重组人ATXN7L3蛋白:操作与使用实验方案
重组人ATXN7L3蛋白:操作与使用实验方案
Recombinant Human ATXN7L3 Protein 是SAGA去泛素化酶(DUB)模块的关键调控亚基,能够促进USP22介导的组蛋白H2B单泛素化修饰的去除,是染色质生物学与表观遗传学研究中的重要工具蛋白。
- 产品名称
- 重组人ATXN7L3蛋白
- 货号
- rp366613
- 蛋白功能
- SAGA DUB模块的调控亚基;激活USP22对组蛋白H2B的去泛素化酶活性
- 物种来源
- 人(智人)
- 主要研究应用
- 染色质生物学、表观遗传学、去泛素化酶复合物重组分析
- 储存建议
- 避免反复冻融;长期储存请分装后置于-80°C
ATXN7L3的研究背景与生物学意义
共济失调蛋白7样蛋白3(ATXN7L3)是Spt-Ada-Gcn5乙酰转移酶(SAGA)转录共激活复合物中去泛素化酶(DUB)模块的非催化但功能上不可或缺的亚基。SAGA DUB模块从酵母到人类高度保守,负责去除组蛋白H2B第120位赖氨酸处的单泛素化修饰(H2Bub1),该修饰与转录延伸、DNA损伤应答及基因调控密切相关。
ATXN7L3作为激活性支架蛋白,在DUB模块中将USP22(催化性去泛素化酶)与ENY2桥接,显著促进USP22的酶活性。ATXN7L3缺失会导致H2Bub1的全局性积累,凸显了其在维持组蛋白泛素化稳态中的核心作用。除经典SAGA复合物外,ATXN7L3还被发现参与其他DUB复合物,进一步拓展了其在转录和染色质重塑调控中的重要性。
重组人ATXN7L3蛋白(rp366613)为研究人员提供了一种定义明确、即用型的工具蛋白,用于在体外研究上述分子机制,实现DUB模块的生化重组及ATXN7L3相互作用的功能性解析。
复溶与储存方案
所需材料:无菌超纯水或适当的水性缓冲液(如20–50 mM Tris-HCl,pH 7.4–8.0,含150 mM NaCl及10%甘油)、低蛋白结合微量离心管、干冰或液氮(用于速冻)。
复溶步骤:
- 开瓶前,将冻干瓶(如适用)以低速短暂离心,使瓶底粉末集中。
- 沿瓶壁缓慢加入推荐体积的无菌复溶缓冲液,避免产生气泡。轻轻旋转或用移液器吹打溶解,切勿剧烈涡旋。
- 在室温下平衡5–10分钟,期间间歇轻柔混匀,直至完全溶解。
- 将复溶液以10,000 × g短暂离心1分钟,去除不溶性聚集物。
- 目视检查溶解情况;溶液应呈透明至轻微乳光状。
储存说明:
- 短期使用(1周内):在含载体蛋白(如0.1% BSA)和蛋白酶抑制剂混合物的适当稳定缓冲液中,于4°C保存。
- 长期储存:制备单次使用分装液,避免反复冻融,于-80°C保存。每次冻融循环均可导致蛋白活性和完整性的部分损失。
- 勿储存于-20°C,无霜冰箱的温度循环可能对蛋白稳定性造成不利影响。
注意:产品说明书(absea#PP-2190)中提供的具体复溶缓冲液组成、浓度及储存条件优先于一般性指导原则,使用前请务必查阅说明书。
质量控制与纯度验证
在用于灵敏的生化实验前,建议采用以下标准流程验证重组人ATXN7L3蛋白的质量与完整性:
SDS-PAGE分析:取少量样品(1–2 µg)在还原条件下进行变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。蛋白条带应出现在与ATXN7L3对应的预期分子量处。考马斯亮蓝或银染可评估纯度及是否存在降解产物或杂质。
Western Blot确认:将电泳分离的蛋白转印至PVDF或硝酸纤维素膜,用经验证的抗ATXN7L3抗体进行检测,以确认蛋白身份。若需记录批次间一致性,此步骤尤为重要。
蛋白浓度测定:采用BCA法或Bradford法测定蛋白浓度。使用与蛋白样品相同缓冲液配制的BSA标准品,以减少基质效应。如已知ATXN7L3的消光系数,也可使用分光光度法(A280)进行测定。
功能活性评估:在活性数据至关重要的情况下,可将ATXN7L3与USP22和ENY2共同加入体外DUB模块重组分析体系,然后用荧光底物泛素或含H2Bub1的核小体底物测定去泛素化酶活性。与参考标准品对比可确保批次间一致性。
请参阅产品随附的分析证书(CoA,absea#PP-2190),获取批次特异性纯度和质量控制数据。
实验应用
重组人ATXN7L3蛋白(rp366613)适用于多种生化及无细胞研究应用:
1. 体外DUB模块重组:ATXN7L3是在体外组装功能性SAGA DUB亚复合物的必要激活组分。与重组USP22和ENY2联合使用时,重组三聚体复合物表现出强大的去泛素化酶活性,可用于研究H2Bub1去除的分子机制及ATXN7L3的调控作用。
2. 蛋白质-蛋白质相互作用研究:将ATXN7L3作为诱饵或猎物蛋白用于pull-down实验、共免疫沉淀(co-IP)或表面等离子共振(SPR)测量,以绘制其与USP22、ENY2及其他潜在结合伙伴的相互作用图谱。带GST或His标签的版本可便于亲和捕获。
3. 结构生物学:重组ATXN7L3可作为冷冻电镜(cryo-EM)或X射线晶体学研究的组分,用于解析SAGA DUB模块的构象及其激活机制的分子基础。
4. 生化抑制剂筛选:该蛋白可整合至高通量或靶向筛选平台,用于鉴定ATXN7L3–USP22相互作用的小分子抑制剂或调节剂,鉴于SAGA复合物失调与癌症生物学的相关性,此方向具有潜在的应用价值。
