Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸:性质与应用
Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸:性质与应用
Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸是一种双重保护的D-半胱氨酸构建单元,其α-氨基携带酸不稳定的叔丁氧羰基(Boc)保护基,巯基携带乙酰氨甲基(Acm)保护基,可在含D-构型半胱氨酸残基的肽合成中实现正交脱保护策略。
- IUPAC全称
- (R)-2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-((乙酰氨甲基)硫代)丙酸
- 货号
- B356470
- α-氨基保护基
- Boc(叔丁氧羰基),可用TFA或HF脱除
- 巯基保护基
- Acm(乙酰氨甲基),可用醋酸汞、硝酸银或碘脱除
- 立体化学
- α碳为D-构型(R构型)
- 主要应用
- 用于需要正交半胱氨酸巯基保护的Boc固相肽合成(SPPS)构建单元
- Santa Cruz参考编号
- sc-285237
化学结构与双重保护策略
Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸在D-半胱氨酸骨架的两个活性官能团上具有两种不同的保护基。α-氨基被叔丁氧羰基(Boc)保护基掩盖,该氨基甲酸酯基团对碱稳定、对酸不稳定,可被三氟乙酸(TFA)或无水氟化氢(HF)等强酸高效脱除。侧链巯基则由乙酰氨甲基(Acm)保护基保护,该硫醚连接的基团在标准Boc/HF或Fmoc/TFA固相肽合成循环所用的酸性和碱性条件下均保持稳定。
这种双重保护方案是正交保护策略的核心:Boc基团在每个偶联循环中被选择性脱除,而Acm基团在整个合成和整体脱保护过程中持续保留,直至在合成后的独立步骤中被定向切除。当肽链含有多个需以特定区域化学方式形成二硫键的半胱氨酸残基时,这种选择性尤为关键。
D-构型在肽设计中的作用
D-氨基酸构型(α碳为R构型)使该构建单元有别于更常见的L-型对应物。将D-半胱氨酸残基引入肽序列会在局部引入立体化学反转,从而深刻改变二级结构、蛋白酶抗性和受体结合几何构型。
研究人员选择D-氨基酸构建单元的主要原因包括:
- 蛋白酶稳定性:大多数哺乳动物蛋白酶对L-氨基酸具有立体专一性;D-残基可显著延长治疗性肽在生物基质中的半衰期。
- 构象控制:D-残基可诱导或稳定β-转角及其他非经典结构基序。
- 药效团映射:用D-对映体替换L-残基是药物化学中探测结合位点几何构型和鉴定关键接触点的经典手段。
当被替换的残基为半胱氨酸时,在合成过程中维持精确的巯基保护对于避免不必要的二硫键重排至关重要,这使得Acm保护基在此类应用中尤为有价值。
固相肽合成:实践注意事项
在Boc策略固相肽合成中,Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸的引入方式与其他Boc-氨基酸相同。DIC/HOBt、HATU/DIPEA或BOP/NMM等标准偶联试剂均适用。巯基上的Acm保护基不会干扰Boc化学所用的偶联活化或树脂切割条件。
脱保护与二硫键形成:整体脱保护(如HF切割)后,Acm保护基在粗肽上保持完整。随后可选择性脱除Acm:
- 醋酸汞溶于含水乙酸,随后用H₂S处理以除去汞。
- 硝酸银溶于乙酸/水体系,随后用二硫苏糖醇(DTT)处理。
- 碘溶于乙酸/水体系——该方法可同时脱除Acm保护基并氧化游离巯基形成二硫键,对于定向二硫键形成尤为高效。
研究人员应注意,长时间活化过程中D-半胱氨酸α碳可能发生外消旋化;使用预制活性酯或配合高效试剂缩短偶联时间有助于保持立体化学完整性。
储存、操作与质量注意事项
含巯基保护基的Boc-氨基酸通常对水分敏感,应在惰性气氛(氮气或氩气)下、低温(通常为−20 °C)密封储存。长时间暴露于大气湿度可导致Boc基团水解,而氧化条件可能影响Acm保护的巯基。
建议操作规范:
- 开封前将冷冻小瓶在室温下平衡,以防止冷凝水。
- 尽可能在惰性气氛下将样品称量并溶于无水溶剂(DMF、NMP或DCM)中。
- 在关键合成前,通过HPLC确认纯度,并通过LC-MS或NMR确认结构。
- 通过旋光测定或手性HPLC验证D-构型,并确认无L-对映体污染。
Aladdin Scientific以目录编号B356470供应该化合物。需要质量分析证书(CoA)或安全数据表(SDS)的研究人员可联系Aladdin客户支持或直接从产品页面下载相关文件。
常见问题
Boc-Cys(Acm)-OH与Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸有何区别?
Boc-Cys(Acm)-OH通常指L-构型(S)对映体,即天然氨基酸形式。Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸(B356470)则是D-构型(R)对映体。两者具有相同的保护基化学性质,但在α碳的立体化学上有所不同,这决定了它们在酶促过程中的行为以及对肽二级结构的影响。
肽链组装完成后,用哪些试剂脱除Acm保护基?
Acm保护基可用醋酸汞的含水乙酸溶液脱除(随后用H₂S或硫醇处理以去除汞),也可用硝酸银(随后用DTT处理)或乙酸/水体系中的碘脱除。碘法尤为便捷,因为它可在单步反应中同时脱除Acm保护基并氧化巯基形成二硫键。
该化合物是否同时兼容Fmoc固相肽合成和Boc固相肽合成?
Acm保护基对哌啶(用于Fmoc脱保护)和TFA(用于Fmoc整体切割)均稳定,因此原则上若先将Boc基团转化或使用预活化形式,Boc-S-乙酰氨甲基-D-半胱氨酸也可用于Fmoc固相肽合成。然而,该化合物最适合与Boc固相肽合成配合使用:在每个循环中TFA脱除Boc氨基保护基,最终用HF切割树脂,Acm保护基在整个过程中保持完整。计划采用Fmoc策略合成的研究人员应考虑使用Fmoc-D-Cys(Acm)-OH。
如何确认所收到物料的D-构型?
使用合适手性固定相(如Chiralpak IA或AD-H)进行手性HPLC分析是验证对映体过量并以L-标准品为参照确认D-构型最可靠的方法。在规定溶剂和浓度下测定旋光值可提供快速的二次核验。可向Aladdin Scientific索取批次特定旋光数据的质量分析证书。
参考文献
- Andreu D, Albericio F, Sole NA, Munson MC, Ferrer M, Barany G. Formation of disulfide bonds in synthetic peptides and proteins. Methods Mol Biol. 1994;35:91-169.
- Isidro-Llobet A, Alvarez M, Albericio F. Amino acid-protecting groups. Chem Rev. 2009;109(6):2455-2504. doi:10.1021/cr800323s
- Barany G, Merrifield RB. Solid-phase peptide synthesis. In: Gross E, Meienhofer J, eds. The Peptides. Vol. 2. Academic Press; 1980:1-284.
- Akaji K, Tatsumi T, Yoshida M, Kimura T, Fujiwara Y, Kiso Y. Disulfide bond formation using the silyl chloride-sulfoxide system for the synthesis of cystine peptides. J Am Chem Soc. 1992;114(12):4137-4143.
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
危险品化学品经营许可证(带存储)