重组人CENPB蛋白:研究指南与应用
重组人CENPB蛋白:研究指南与应用
Recombinant Human CENPB Protein 是一种关键的着丝粒DNA结合蛋白,对人类细胞中动粒的正确组装、染色体分离保真性及着丝粒特性的维持至关重要。
- 产品名称
- 重组人CENPB蛋白
- 货号
- rp365905
- 基因名称
- CENPB(着丝粒蛋白B)
- 蛋白功能
- 结合α卫星DNA中17 bp的CENP-B box基序;对着丝粒形成和动粒组装至关重要
- 表达系统
- 重组表达(具体宿主系统请参阅供应商文件)
- 主要应用
- EMSA、染色质结合实验、蛋白质相互作用研究、结构生物学
CENPB的生物学背景
着丝粒蛋白B(CENPB)是一种在哺乳动物中进化保守的组成型着丝粒相关蛋白,由CENPB基因编码,是内动粒板最具特征的组分之一。CENPB可识别并结合一段特定的17 bp回文序列,即CENP-B box,该序列存在于人类着丝粒的α卫星重复DNA阵列中。
CENPB具有双重功能:一方面通过促进CENP-A(着丝粒特异性组蛋白H3变体)的加载,参与着丝粒染色质的从头建立;另一方面在细胞分裂过程中维持着丝粒特性。尽管CENPB在Y染色体着丝粒上缺失(与Y染色体缺乏CENP-B box一致),但它对常染色体和X染色体的着丝粒功能不可或缺。
用于研究目的的重组人CENPB蛋白可在细胞外对上述功能进行直接的生化分析,是体外研究的重要试剂。
蛋白质结构与关键结构域
人类CENPB分子量约为80 kDa,包含多个功能重要的结构域:
- N端DNA结合域(DBD):具有螺旋-转角-螺旋(HTH)基序,负责特异性识别α卫星DNA中的CENP-B box,是该蛋白研究最为深入的区域。
- 二聚化结构域(C端):CENPB通过其C端区域自我聚合形成同型二聚体,可同时结合两个CENP-B box序列,从而压缩着丝粒染色质。
- 中央连接区:连接DNA结合域与二聚化结构域,可能参与与其他着丝粒蛋白(如CENP-A核小体和CENP-C)的相互作用。
了解CENPB的结构域架构对于设计使用重组蛋白的体外实验至关重要,尤其在结构研究或基于截短体的功能分析中。
研究应用
重组人CENPB蛋白(rp365905)适用于多种体外和生化研究应用:
- 电泳迁移率变动实验(EMSA):研究CENPB与含CENP-B box寡核苷酸或α卫星DNA底物的特异性结合,这是重组蛋白最常见的应用之一。
- 染色质重组与pull-down实验:评估CENPB与重组CENP-A核小体阵列的相互作用,以研究着丝粒染色质的组织方式。
- 蛋白质-蛋白质相互作用研究:利用共免疫沉淀(Co-IP)、表面等离子共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC)绘制与CENP-C、CENP-A等内动粒组分的相互作用图谱。
- 结构生物学:可作为X射线晶体学或冷冻电子显微镜(cryo-EM)研究CENPB-DNA复合物的底物。
- 抗体生产与验证:用作免疫原或阳性对照抗原,用于CENPB特异性抗体的开发和基于ELISA的验证。
- 药物及小分子筛选:评估干扰CENPB-DNA或CENPB-蛋白相互作用的抑制剂,适用于染色体不稳定性相关研究。
操作、储存与复溶规程
妥善操作重组人CENPB蛋白对于维持其活性和防止聚集至关重要。以下为通用指南,具体批次信息请以产品说明书(absea#PP-12357)为准:
- 收货时:立即检查货物状态。按说明书要求储存蛋白——通常长期储存于−70 °C或−80 °C。如预期需多次冻融,请勿储存于−20 °C。
- 复溶:若为冻干粉,用无菌超纯水或供应商推荐缓冲液复溶。开盖前短暂离心小瓶。加入复溶缓冲液前,先将小瓶平衡至室温。
- 分装:复溶后立即制备单次用量的分装液,以减少冻融次数——反复冻融可导致不可逆聚集和DNA结合活性丧失。
- 工作浓度:针对每种实验类型进行实验确定。典型EMSA反应中CENPB用量为纳摩尔浓度级别;建议通过预实验滴定验证最佳范围。
- 注意避免:反复冻融、在4 °C长时间储存(>48小时)以及接触与下游实验不相容的去垢剂。
- 载体蛋白:若蛋白浓度极低,可考虑添加0.1% BSA作为载体蛋白,防止蛋白吸附于管壁。
注意:具体缓冲液组成、浓度、纯度级别和储存条件,请以阿拉丁官方rp365905产品说明书为准。
质量注意事项与实验技巧
在使用重组人CENPB蛋白时,为获得可重复、可靠的结果,请注意以下事项:
