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5'-O-phosphonoguanylyl-(3'->5')-guanosine
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为什么选择此级别
,适用于对基线干扰要求严格的色谱和分析工作流程。
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储存与运输
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质量文档
SDS、COA、产品数据表及规格说明书均可下载。可通过批号查询获取批次 COA。
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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
5'-Phosphoguanylyl-(3',5')-guanosine (pGpG) 是通过酶促环鸟苷二磷酸 (c-di-GMP) 降解途径产生的中间分子。5'-Phosphoguanylyl-(3',5')-guanosine 可用于检测核酸的代谢。
规格
英文名称
5'-O-phosphonoguanylyl-(3'->5')-guanosine
名称和识别符
IUPAC Name
[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-4-hydroxy-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate
INCHI
1S/C20H26N10O15P2/c21-19-25-13-7(15(34)27-19)23-3-29(13)17-10(32)9(31)5(43-17)1-42-47(39,40)45-12-6(2-41-46(36,37)38)44-18(11(12)33)30-4-24-8-14(30)26-20(22)28-16(8)35/h3-6,9-12,17-18,31-33H,1-2H2,(H,39,40)(H2,36,37,38)(H3,21,25,27,34)(H3,22,26,28,35)/t5-,6-,9-,10-,11-,12-,17-,18-/m1/s1
InChi Key
ZEHOHLFQOXAZHX-MHARETSRSA-N
Smiles
C1=NC2=C(N1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)O[C@@H]4[C@H](O[C@H]([C@@H]4O)N5C=NC6=C5N=C(NC6=O)N)COP(=O)(O)O)O)O)N=C(NC2=O)N
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高级数据
系统学分类
| 界(kingdom) |
有机化合物 |
| 超类(Superclass) |
核苷、核苷酸及其类似物 |
| 类(Class) |
(3'->5')-二核苷酸及其类似物 |
| 亚类(Subclass) |
(3'->5')-二核苷酸 |
| 中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) |
暂无 |
| 直接上位类(Direct Parent) |
(3'->5')-二核苷酸 |
| 其他上位类(Alternative Parents) |
嘌呤核苷3',5'-二磷酸酯 嘌呤核糖核苷单磷酸 核糖核苷3'-磷酸酯 磷酸戊糖 糖胺 6-氧嘌呤 次黄嘌呤 单糖磷酸酯 氨基嘧啶及其衍生物 磷酸二烷基酯 嘧啶酮类 单烷基磷酸酯 N-取代咪唑 乙烯基酰胺 四氢呋喃 杂芳族化合物 仲醇 氮杂环化合物 氧环化合物 碳氢化合物衍生物 伯胺 有机光子化合物 有机氧化物 |
| 分子骨架(Molecular Framework) |
芳香族杂多环化合物 |
| 取代基(Substituents) |
(3'->5')-二核苷酸 - 6-羰基嘌呤 - 羟基苯甲酸酯 - 烷基磷酸酯 - 氨基酸 - 氨基吡啶 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 吡唑 - 二烷基磷酸酯 - 糖基化合物 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 嘌呤 - 咪唑 - 咪唑哌啶 - 单烷基磷酸酯 - 单糖 - 单糖磷酸酯 - N-羧酰胺基-α-氨基酸或其衍生物 - N-取代咪唑 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机磷酸酯 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 五碳糖磷酸 - 五碳糖-5-磷酸 - 磷酸酯 - 初级胺 - 鸟苷酸 - 嘌呤核糖核苷三磷酸 - 嘌呤核糖核苷二磷酸 - 嘌呤核糖核苷单磷酸 - 嘧啶 - 嘧啶酮 - 核糖核苷酸磷酸酯 - 醛基 - 四氢呋喃 - 乙烯酰胺 |
| 描述(Description) |
该化合物属于有机化合物中的(3'-→5')-二核苷酸类。这类二核苷酸通过(3'-→5')-磷酸二酯键连接两个碱基。 |
| 外部描述符(External Descriptors) |
5'-phospho-(3'->5')-dinucleotide |
三维结构
化学和物理性质
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
10
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
19
可旋转键计数Rotatable Bond Count
10
精确质量Exact Mass
708.105 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
708.105 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
372.000 Ų
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
8
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
溶液计算器
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