5. 抗体验证:重组ATXN7L3可作为阳性对照抗原,用于验证抗ATXN7L3抗体在Western blot、ELISA或免疫荧光应用中的特异性。
常见问题排查
以下排查指导针对使用ATXN7L3等重组蛋白时常见的问题:
问题:复溶时蛋白沉淀或聚集
可能原因:复溶缓冲液离子强度或pH不适;蛋白复溶速度过快或浓度过高。
解决方案:确保缓冲液组成符合说明书推荐配方;以较低浓度复溶后按需稀释;在缓冲液中加入温和去垢剂(如0.01–0.05% Tween-20)或甘油(5–10%)以提高溶解性;在冰上进行复溶操作。
问题:DUB重组实验中去泛素化酶活性低或缺失
可能原因:蛋白经历多次冻融循环;实验缓冲液不兼容;ATXN7L3本身不具有催化活性,需要与USP22和ENY2共同作用。
解决方案:使用新鲜解冻的单次使用分装液;确认重组USP22和ENY2同时存在且具有活性;验证实验缓冲液pH和盐浓度在最佳范围内;设置经验证的活性复合物阳性对照。
问题:SDS-PAGE上出现多条带或意外条带
可能原因:因冻融损伤或蛋白酶污染导致部分蛋白水解降解;翻译后修饰。
解决方案:在工作缓冲液中始终加入蛋白酶抑制剂混合物;在冰上操作;参照产品说明书和CoA确认预期分子量;如意外条带持续存在,请联系Aladdin Scientific技术支持。
问题:实验间结果不一致
可能原因:蛋白浓度测定不准确;稀释过程中移液误差;不同分装液储存时间不同。
解决方案:在实验间标准化蛋白定量方法;每次实验从单一分装液配制新鲜工作稀释液;记录批号和分装液解冻日期以便追溯。
常见问题
ATXN7L3在SAGA复合物中的生物学功能是什么?
ATXN7L3是SAGA DUB模块的非催化调控亚基,直接激活USP22(负责去除组蛋白H2B K120单泛素化修饰的催化性去泛素化酶)。作为桥接USP22和ENY2的激活性支架蛋白,ATXN7L3对于H2Bub1的正常调控、转录控制及DNA损伤应答至关重要。缺乏ATXN7L3将导致H2Bub1水平在全基因组范围内积累。
重组人ATXN7L3蛋白应如何储存以保持稳定性?
为确保最佳稳定性,应将复溶后的蛋白制备成单次使用分装液,并于-80°C长期保存。避免反复冻融,每次冻融循环均会逐渐降低蛋白活性和完整性。若在一周内短期使用,可在含0.1% BSA等载体蛋白的稳定缓冲液中于4°C保存。储存前请务必查阅产品说明书(absea#PP-2190)中的批次特异性储存建议。
重组人ATXN7L3蛋白能否单独用于测定去泛素化酶活性?
不能。ATXN7L3本身不具有内在的去泛素化酶催化活性。它作为激活性调控亚基,显著促进USP22的去泛素化酶活性。若要在体外测定DUB活性,必须将ATXN7L3与重组USP22(催化亚基)和ENY2联合使用,以重组功能性三聚体DUB模块。确保三种组分同时存在、均具有活性,且处于适当的化学计量比,以获得可靠的活性测定结果。
该重组蛋白的典型质量控制标准是什么?
质量控制通常包括:SDS-PAGE确认表观分子量并评估纯度;使用经验证的抗ATXN7L3抗体进行Western blot确认蛋白身份;以及通过BCA法或Bradford法测定蛋白浓度。每批产品随附的分析证书(CoA)中提供批次特异性纯度数值和质量控制数据。对于功能性应用,还建议在重组DUB分析体系中进行活性确认。
重组人ATXN7L3蛋白是否适用于冷冻电镜等结构生物学研究?
重组人ATXN7L3蛋白可作为结构生物学研究(包括冷冻电镜和X射线晶体学)的组分,尤其是与USP22和ENY2组装成三聚体DUB模块时。其是否适用于结构研究取决于蛋白纯度、均一性及无聚集性。开展结构研究的研究人员除标准SDS-PAGE质控外,还应通过动态光散射(DLS)或尺寸排除色谱(SEC)验证上述参数。
参考文献
- Zhao Y et al. A TFTC/STAGA module mediates histone H2A and H2B deubiquitination, coactivates nuclear receptors, and counteracts heterochromatin silencing. Molecular Cell, 2008.
- Lang G et al. Role of the chromatin-associated factor Sgf73/ATXN7 in DUB complex assembly and regulation. EMBO Journal, 2011.
- Samara NL et al. Structural insights into the assembly and function of the SAGA deubiquitinating module. Science, 2010.
- Atanassov BS et al. ATXN7L3 and ENY2 coordinate activity of multiple H2B deubiquitinases important for cellular proliferation and tumor growth. Molecular Cell, 2016.
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
危险品化学品经营许可证(带存储)