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| 活性类型 | 活性值-log(M) | 作用机制 | 期刊 | 参考文献(PubMed IDs) |
|---|
Tubastatin A, 组蛋白去乙酰化酶 1 抑制剂；组蛋白去乙酰化酶 6 抑制剂；组蛋白去乙酰化酶 8 抑制剂
有货
为什么选择此级别
Moligand™ 级 ，适用于对基线干扰要求严格的色谱和分析工作流程。
储存与运输
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质量文档
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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
Tubastatin A 是一种有效的，选择性HDAC6抑制剂，无细胞试验中IC50为15 nM，选择性远高于所有其他同工酶(1000倍)除了HDAC8(57倍)。Tubastatin A 可促进自噬并增加凋亡。
Information
Tubastatin A is a potent and selectiveHDAC6inhibitor withIC50of 15 nM in a cell-free assay. It is selective against all the other isozymes (1000-fold) except HDAC8 (57-fold). Tubastatin A promotesautophagyand increasesapoptosis.
Targets
HDAC6 (Cell-free assay) 15 nM
In vitro
Tubastatin A is selective at all isozymes except HDAC8 and maintains over 1000-fold selectivity against all isoforms excluding HDAC8, where it has approximately 57-fold selectivity. Tubastatin A preferentially induces α-tubulin hyperacetylation at 2.5 μM. Slight induction of histone hyperacetylation is seen for Tubastatin A at 10 μM. Tubastatin A displays dose-dependent protection against homocysteic acid-induced neuronal cell death starting at 5 μM with near complete protection at 10 μM. Tubastatin A (10 μM) induces an increase in acetylated-α-tubulin levels and the restoration of primary cilia expression in the cholangiocarcinoma cell lines (18-fold); and the restoration of primary cilia correlated with downregulated Hedgehog (Hh) and MAPK signaling pathways, as well as decreased cell proliferation rates (in average by 50%) and invasion (by 40%). Tubastatin A shows significant inhibition of TNF-α and IL-6 in LPS stimulated human THP-1 macrophages with an IC50 of 272 nM and 712 nM. Tubastatin A inhibits nitric oxide (NO) secretion in murine Raw 264.7 macrophages dose depenndently with an IC50 of 4.2 μM.
In vivo
Tubastatin A reduces the growth of cholangiocarcinoma in vivo. Tubastatin A (10 mg/kg) induces a 6-fold lower mean tumor weights in syngeneic rat orthotopic model of cholangiocarcinoma, and reduction of the ratios of tumor weight to liver weight and body weight (5- and 5.6-fold, respectively), as well as a greater frequency of ciliated cholangiocytes compared with controls (29% vs 1.4%). Tubastatin A significantly decreases the amount of PCNA-positive cells in the treated tumors compared with vehicle controls (34% vs 65%). Tubastat A shows significant inhibition of paw volume at 30 mg/kg i.p. in a Freund\'s complete adjuvant (FCA) induced animal model of inflammation. Tubastat A (30 mg/kg i.p.) significant attenuates clinical scores (~ 70%), and IL-6 expression in paw tissues of collagen induced arthritis DBA1 mouse.
Cell Research(from reference)
Cell lines：Human cholangiocarcinoma cell lines HuCCT-1
Concentrations：~10 μM
Incubation Time：21 days
Application：
Tubastatin A hydrochloride may be used in HDAC6-mediated cell signaling studies.
