肝素二糖I-S 钠盐(α-ΔUA-2S-[1→4]-GlcNS-6S)

CAS: 136098-10-7 货号: H477667 分子式: C12H15NNa4O19S3 分子量: 665.4 PubChem CID: 11227643
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级别和纯度: 硫酸化肝素片段
别名
肝素二糖IS四钠盐
储存条件
-20°C储存,充氩
运输条件
超低温运输
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规格
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文献证明

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概述

肝素二糖I-S钠盐是肝素的一个特定组分,肝素是一种高度硫酸化的糖胺聚糖,由重复的二糖单位组成。这种特定的二糖在生化研究中被广泛用于研究肝素的结构-活性关系。由于其结构均匀,它可作为研究肝素与各种蛋白质(包括生长因子、酶和肝素结合蛋白)之间相互作用的模型化合物。在抗凝机制研究中,肝素二糖I-S钠盐为抑制凝血因子所需的最小结构要求提供了见解。此外,它还被用于研究肝素和硫酸乙酰肝素的生物合成和酶解过程,因为了解这些过程对于阐明这些生物聚合物在生理和病理条件下的作用至关重要。该化合物的钠盐形式确保了增强的溶解度,使其适用于一系列实验条件。


规格

别名
肝素二糖IS四钠盐
英文别名
Heparin disaccharide I-S tetrasodium
规格或纯度
硫酸化肝素片段
英文名称
Heparin disaccharide I-S sodium salt(α-ΔUA-2S-[1→4]-GlcNS-6S)
生化机理
各种肝素酶消化肝素和硫酸乙酰肝素的产物
储存条件
-20°C储存,充氩
运输条件
超低温运输
名称和识别符
PubChem SID
分子类型
低聚糖
IUPAC Name
tetrasodium;(2R,3R,4S)-2-[(2R,3S,4R,5R)-4,6-dihydroxy-5-(sulfonatoamino)-2-(sulfonatooxymethyl)oxan-3-yl]oxy-4-hydroxy-3-sulfonatooxy-3,4-dihydro-2H-pyran-6-carboxylate
INCHI
1S/C12H19NO19S3.4Na/c14-3-1-4(10(16)17)30-12(8(3)32-35(25,26)27)31-9-5(2-28-34(22,23)24)29-11(18)6(7(9)15)13-33(19,20)21;;;;/h1,3,5-9,11-15,18H,2H2,(H,16,17)(H,19,20,21)(H,22,23,24)(H,25,26,27);;;;/q;4*+1/p-4/t3-,5+,6+,7+,8+,9+,11?,12-;;;;/m0..../s1
InChi Key
RTDJNTXPZMQNEV-LXFQAIKPSA-J
Smiles
C1=C(OC(C(C1O)OS(=O)(=O)[O-])OC2C(OC(C(C2O)NS(=O)(=O)[O-])O)COS(=O)(=O)[O-])C(=O)[O-].[Na+].[Na+].[Na+].[Na+]
Isomeric SMILES
C1=C(O[C@H]([C@@H]([C@H]1O)OS(=O)(=O)[O-])O[C@@H]2[C@H](OC([C@@H]([C@H]2O)NS(=O)(=O)[O-])O)COS(=O)(=O)[O-])C(=O)[O-].[Na+].[Na+].[Na+].[Na+]
PubChem CID
分子量
665.4

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系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机氧化合物
类(Class) 有机氧化合物
亚类(Subclass) 碳水化合物和碳水化合物结合物
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 双糖
直接上位类(Direct Parent) 双糖硫酸盐
其他上位类(Alternative Parents) 硫酸单酯  硫酸单酰胺  氧烷  烷基硫酸盐  仲醇  羧酸盐  半缩醛  缩醛  氧环化合物  羧酸  一元羧酸及其衍生物  碳氢化合物衍生物  有机氮化合物  羰基化合物  有机光子化合物  有机氧化物  有机钠盐  有机阳离子  
分子骨架(Molecular Framework) 脂肪族杂单环化合物
取代基(Substituents) 乙醛酸 - 羟基苯甲酸酯 - 脂肪族杂单环化合物 - 烷基硝酸酯 - 羰基 - 羧酰胺基 - 羧酸衍生物 - 羧酸盐 - 二糖硫酸酯 - 半缩醛 - 烃衍生物 - 单羧酸或其衍生物 - 有机碱金属盐 - 有机铵盐 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机盐 - 有机钠盐 - 有机磺酰胺 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 氧杂环丁烷 - 醛基 - 磺酸酯 - 硫酰胺 - 硫酸单酰胺 - 硫酸单酯
描述(Description) 该化合物属于有机化合物中的二糖硫酸酯类。这类化合物在单糖单元上携带一个或多个硫酸基团。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





化学和物理性质
敏感性
对湿度敏感
分子量
665.400 g/mol
XLogP3
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
4
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
20
可旋转键计数Rotatable Bond Count
6
精确质量Exact Mass
664.899 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
664.899 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
356.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
39
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
1070.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
7
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
1
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
5
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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批号(Lot Number) 证书类型 货号
H2504762 分析证书 H477667
H2504763 分析证书 H477667
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