顺式-5-氨基-2-Boc-六氢-环戊[c]吡咯盐酸盐 常见问题解答
顺式-5-氨基-2-Boc-六氢-环戊[c]吡咯盐酸盐 常见问题解答
cis-5-amino-2-boc-hexahydro-cyclopenta[c]pyrrole hydrochloride 是一种含游离伯胺的Boc保护双环吡咯烷骨架,作为构象受限的构建模块广泛应用于药物化学和制药合成领域。
- 产品货号
- C174710
- 化合物类别
- Boc保护双环吡咯烷盐酸盐
- 立体化学
- 环连接处为顺式构型
- 关键官能团
- 叔丁氧羰基(Boc)保护氮原子,伯胺(以盐酸盐形式存在)
- 主要应用
- 用于药物发现和药物化学的构象受限骨架
- 储存建议
- 存放于阴凉干燥避光避湿处;遵照供应商标签说明
顺式-5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐是什么?
顺式-5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐是一种双环杂环化合物,具有稠合的环戊烷–吡咯烷(环戊并[c]吡咯)环系。吡咯烷环上的氮原子由叔丁氧羰基(Boc)保护,5位胺以盐酸盐形式存在,使其稳定且易于操作。顺式标注指明了环连接处的相对立体化学,约束了分子的三维构型,并使其有别于相应的反式异构体。
该化合物属于构象受限胺类构建模块大家族,在现代药物发现项目中具有重要意义,与柔性链状类似物相比,刚性结构可提高靶点选择性、代谢稳定性和药代动力学特征。
关键化学性质与结构
六氢环戊并[c]吡咯核心是一种双环体系,由五元碳环(环戊烷)与五元含氮环(吡咯烷)稠合而成。在全饱和(六氢)形式中,体系富含sp³碳,与芳香杂环相比具有更好的水溶性和三维性。
吡咯烷氮上的Boc基团作为正交保护基,可在温和酸性条件下(如三氟乙酸或二氧六环中的盐酸)轻松脱除,而不影响大多数其他官能团。C-5位的伯胺以盐酸盐形式分离,以提高稳定性和货架寿命。顺式相对构型将胺和Boc氮取代基锁定在双环骨架的同一面,为药效团呈现提供了明确的空间取向。
在药物化学和药物发现中的应用
顺式-5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐主要用作片段筛选和先导化合物优化药物发现项目中的合成构建模块。其两个差异保护的氮原子允许正交修饰:Boc保护的吡咯烷氮可独立于伯胺进行脱保护和官能化,从而通过酰胺偶联、还原胺化、磺酰胺成形或脲合成等方法构建复杂的含胺结构。
该刚性双环骨架尤其适合替代药物候选分子中的柔性哌嗪或哌啶基序,因为强制的顺式几何构型可将取代基投射到明确的方向,从而提高对激酶、GPCR和蛋白酶活性位点等生物靶标的结合亲和力和选择性。
该化合物还用于拟肽和大环前体的合成,在这些应用中构象控制对活性至关重要。
操作、储存和安全注意事项
与大多数伯胺盐酸盐一样,操作顺式-5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐时应遵守标准实验室防护规程:佩戴适当的个人防护装备(PPE),包括手套、护目镜和实验服。称量或溶解化合物时应在通风良好的区域或通风橱内进行。
储存时,将材料密封于原包装容器中,置于阴凉干燥避光避湿处。胺类盐酸盐通常具有吸湿性,因此应尽量减少暴露于空气中。使用前请务必查阅阿拉丁科学提供的产品专用安全数据表(SDS),了解详细的危害分类、急救措施和处置指南。
Boc基团对强酸敏感,且在较高温度下长时间放置会发生分解;除非有意脱除Boc保护,否则应避免在强酸性条件下储存或溶解该化合物。
订购与质量信息
顺式-5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐由阿拉丁科学以货号 C174710 供应。建议研究人员通过直接联系阿拉丁科学或访问阿拉丁网站上的产品页面,确认当前库存情况、纯度规格、分析证书(CoA)和价格。
下单前,请确认所需纯度等级、包装规格和立体化学规格(顺式)符合您的实验要求。如需大批量或定制规格,请联系阿拉丁科学销售团队获取定制报价。
常见问题
顺式和反式5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐有何区别?
顺式和反式标注指的是双环骨架环连接处的相对立体化学。在顺式异构体中,胺取代基和Boc氮朝向环系的同一面,提供特定的三维几何构型,影响分子与生物靶标的相互作用。反式异构体将这两个基团置于相对两面,产生不同的空间排列和潜在不同的结合特性。在药物化学应用中,异构体的选择至关重要,必须与靶标结合位点的几何构型相匹配。
如何脱除顺式-5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐上的Boc保护基?
Boc基团通常在温和酸性条件下脱除。常用方法包括在室温下用二氯甲烷中的三氟乙酸(TFA,通常20–50% v/v)处理,或用二氧六环中的4 M盐酸处理。这些条件可裂解Boc氨基甲酸酯,释放游离胺(以TFA盐或盐酸盐形式)和异丁烯气体。反应通常在室温下30–60分钟内完成。C-5位的伯胺已以盐酸盐形式存在,不受上述脱保护条件影响。请根据您的具体底物和后续合成步骤优化反应条件。
顺式-5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐溶于哪些溶剂?
作为含Boc基团的双环胺盐酸盐,该化合物通常预期在极性质子溶剂(如水和甲醇)以及极性非质子溶剂(如二甲基亚砜DMSO和二甲基甲酰胺DMF)中具有良好溶解性。在极性较低的溶剂(如二氯甲烷)中溶解度可能适中。具体溶解度数据应参照产品分析证书确认,或在您的实验条件下进行溶解度测试,因为溶解度会随浓度、温度和pH变化而不同。
应如何储存顺式-5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐以最大限度延长货架寿命?
将化合物密封于原包装容器中,存放于阴凉、干燥、避光的环境中。胺类盐酸盐通常具有吸湿性;通过适当措施(如在惰性气体氮气或氩气保护下储存或使用干燥剂)减少与大气湿气的接触。避免在酸性条件或较高温度下储存,以防意外脱除Boc保护基。请务必参阅阿拉丁科学提供的SDS和CoA,了解产品专用储存条件和建议货架寿命。
顺式-5-氨基-2-Boc-六氢环戊并[c]吡咯盐酸盐能否直接用于酰胺偶联反应?
是的,C-5位的伯胺(以盐酸盐形式存在)在用适当碱(如三乙胺或二异丙基乙基胺DIPEA)中和盐后,可参与酰胺偶联反应。随后可使用标准酰胺偶联试剂(如HATU、EDC/HOBt或DIC/HOBt)与羧酸伴侣反应。在上述温和条件下,吡咯烷氮上的Boc基团保持完整,从而实现对伯胺的选择性官能化,同时为后续合成步骤保留Boc保护基手柄。
参考文献
- Greene, T. W.; Wuts, P. G. M. Protective Groups in Organic Synthesis, 4th ed.; Wiley-Interscience: New York, 2007. (General reference for Boc protecting group chemistry.)
- Lovering, F.; Bikker, J.; Humblet, C. Escape from Flatland: Increasing Saturation as an Approach to Improving Clinical Success. J. Med. Chem. 2009, 52, 6752–6756. (Conceptual basis for sp³-rich bicyclic scaffolds in drug discovery.) doi:10.1021/jm901241e
- Aladdin Scientific. Product Page: cis-5-amino-2-boc-hexahydro-cyclopenta[c]pyrrole hydrochloride, SKU C174710. (Supplier product information.)
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