规格
别名
N-羟基-4-[(1,2,3,4-四氢-2-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-基)甲基]苯甲酰胺 | 图巴他汀A
英文别名
1252003-15-8 | 1252003-15-8 (free base) | Calcium oxide, Reagent Grade | Tubastatin A Trifluoroacetate | BRD-K00627859-001-01-5 | DTXSID701318079 | NCGC00263606-15 | potasium hydroxide | Tubastatin A | Benzamide, N-hydroxy-4-[(1,2,3,4-tetrahydro-2-methyl-
规格或纯度
Moligand™, 10mM in DMSO
英文名称
Tubastatin A
生化机理
Tubastatin A 是一种强效的选择性 HDAC6 抑制剂，在无细胞试验中的 IC50 为 15 nM。它对所有其他同工酶都有选择性（1000 倍），但 HDAC8（57 倍）除外。Tubastatin A 可促进自噬并增加细胞凋亡。
储存条件
-80℃储存
运输条件
特低温运输
作用类型
抑制剂
作用机制
组蛋白去乙酰化酶 1 抑制剂；组蛋白去乙酰化酶 6 抑制剂；组蛋白去乙酰化酶 8 抑制剂
名称和识别符
PubChem SID
分子类型
小分子
IUPAC Name
N-hydroxy-4-[(2-methyl-3,4-dihydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]benzamide
INCHI
1S/C20H21N3O2/c1-22-11-10-19-17(13-22)16-4-2-3-5-18(16)23(19)12-14-6-8-15(9-7-14)20(24)21-25/h2-9,25H,10-13H2,1H3,(H,21,24)
InChi Key
GOVYBPLHWIEHEJ-UHFFFAOYSA-N
Smiles
CN1CCC2=C(C1)C3=CC=CC=C3N2CC4=CC=C(C=C4)C(=O)NO
Isomeric SMILES
CN1CCC2=C(C1)C3=CC=CC=C3N2CC4=CC=C(C=C4)C(=O)NO
关联CAS
PubChem CID
MeSH Entry Terms
tubastatin A
分子量
335.4
技术文档
高级数据
系统学分类
分类树（Taxonomy Tree）
| 界（kingdom) | 有机化合物 |
|---|---|
| 超类（Superclass) | 有机杂环化合物 |
| 类（Class) | 吲哚及其衍生物 |
| 亚类（Subclass） | N-烷基吲哚 |
| 中间层级节点（Intermediate Tree Nodes） | 暂无 |
| 直接上位类(Direct Parent) | N-烷基吲哚 |
| 其他上位类（Alternative Parents） | 3-烷基吲哚 苯甲酸及其衍生物 苯甲酰衍生物 芳烷基胺 取代吡咯 杂芳族化合物 三烷基胺 异羟肟酸 氨基酸及其衍生物 氮杂环化合物 有机光子化合物 有机氧化合物 有机氧化物 碳氢化合物衍生物 |
| 分子骨架（Molecular Framework) | 芳香族杂多环化合物 |
| 取代基（Substituents） | 3-烷基吲哚 - 氨基酸 - 氨基酸或其衍生物 - 芳烷基胺 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 苯基化合物 - 苯甲酸或衍生物 - 苯甲酰 - 羧酸衍生物 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 羟胺酸 - 吲哚 - 单环苯基基团 - N-烷基吲哚 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 吡咯 - 取代吡咯 - 三元脂肪胺 - 三芳基胺 |
| 描述（Description） | 该化合物属于有机化合物中的正烷基吲哚类。这类化合物含有吲哚结构单元，其1位连接烷基链。 |
| 外部描述符（External Descriptors） | 暂无 |
三维结构
交互式化学结构模型
产品属性
| IC50 | HDAC6, IC50: 15 nM |
|---|---|
| ALogP | 3.081 |
| HBD Count | 1 |
| Rotatable Bond | 3 |
关联靶点（人）
HDAC6
Tclin
组蛋白去乙酰化酶6(Histone deacetylase 6)
(59 活性数据)
HDAC1
Tclin
组蛋白去乙酰化酶1(Histone deacetylase 1)
(5 活性数据)
HDAC7
Tclin
组蛋白去乙酰化酶7(Histone deacetylase 7)
(2 活性数据)
HDAC9
Tclin
组蛋白去乙酰化酶9(Histone deacetylase 9)
(2 活性数据)
HDAC2
Tclin
组蛋白去乙酰化酶2(Histone deacetylase 2)
(1 活性数据)
HDAC10
Tclin
组蛋白去乙酰化酶10(Histone deacetylase 10)
(2 活性数据)
HDAC8
Tclin
组蛋白去乙酰化酶8(Histone deacetylase 8)
(23 活性数据)
HDAC5
Tclin
组蛋白去乙酰化酶5(Histone deacetylase 5)
(1 活性数据)
HDAC3
Tclin
组蛋白去乙酰化酶3(Histone deacetylase 3)
(1 活性数据)
ABL1
Tclin
Tyrosine-protein kinase ABL
(18331 活性数据)
AR
Tclin
Androgen Receptor
(11781 活性数据)
GSK3B
Tclin
Glycogen synthase kinase-3 beta
(11785 活性数据)
CSNK1D
Tchem
Casein kinase I delta
(4546 活性数据)
HDAC8
Tclin
Histone deacetylase 8
(4516 活性数据)
HDAC10
Tclin
Histone deacetylase 10
(801 活性数据)
PIK3CD
Tclin
PI3-kinase p110-delta subunit
(6699 活性数据)
HDAC2
Tclin
Histone deacetylase 2
(3971 活性数据)
HDAC3
Tclin
Histone deacetylase 3
(3654 活性数据)
HDAC4
