普鲁卡因胺标记试剂盒-氰基硼氢化钠-24次
普鲁卡因胺标记试剂盒-氰基硼氢化钠-24次
产品描述
应用:用于用普鲁卡因胺 (PROC) 标记游离聚糖。
描述:该试剂盒包含通过还原胺化反应将染料与聚糖的游离还原端缀合的试剂。
染料特性:无质量染料 = 235.33。
荧光, λex = 310 nm, λem = 370 nm。

样品数量每组标记试剂 12 个单独的分析样品(共 24 个样品用于成套工具)
每个样品的样品量从 25 pmol 到 25 nmol 聚糖。
合适的样品可以标记任何带有游离还原末端的纯化聚糖。
结构完整性唾液酸、岩藻糖、硫酸盐或磷酸盐没有可检测到(< 2 摩尔%)的损失。
标记选择性本质上是化学计量标记。
贮存:在室温下避光保存。远离热源、光源和湿气。所提供的试剂至少可稳定保存两年。
船运:该产品可以在环境温度下运输。
处理:确保使用的任何玻璃、塑料制品或溶剂不含糖苷酶和环境碳水化合物。在所有样品处理程序中使用 无粉手套,并避免被环境碳水化合物污染。所有涉及标记试剂的步骤都必须在干燥的环境中使用干燥的玻璃器皿和塑料器皿进行。一旦单独的试剂瓶打 开,其内容物应立即使用,过量的然后根据当地安全规则丢弃。
安全:仅供研究使用。不用于人类或药物使用
套件内容
每个试剂盒包含两个标记反应组。每个标记反应组由以下各一个小瓶组成:
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需要额外的试剂和设备
纯净水
加热块、烤箱或类似的干式加热器(不能使用水浴)设置为 65°C
离心蒸发器(例如 Savant、Heto 或类似产品)
反应瓶(例如聚丙烯微量离心瓶)
注意:如果进行可选的标记后样品清理,则需要更多消耗品(请参阅样品清理部分)
标签的时间线
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标注方法
1 纯化聚糖
在标记聚糖之前,最好从样品中去除非碳水化合物污染物,例如蛋白质/肽材料、盐和去污剂。这可以使用 EB10 滤芯来实现或蛋白结合膜。使用 CEX 小柱可实现 O‑聚糖的净化。
2 将样品转移到反应瓶中

该试剂盒设计用于每次反应最多标记 25 nmol 的聚糖。使用单一的纯聚糖,每个反应低至 5 pmoles 可以在随后的 HPLC 和MS 分析中被标记和检测。
合适的反应瓶包括小型聚丙烯微量离心瓶、PCR 工作瓶或 96 如果进行更高通量的样品分析,请使用 PCR 板。
3干燥样品

干燥样品。
样品的干燥应使用离心蒸发器进行。如果无法做到这一点,则可以谨慎使用冷冻干燥(冻干)(特别是确保样品在小瓶底部干燥成小而致密的物质)。不要将样品置于高温 (>28°C) 或极端 pH 条件下,因为这些条件可能导致唾液酸的酸催化损失(高温、低 pH)或聚糖还原末端差向异构化(在高 pH 条件下)。
4准备染料溶液

将 150 µL 试剂盒成分 LT‑ACETIC DMSO‑01(30% 乙酸的 DMSO 溶液)添加到一瓶普鲁卡因胺染料中,并通过移液器操作混合直到染料完全溶解。有时需要加热(30‑60°C)来帮助溶解染料。
向溶解的染料中加入 150 µL 水。溶液并通过移液器动作混合。
将 300µL 溶解的染料溶液转移到一瓶还原剂 (LT CYANOB‑05) 中,并通过移液器进行混合,直到还原剂溶解。
有时需要加热(30‑60°C)来帮助溶解还原剂。
5.向样品中添加标记试剂

在每个糖链样品中加入20 µL 标记试剂,盖上小瓶或PCR 板,彻底混合并短暂离心(5‑10 秒)以确保标记溶液在小瓶底部。
6孵化

将反应瓶放入设置为 65°C 的烘箱或加热块中并孵育 1 小时。我们建议在孵化步骤中使用烤箱。烘箱为反应瓶提供全方位的热量。
样品必须完全溶解在标记溶液中才能有效标记。溶解开始孵育15分钟后,样品可以涡旋振荡,然后继续。
7冷却和离心

