2'-O-MOE-rC

CAS: 251647-54-8 货号: O647358 分子式: C49H58N5O10P 分子量: 908 PubChem CID: 127262586
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概述


2'-O-MOE-rC is a 2'-O-MOE modified nucleoside. 2'-O-MOE-rC can be used for synthesis of DNA.

Form:Solid

规格

英文别名
N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-3-(2-methoxyethoxy)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide | Cytidine, N-benzoyl-5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2'-O-(2-methoxyethyl)-, 3'-[2-cyanoethyl bis(1-methylethyl)phosphoramidite] | (2R,3R,4R,5R)-5-( 展开
英文名称
2'-O-MOE-rC
生化机理
2'-O-MOE-rC 是一种经 2'-O-MOE 修饰的核苷。2'-O-MOE-rC 可用于合成 DNA。
储存条件
避光,-80℃储存
运输条件
特低温运输
名称和识别符
分子类型
小分子
IUPAC Name
N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-3-(2-methoxyethoxy)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
INCHI
1S/C49H58N5O10P/c1-34(2)54(35(3)4)65(62-30-14-28-50)64-44-42(63-47(45(44)60-32-31-57-5)53-29-27-43(52-48(53)56)51-46(55)36-15-10-8-11-16-36)33-61-49(37-17-12-9-13-18-37,38-19-23-40(58-6)24-20-38)39-21-25-41(59-7)26-22-39/h8-13,15-27,29,34-35,42,44-45,47H,14,30-33H2,1-7H3,(H,51,52,55,56)/t42-,44-,45-,47-,65?/m1/s1
InChi Key
IAFVTVZPQIFRAU-NXPFYNPLSA-N
Smiles
CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)OC1C(OC(C1OCCOC)N2C=CC(=NC2=O)NC(=O)C3=CC=CC=C3)COC(C4=CC=CC=C4)(C5=CC=C(C=C5)OC)C6=CC=C(C=C6)OC
Isomeric SMILES
CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@@H]1[C@H](O[C@H]([C@@H]1OCCOC)N2C=CC(=NC2=O)NC(=O)C3=CC=CC=C3)COC(C4=CC=CC=C4)(C5=CC=C(C=C5)OC)C6=CC=C(C=C6)OC
关联CAS
PubChem CID
分子量
908

高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 核苷、核苷酸及其类似物
类(Class) 核苷和核苷酸类似物
亚类(Subclass) 核糖核苷亚磷酰胺
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 核糖核苷亚磷酰胺
其他上位类(Alternative Parents) 苄醚  苯甲酰胺类  苯氧基化合物  甲氧基苯  苯甲酰衍生物  茴香醚  嘧啶酮类  烷基芳基醚  N-酰胺  单糖  咪唑内酰胺类  氢化嘧啶  四氢呋喃  杂芳族化合物  有机碳酸及其衍生物  炔丙基型1,3-偶极有机化合物  氧环化合物  腈类  二烷基醚  羧酸酰胺  甲脒类  氮杂环化合物  有机光子化合物  有机氧化物  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂单环化合物
取代基(Substituents) 1,2-二氢嘧啶 - 芳基醚 - 茴香醚 - 芳香族杂单环化合物 - 氮杂环 - 苯甲酰胺 - 苯基化合物 - 苯甲酸或衍生物 - 苯甲酰 - 苄基醚 - 碳酸衍生物 - 碳腈 - 羧酰胺基 - 羧酰亚胺 - 羧酸衍生物 - 二烷基醚 - 乙醚 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 羟吡啶 - 咪唑内酰胺 - 甲氧基苯 - 单环苯基基团 - 单糖 - N-酰胺基胺 - 氰基化合物 - 有机1,3-双极性化合物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 苯酚醚 - 苯氧基化合物 - 丙炔型1,3-双极性有机化合物 - 嘧啶 - 嘧啶酮 - 核糖核苷磷酰胺酯 - 四氢呋喃
描述(Description) 该化合物属于核糖核苷磷酰胺酯类有机化合物。这类核糖核苷类似物由核碱基(通常为嘌呤或嘧啶)与核糖或脱氧核糖连接而成,其2'、3'或5'位通过磷酰胺酯基团进行保护。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
化学和物理性质
分子量
908.000 g/mol
XLogP3
6.200
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
1
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
12
可旋转键计数Rotatable Bond Count
23
精确质量Exact Mass
907.392 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
907.392 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
163.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
65
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
1550.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
4
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
1
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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溶液计算器

常见问题

本产品应如何储存?
请于?80 °C、避光条件下保存。本品对光敏感,请保存在原始的避光或棕色容器中。
本产品如何运输?
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本产品的 CAS 号、分子式和分子量是多少?
本产品的 CAS 号为 251647-54-8,分子式为 C49H58N5O10P,分子量为 908 g/mol。InChIKey IAFVTVZPQIFRAU-NXPFYNPLSA-N。
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