Tclin
Histone deacetylase 4
(2328 活性数据)
CDK2
Tchem
Cyclin-dependent kinase 2
(9050 活性数据)
HDAC9
Tclin
Histone deacetylase 9
(708 活性数据)
HDAC11
Tclin
Histone deacetylase 11
(967 活性数据)
HDAC7
Tclin
Histone deacetylase 7
(1047 活性数据)
AURKA
Tchem
Serine/threonine-protein kinase Aurora-A
(10240 活性数据)
5637
(630 活性数据)
A2780cisR
(133 活性数据)
DU-145
(51482 活性数据)
HL-60
(67320 活性数据)
Huh-7
(12904 活性数据)
K562
(73714 活性数据)
MCF7
(126967 活性数据)
PC-3
(62116 活性数据)
SH-SY5Y
(11521 活性数据)
T-24
(2342 活性数据)
THP-1
(11052 活性数据)
U2OS
(164939 活性数据)
U-937
(7138 活性数据)
A549
(127892 活性数据)
HCT-116
(91556 活性数据)
HEL
(6614 活性数据)
A2780
(11979 活性数据)
HUVEC
(11049 活性数据)
Jurkat
(10389 活性数据)
KB
(17409 活性数据)
KG-1
(867 活性数据)
LNCaP
(8286 活性数据)
MDA-MB-231
(73002 活性数据)
SIRT2
Tchem
NAD-dependent deacetylase sirtuin 2
(3979 活性数据)
CAL-27
(814 活性数据)
BRD4
Tchem
Bromodomain-containing protein 4
(13122 活性数据)
CCND3
Tchem
CDK6/cyclin D3
(897 活性数据)
HDAC3
Tclin
Histone deacetylase 3/Nuclear receptor corepressor 2 (HDAC3/NCoR2)
(735 活性数据)
SIRT5
Tchem
NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial
(1056 活性数据)
697
(196 活性数据)
CDK2
Tchem
CDK2/Cyclin A2
(2260 活性数据)
CDK4
Tclin
CDK4/Cyclin D3
(681 活性数据)
TRIM24
Tchem
Transcription intermediary factor 1-alpha
(2087 活性数据)
BRPF1
Tchem
Peregrin
(2217 活性数据)
HDAC1
Tclin
Histone deacetylase 1/2/3
(160 活性数据)
关联靶点（其它种属）
Mapk1
MAP kinase ERK2 (650 活性数据)
Hdac1
Histone deacetylase 1 (93 活性数据)
Hdac5
Histone deacetylase 5 (5 活性数据)
Hdac6
Histone deacetylase 6 (222 活性数据)
Fgfr3
Fibroblast growth factor receptor 3 (21 活性数据)
HD1
Histone deacetylase (38 活性数据)
Pichia kudriavzevii (7448 活性数据)
Trypanosoma brucei brucei (13300 活性数据)
Candida albicans (78123 活性数据)
Leishmania donovani (89745 活性数据)
Mus musculus (284745 活性数据)
Rattus norvegicus (775804 活性数据)
Hepatitis C virus (23859 活性数据)
B16 (5829 活性数据)
PC-12 (7051 活性数据)
Vero (26788 活性数据)
rep
Replicase polyprotein 1ab (378 活性数据)
SARS-CoV-2 (38078 活性数据)
hdac10
Polyamine deacetylase HDAC10 (17 活性数据)
作用机制
| 作用机制 | Action Type | target ID | Target Name | Target Type | Target Organism | Binding Site Name | 参考文献 |
|---|
化学和物理性质
DMSO(mg / mL) Max Solubility
67
DMSO(mM) Max Solubility
199.76
Water(mg / mL) Max Solubility
＜1
分子量
335.400 g/mol
XLogP3
2.300
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
2
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
3
可旋转键计数Rotatable Bond Count
3
精确质量Exact Mass
335.163 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
335.163 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
57.500 Ų
重原子数Heavy Atom Count
25
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
478.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
0
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
安全和危险性（GHS）
质检证书（CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
输入批号以搜索分析图谱:
通过匹配包装上的批号来查找并下载产品的 COA，每批产品都进行了严格的验证，您可放心使用！
| 批号(Lot Number) | 证书类型 | 货号 |
|---|---|---|
 K2405603 |
分析证书 | T421055 |
技术文档和文章
溶液计算器
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