5'-O-phosphonoguanylyl-(3'->5')-guanosine

CAS: 33008-99-0 货号: O1240170 分子式: C20H26N10O15P2 分子量: 708.4
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-20°C储存,充氩,干燥
运输条件
超低温运输
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文献证明

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概述

5'-Phosphoguanylyl-(3',5')-guanosine (pGpG) 是通过酶促环鸟苷二磷酸 (c-di-GMP) 降解途径产生的中间分子。5'-Phosphoguanylyl-(3',5')-guanosine 可用于检测核酸的代谢。

规格

英文名称
5'-O-phosphonoguanylyl-(3'->5')-guanosine
储存条件
-20°C储存,充氩,干燥
运输条件
超低温运输
名称和识别符
分子类型
小分子
IUPAC Name
[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-4-hydroxy-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate
INCHI
1S/C20H26N10O15P2/c21-19-25-13-7(15(34)27-19)23-3-29(13)17-10(32)9(31)5(43-17)1-42-47(39,40)45-12-6(2-41-46(36,37)38)44-18(11(12)33)30-4-24-8-14(30)26-20(22)28-16(8)35/h3-6,9-12,17-18,31-33H,1-2H2,(H,39,40)(H2,36,37,38)(H3,21,25,27,34)(H3,22,26,28,35)/t5-,6-,9-,10-,11-,12-,17-,18-/m1/s1
InChi Key
ZEHOHLFQOXAZHX-MHARETSRSA-N
Smiles
C1=NC2=C(N1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)O[C@@H]4[C@H](O[C@H]([C@@H]4O)N5C=NC6=C5N=C(NC6=O)N)COP(=O)(O)O)O)O)N=C(NC2=O)N
分子量
708.4

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高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 核苷、核苷酸及其类似物
类(Class) (3'->5')-二核苷酸及其类似物
亚类(Subclass) (3'->5')-二核苷酸
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) (3'->5')-二核苷酸
其他上位类(Alternative Parents) 嘌呤核苷3',5'-二磷酸酯  嘌呤核糖核苷单磷酸  核糖核苷3'-磷酸酯  磷酸戊糖  糖胺  6-氧嘌呤  次黄嘌呤  单糖磷酸酯  氨基嘧啶及其衍生物  磷酸二烷基酯  嘧啶酮类  单烷基磷酸酯  N-取代咪唑  乙烯基酰胺  四氢呋喃  杂芳族化合物  仲醇  氮杂环化合物  氧环化合物  碳氢化合物衍生物  伯胺  有机光子化合物  有机氧化物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents) (3'->5')-二核苷酸 - 6-羰基嘌呤 - 羟基苯甲酸酯 - 烷基磷酸酯 - 氨基酸 - 氨基吡啶 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 吡唑 - 二烷基磷酸酯 - 糖基化合物 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 嘌呤 - 咪唑 - 咪唑哌啶 - 单烷基磷酸酯 - 单糖 - 单糖磷酸酯 - N-羧酰胺基-α-氨基酸或其衍生物 - N-取代咪唑 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机磷酸酯 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 五碳糖磷酸 - 五碳糖-5-磷酸 - 磷酸酯 - 初级胺 - 鸟苷酸 - 嘌呤核糖核苷三磷酸 - 嘌呤核糖核苷二磷酸 - 嘌呤核糖核苷单磷酸 - 嘧啶 - 嘧啶酮 - 核糖核苷酸磷酸酯 - 醛基 - 四氢呋喃 - 乙烯酰胺
描述(Description) 该化合物属于有机化合物中的(3'-→5')-二核苷酸类。这类二核苷酸通过(3'-→5')-磷酸二酯键连接两个碱基。
外部描述符(External Descriptors) 5'-phospho-(3'->5')-dinucleotide
三维结构
交互式化学结构模型





化学和物理性质
分子量
708.400 g/mol
XLogP3
-7.800
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
10
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
19
可旋转键计数Rotatable Bond Count
10
精确质量Exact Mass
708.105 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
708.105 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
372.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
47
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
1420.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
8
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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