随机突变试剂盒

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R1372033-20T
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Molecular cloning (3)

基本描述

英文别名 Random Mutation Kit
规格或纯度 BioReagent, 适用于分子生物学, 无菌
稳定性与储存 Store at 2-8℃ short term (3 months). Store at -20℃ long term (12 months). Avoid freeze/thaw cycle.
英文名称 Random Mutagenesis Kit
储存温度 -20°C储存,避免反复冻融
运输条件 超低温冰袋运输
产品介绍

  随机突变是阐述蛋白质结构和功能之间的关系、改进蛋白质性能的重要工具。随机突变试剂盒基于易错PCR(error-prone PCR)技术,利用 Taq DNA polymerase 不具有 3′→5′校对功能的特性,在特定的反应缓冲体系中,向扩增的目的基因中引入随机突变密码子。带有随机突变的扩增产物通过双酶切,连接到表达载体中构建文库,然后转化入表达宿主中,进行蛋白活性筛选。如果经一次突变反应不能获得满意的结果,可采用连续易错 PCR(sequential error-prone PCR)策略,即将一次 PCR 扩增得到的有用突变基因作为下一次 PCR 扩增的模板,连续反复地进行随机诱变,使每一次获得的突变累积而产生更有意义的突变。本试剂盒包含有优化的 2x Random System、 Enhancer 和Sterile Water 三种组分,使用时只需加入适量的 DNA 模板和合成的两条扩增引物,并用水补足体积,即可进行扩增反应,操作简便快速,大大减少了多次加样可能造成的出错和污染机会。2x Random System 含有优化浓度的 Taq DNA polymerase、dNTPs、反应缓冲液和稳定剂,可最大限度地克服常规易错 PCR 技术中,由于 Taq DNA polymerase 本身的偏爱性造成的以 GC 突变为主的缺点,获得相对均衡的突变谱。碱基突变率可通过适量添加 Enhancer、调整模板 DNA 量和改变 PCR 扩增循环数进行控制。

产品组分表

R1372033Component20 TStorage
R1372033A2× Random Mutation PCR Mix500 μl-20℃.Avoid freeze/thaw cycle.
R1372033BMutation Enhancer400 μl-20℃.Avoid freeze/thaw cycle.
R1372033CSterile Water1 ml-20℃.Avoid freeze/thaw cycle.

下表列出以 10 ng 质粒 DNA 为模板,PCR 扩增一条 1 kb DNA 片段(20 个循环)后测序检测得到的突变率结果。需要注意的是,由于不同 DNA 模板的碱基组成不同、长度不一,以及不同引物的扩增效率存在差异,所以即使在相同的 PCR 反应条件下,两组 PCR 产物所得到的突变率也可能不同。因此我们建议根据实验的具体要求,首先进行多个小体系(20 μl)扩增预实验,分别加入不同体积的 Enhancer(如 0 μl、1μl、5 μl、10 μl 等),摸索出符合目标突变率的反应条件

后,再放大扩增体系。其他影响突变率的因素见【注意事项】

以50 µl PCR反应体系为例:

反应条件

1

2

3

4

5

6

Enhancer(μl)

0

1

2.5

5

10

20

突变碱基的个数/1 kb

0~1

0~3

0~4

1~6

3~10

5~18

平均突变碱基数/1 kb

0.3

1.6

2.3

4.1

6.5

10.2

本试剂盒适用于扩增低于 4 kb、GC 含量在 70%以下的目标 DNA 片段。

保存条件

-20℃保存,保质期 12 个月;经常使用,可于 4℃保存,保质期 3 个月。

使用方法

1. 引物设计原则:

1)正、反向扩增引物各一条,长度约 20-45 个碱基,3’端分别与目标突变 DNA 片段的上下游结合;

2)尽量将引物的 GC 含量控制在 40-60%;

3)引物如带有克隆酶切位点,必须添加足够的保护碱基以确保酶切效率;实验证明,引物结合在目标 DNA 片段的酶切位点外侧可提高酶切效率,增加转化的克隆数量。

2. 随机突变反应:

1) PCR 反应体系:向 PCR 薄壁管中依次加入下列试剂

组分

体积

Template Plasmid(1-10ng/μl)

1 μl

2xStarMut Random PCR Mix

25 μl

正向引物(10μM)

1 μl

反向引物(10μM)

1 μl

StarMut Enhancer

0-20 μl

Sterile Water 补足至

50 μl

注:突变率可通过改变起始模板浓度和扩增循环数进行控制。起始模板浓度越高,突变率越低;扩增循环数越高,突变率越高。

2) 混匀后短暂离心,放入 PCR 仪。

3) PCR 循环参数的设置:

流程

温度

时间

循环数

预变性

95℃

2 min

变性

退火

延伸

94℃

50-65℃

72℃

30 s

1 min

1 min/kb

16-25

终延伸

72℃

7 min

3. 取 1-5 μl PCR 产物电泳检测条带浓度和特异性。

4. 剩余的 PCR 产物电泳,切胶回收目标 DNA 片段。

5. 酶切、连接、转化到表达宿主菌株中进行筛选。

注意事项

1. 由于不同 DNA 模板的碱基组成不同、长度不一,以及不同引物的扩增效率存在差异,所以即使在相同的 PCR 反应条件下,两组 PCR 产物所得到的突变率也可能不同。因此我们建议根据具体实验要求,首先进行多个小体系(20 μl)扩增预实验,分别加入不同体积的 StarMut Enhancer(如 0 μl、1 μl、5 μl、10 μl 等),通过测序或活性检测等方法,摸索出符合目标突变率的反应条件后,再放大扩增体系。

2. 起始 DNA 模板的浓度对突变率有很大影响,通常可通过提高或降低 DNA 模板的浓度来调整突变率。鉴于不同型号的分光光 度计检测的 DNA 浓度存在偏差,DNA 模板最好在酶切线性化后,采用凝胶电泳方法,与已知浓度的线性化双链 DNA 或商品化的 DNA marker 进行对比,确定其浓度。

3. 突变反应产物必须进行切胶回收处理,去除 DNA 模板、PCR 产物上结合的 Taq 酶以及其他杂质。常规的乙醇沉淀、硅胶膜(珠)或玻璃奶吸附等方法,均无法去除结合的 Taq 酶,后者可能遮蔽酶切位点,影响克隆效率。

4. 建立随机突变文库通常需要 10-200 ng/μl (相当于 500 ng -10 μg/50 μl 体系)的 PCR 产物。如遇产量不足,可通过下列方法提高产量:

1) 突变率符合需求时,可放大 PCR 体系,或切胶回收 PCR 产物后,采用常规 PCR 反应条件进行扩增;

2) 突变率低于需求时,提高 PCR 扩增循环数,或切胶回收 PCR 产物后,进行第二轮随机突变反应;

3) 重新设计扩增引物;

4) 降低退火温度;

5) 确保模板质量,采用凝胶电泳方法精确定量。

5. 对于带有克隆酶切位点的 DNA 模板,必须在 PCR 反应结束后,使用 DpnI 完全消化清除甲基化的模板,再切胶回收目标DNA 片段。对于非甲基化的质粒(例如从大肠杆菌 JM110 或 SCS110 菌株中提取的质粒),可通过转化 dam+ 的大肠杆菌菌株(如 DH5α、TOP10、JM109、XL1-Blue 等),再抽提获得甲基化的质粒作为 PCR 反应模板。

6. 经过双酶切的克隆载体在插入突变 DNA 片段前,应首先通过自身连接检测,确保极低的自连背景。必要时可采用去磷酸化、切胶回收等方法把自连率降至最低,以免影响后续连接反应。


名称和识别符

分子类型 试剂盒

安全和危险性(GHS)

质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)

C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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批号(Lot Number) 证书类型 日期 货号
ZJ25F0724900 分析证书 25-07-31 R1372033

溶液计算器

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