孵育期结束后,将样品从烘箱或加热块中取出,让它们冷却至室温,然后短暂离心反应瓶以确保样品位于瓶底而不是盖子中。

对于大多数应用,在通过 HPLC、MS 或 LC‑MS 分析之前执行标记后样品净化以去除非聚糖材料,例如过量的染料和其他标记试剂。
贴标后清理的好处
去除可能干扰HPLC 和LC‑MS 样品分析的游离染料和化学物质。
延长 HPLC 色谱柱的使用寿命。
更小的聚糖,例如接近 HPLC 梯度起点的 O‑link 将被检测到,而无需游离染料的干扰。
可以使用全系列的 HPLC 色谱柱。
HPLC 色谱柱的样品容量问题不太可能发生。
使用 S 小柱 或 Procainamide Clean‑up Plate可以实现对普鲁卡因胺 (PROC) 标记的 N‑聚糖的标记后样品净化,如果执行更高通量样品分析。
可以使用S 小柱对PROC 标记的 O‑聚糖进行标记后样品净化。
普鲁卡因酰胺标记的聚糖分析
普鲁卡因酰胺标记的聚糖可以通过多种不同的分析方法进行研究,包括 (U)HPLC、ESI 质谱和 LC‑ESI‑MS。
示例 UHPLC 条件 – 条件因仪器而异。检查这些条件是否适合你的设备。
样品在与起始梯度相当的溶剂中配制,例如 76% 乙腈。
色谱柱:Waters BEH Glycan 色谱柱 15 cm x 2.1 mm。
柱温:40°C
荧光检测器设置:激发波长:310 nm,发射波长:370 nm。
溶剂 A:50 mM 甲酸铵缓冲液 pH 4.4
溶剂 B:乙腈

糖谱未知样品的长 UHPLC 梯度并且聚糖可能很大和/或高度唾液酸化
该 UHPLC 梯度已被证明可用于分离从人 IgG 和促红细胞生成素中释放的 N‑聚糖,然后进行普鲁卡因胺标记和净化。一旦确定了样品中存在的聚糖范围,就可以优化 UHPLC 梯度并显着缩短(在某些 UHPLC 仪器上缩短至 15 分钟)。
对普鲁卡因酰胺标记的 N‑聚糖进行 LC‑MS 分析,用户可以同时获得分离的 N‑聚糖的荧光色谱图和 ESI‑MS 光谱,它们可以结合起来提供更大的整体存在的 N‑聚糖结构的图片。 MS 数据可用于将 m/z 质量分配给荧光色谱图中的每个峰,从而以单糖组合物的形式为每个峰提供可能的结构标识。通过 ESI‑MS 分析,可以确定荧光色谱图中的单峰具有多个聚糖结构。
从人 IgG 聚糖释放的 N‑聚糖的普鲁卡因酰胺标记和纯化程序的重复性(精密度)显示低 RSD 值(对于相对 % 面积 >0.7 % 的峰,RSD <5%)。

净化后的普鲁卡因胺标记的人 IgG 聚糖

净化后的普鲁卡因胺标记的促红细胞生成素聚糖
还原胺化反应
1.席夫碱基阵型。
这需要具有自由还原末端的聚糖,该末端在闭环(环状)和开环(无环)形式之间达到平衡。染料的伯氨基对无环还原 末端残基的羰基碳进行亲核攻击,形成部分稳定的席夫碱。
2. 减少席夫碱。
席夫碱基亚胺基团被化学还原以产生稳定的标记聚糖。

通过还原胺化用普鲁卡因胺 (PROC) 标记聚糖
参考文献
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3.Pabst M, Kolarich D, Pöltl G, Dalik T, Lubec G, Hofinger A, Altmann F. Comparison of fluorescent labeling of oligosaccharides and introduction of new post-labeling purification methods. Anal biochemistry. 2009;384(2):263‑73. doi: 10.1016/j.ab.2008.09.041.
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