- 纯度验证:在关键实验前通过SDS-PAGE确认蛋白纯度。在预期分子量(~80 kDa,或所提供特定构建体的大小)处出现单一主带,说明蛋白完整性良好。
- 活性确认:如条件允许,在高价值实验前用已验证的CENP-B box寡核苷酸进行预实验EMSA,以确认每批新货的DNA结合活性。
- 缓冲液相容性:CENPB的DNA结合活性可能对盐浓度和pH值敏感。建议进行盐浓度梯度实验(通常为50–200 mM NaCl或KCl),以确定特定实验的最佳结合条件。
- 还原剂:在储存和实验缓冲液中加入温和还原剂,如DTT(1–5 mM)或TCEP(0.5–1 mM),以防止半胱氨酸残基的氧化聚集。
- 批间一致性:更换产品批次时,应重新验证实验条件,因为重组构建体翻译后修饰或截短体的细微差异可能影响活性。
常见问题
CENPB的主要功能是什么?重组蛋白为何对研究有用?
CENPB是一种着丝粒特异性DNA结合蛋白,可识别α卫星DNA中17 bp的CENP-B box,促进动粒组装和着丝粒特性维持。重组蛋白可实现受控的体外实验——如EMSA、pull-down及结构研究——这些实验难以通过从细胞中分离的内源性蛋白来完成。
如何储存重组人CENPB蛋白以维持其活性?
长期储存时,请将蛋白分装为单次用量,置于−70 °C至−80 °C保存,以避免反复冻融。储存缓冲液中应加入DTT或TCEP等温和还原剂,防止氧化聚集。具体批次建议请参阅产品说明书(rp365905)。
重组人CENPB蛋白最常用于哪些实验?
最常见的应用包括:用于DNA结合研究的电泳迁移率变动实验(EMSA)、用于蛋白质-蛋白质相互作用图谱绘制的共免疫沉淀和pull-down实验、染色质重组实验,以及X射线晶体学和冷冻电镜等结构生物学技术。此外,也用作抗体验证的阳性对照抗原。
CENPB是否与所有人类着丝粒结合?
不是。CENPB仅与含有CENP-B box序列的着丝粒结合,该序列位于α卫星DNA中。人类Y染色体着丝粒缺乏CENP-B box序列,因此CENPB不与其结合。在设计涉及性染色体生物学或Y染色体衍生构建体的实验时,这一点需特别注意。
在下游实验前,如何确认重组CENPB蛋白具有活性?
使用含有已验证CENP-B box序列的荧光标记或放射性标记寡核苷酸进行预实验EMSA。确认蛋白质-DNA复合物形成的凝胶迁移带表明蛋白具有活性。在关键实验前,还应进行SDS-PAGE分析,以确认纯度和预期分子量。
参考文献
- Masumoto H, Masukata H, Muro Y, Nozaki N, Okazaki T. A human centromere antigen (CENP-B) interacts with a short specific sequence in alphoid DNA, a human centromeric satellite. J Cell Biol. 1989;109(5):1963–1973. PMID:2808530
- Muro Y, Masumoto H, Yoda K, Nozaki N, Ohashi M, Okazaki T. Centromere protein B assembles human centromeric alpha-satellite DNA at the 17-bp sequence, CENP-B box. J Cell Biol. 1992;116(3):585–596. PMID:1730768
- Fachinetti D, Han JS, McMahon MA, et al. DNA Sequence-Specific Binding of CENP-B Enhances the Fidelity of Human Centromere Function. Dev Cell. 2015;33(3):314–327. doi:10.1016/j.devcel.2015.03.020
- Aladdin Scientific. Recombinant Human CENPB Protein, SKU rp365905. Product Datasheet (absea#PP-12357). Aladdin Scientific.
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
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