
- 银(I)盐(如AgNO₃)或三氟乙酸铊(III)
上述条件与用于脱除Boc或tBu型保护基的酸性条件正交,从而实现复杂肽段中二硫键的顺序形成。
D-Cys(Acm)在镜像合成中的应用:在组装D-肽类似物时,Boc-D-Cys(Acm)-OH在半胱氨酸位置引入所需的D-立体中心,同时保留相同的基于Acm的正交巯基保护策略。
操作、储存与实验室安全
正确操作和储存Boc-D-Cys(Acm)-OH对于保持试剂完整性和确保合成结果的重现性至关重要。
储存建议:
- 于2–8 °C密封避光防潮储存。
- 长期储存时,建议在惰性气体(氮气或氩气)保护下储存,以尽量减少残余游离巯基的氧化(若Acm基团存在部分不稳定性)。
- 开封前应使样品瓶在室温下平衡,以防止冷凝吸潮。
操作注意事项:
- 穿戴标准个人防护装备(PPE):实验服、丁腈手套和护目镜。
- 在通风良好区域或通风橱中称量和操作,有机试剂细粉可能引起呼吸道刺激。
- 避免长时间皮肤接触;使用后彻底洗手。
稳定性注意事项:
- Boc基团对质子酸敏感,长时间暴露于潮湿环境中会降解;避免在潮湿环境中存放已开封的容器。
- Acm基团对TFA及温和酸/碱稳定,但在所需脱保护步骤之前,不应接触碘或重金属试剂。
注意:有关完整危害、急救和废弃物处置信息,请务必参阅Aladdin产品B356470的安全数据表(SDS)。
在Boc固相肽合成工作流程中的应用
Boc-D-Cys(Acm)-OH专为整合到Boc策略固相肽合成方案中而设计。以下概述了使用时的关键注意事项:
偶联:使用标准Boc-SPPS偶联试剂(如HBTU/DIPEA、DIC/HOBt或BOP)在DMF或NMP中活化Boc-D-Cys(Acm)-OH。典型偶联时间和试剂当量遵循标准Boc-SPPS方案;通过Kaiser(茚三酮)试验监测偶联完成情况。
脱保护循环:每次脱保护循环中,用纯TFA或TFA/DCM混合液(通常为30–50% TFA/DCM,处理20–30分钟)脱除Boc基团。Acm基团在整个循环中保持完整。
全局脱保护与树脂裂解:在Boc-SPPS中,最终裂解和全局脱保护通常用无水HF(HF/茴香醚)进行。在这些条件下,Boc、tBu、Bzl及类似基团被脱除,但Acm基团保留,使D-Cys巯基得到保护,以便后续在溶液中选择性形成二硫键。
裂解后Acm脱除与二硫键形成:HF裂解和纯化(通常通过反相HPLC)后,用碘或适当的金属试剂处理粗肽,脱除Acm基团,同时或顺序形成所需的二硫键。
相容性说明:在Boc-SPPS中使用D-氨基酸残基时,应注意由于空间位阻效应,偶联效率可能略低于L-氨基酸;可能需要延长偶联时间或进行双偶联。
质量、纯度与规格注意事项
对于固相肽合成,保护氨基酸构建单元的纯度直接影响偶联效率、逐步产率及最终肽产品的整体质量。研究人员在采购和使用Boc-D-Cys(Acm)-OH时应注意以下事项:
纯度要求:对于研究级SPPS,保护氨基酸通常要求纯度≥98%(HPLC法)。较低纯度等级可能引入缺失序列或副产物,使下游纯化复杂化。请务必核查Aladdin产品B356470每批次附带的质量检验报告(CoA)。
身份验证:通过1H NMR、质谱(ESI-MS或MALDI)和光学旋转([α]D)确认身份,尤其需验证D-立体构型。CoA应报告上述数据;若未报告,在进行大规模合成前请在实验室内自行验证。
批次间一致性:在多步合成中,尽可能使用同一批次的原料以减少变异性。如需批量或定制批次,请联系Aladdin Scientific采购部门。
水分含量:建议进行Karl Fischer滴定测定水分含量,以便准确称量吸湿性氨基酸衍生物。若水分含量显著,应相应校正称量量,或向Aladdin Scientific索取Karl Fischer数据。
常见问题
Boc-D-Cys(Acm)-OH与Boc-L-Cys(Acm)-OH有何区别,何时应选择D型异构体?
两者仅在α-碳的立体化学上不同:L-Cys为天然(S)构型,而D-Cys为非天然(R)构型。在合成D-肽、镜像肽、抗蛋白酶降解类似物,或任何需要在半胱氨酸位置引入D-立体中心的目标分子时,应选择Boc-D-Cys(Acm)-OH。两种异构体的化学反应性和Acm脱保护化学完全相同。
Boc-SPPS裂解后,如何脱除Acm基团并形成二硫键?
HF裂解并初步纯化线性肽后,在含水乙酸(例如AcOH/H₂O中0.1 M I₂)中用碘(I₂,通常每个Acm基团10当量)处理肽段。这将同步脱除Acm基团并氧化巯基形成二硫键(分子内形成环状肽,或分子间形成)。用抗坏血酸淬灭过量碘,并通过反相HPLC纯化产物。或者,醋酸汞(II)可在不立即形成二硫键的情况下脱除Acm,从而在氧化前实现选择性配对。
Boc-D-Cys(Acm)-OH与Fmoc-SPPS兼容吗?
Boc-D-Cys(Acm)-OH主要设计用于Boc-SPPS,因为Boc α-氨基保护基由TFA脱除,这与Fmoc-SPPS循环中使用的碱不稳定Fmoc保护基不兼容。在Fmoc-SPPS中,应使用相应的Fmoc-D-Cys(Acm)-OH构建单元。然而,Acm巯基保护基本身与标准Fmoc-SPPS条件(哌啶/DMF)兼容,因此Fmoc-D-Cys(Acm)-OH才是Fmoc策略的正确选择。
肽合成应要求何种纯度等级,如何验证D-立体构型?
为确保SPPS中可靠的偶联产率,应要求HPLC纯度≥98%。验证D-立体构型时,检查质量检验报告(CoA)中报告的光学旋转值([α]D):D-Cys衍生物的符号与相应L-Cys衍生物相反。还可通过手性固定相柱手性HPLC或与参考标准品对比进一步确认。如需产品B356470的批次特定CoA数据,请联系Aladdin Scientific。
参考文献
- Albericio, F. Orthogonal protecting groups for Nα-amino and C-terminal carboxyl functions in solid-phase peptide synthesis. Biopolymers (Peptide Science) 2000, 55, 123–139.
- Kamber, B.; Hartmann, A.; Eisler, K.; Riniker, B.; Rink, H.; Sieber, P.; Rittel, W. The synthesis of cystine peptides by iodine oxidation of S-trityl- and S-acetamidomethyl-cysteine peptides. Helv. Chim. Acta 1980, 63, 899–915.
- Andreu, D.; Albericio, F.; Sole, N.A.; Munson, M.C.; Ferrer, M.; Barany, G. Formation of disulfide bonds in synthetic peptides and proteins. Methods in Molecular Biology 1994, 35, 91–169.
- Merrifield, R.B. Solid phase peptide synthesis. I. The synthesis of a tetrapeptide. J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 2149–2154. doi:10.1021/ja00897a042
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
危险品化学品经营许可证(带存储)