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| 活性类型 | 活性值-log(M) | 作用机制 | 期刊 | 参考文献(PubMed IDs) |
|---|
为什么选择此级别
，适用于对基线干扰要求严格的色谱和分析工作流程。
储存与运输
-80℃储存。特低温运输 。请查阅批次 COA 获取详细规格。
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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
Information
Y16 Y16 is an inhibitor of G-protein-coupled Rho GEFs . It blocks the binding of LARG, a DBL-family Rho guanine nucleotide exchange factor, with Rho (Kd = 80 nM).
Targets
RhoGEFs
In vitro
Y16 binds to the junction site of the DH-PH domains of LARG with a ∼80 nM Kd and suppresses LARG catalyzed RhoA activation dose dependently. It is active in blocking the interaction of LARG and related G-protein–coupled Rho GEFs with RhoA without a detectable effect on other DBL family Rho GEFs, Rho effectors, or a RhoGAP. In cells, Y16 selectively inhibits serum-induced RhoA activity and RhoA-mediated signaling, effects that can be rescued by a constitutively active RhoA or ROCK mutant. By suppressing RhoA activity, Y16 inhibits mammary sphere formation of MCF7 breast cancer cells but does not affect the nontransforming MCF10A cells. Y16 works synergistically with Rhosin/G04, a Rho GTPase activation site inhibitor, in inhibiting LARG–RhoA interaction, RhoA activation, and RhoA-mediated signaling functions. Y16 effectively inhibits the growth, migration, and invasion activities of breast cancer cells.
Cell Research(from reference)
Cell lines：PC-3 cells
Concentrations：10 μM
Incubation Time：36 h
规格
英文别名
HY-12649 | MS-26325 | STL368063 | s6752 | 4-{3-[(3-methylbenzyl)oxy]benzylidene}-1-phenyl-3,5-pyrazolidinedione | A902766 | 4-[1-[3-(3-Methyl-benzyloxy)-phenyl]-methylidene]-1-phenyl-pyrazolidine-3,5-dione | (4E)-4-[[3-[(3-methylphenyl)methoxy]phenyl]meth
规格或纯度
10mM in DMSO
英文名称
Y16
生化机理
Y16 是一种 G 蛋白偶联 Rho GEF 抑制剂。它能阻断 DBL 家族 Rho 鸟嘌呤核苷酸交换因子 LARG 与 Rho 的结合（Kd = 80 nM）。
储存条件
-80℃储存
运输条件
特低温运输
名称和识别符
PubChem SID
EC号
806-385-9
分子类型
小分子
IUPAC Name
(4E)-4-[[3-[(3-methylphenyl)methoxy]phenyl]methylidene]-1-phenylpyrazolidine-3,5-dione
INCHI
1S/C24H20N2O3/c1-17-7-5-9-19(13-17)16-29-21-12-6-8-18(14-21)15-22-23(27)25-26(24(22)28)20-10-3-2-4-11-20/h2-15H,16H2,1H3,(H,25,27)/b22-15+
InChi Key
ITMLWGWTDWJSRZ-PXLXIMEGSA-N
Smiles
CC1=CC(=CC=C1)COC2=CC=CC(=C2)C=C3C(=O)NN(C3=O)C4=CC=CC=C4
Isomeric SMILES
CC1=CC(=CC=C1)COC2=CC=CC(=C2)/C=C/3\C(=O)NN(C3=O)C4=CC=CC=C4
PubChem CID
分子量
384.43
技术文档
高级数据
系统学分类
分类树（Taxonomy Tree）
| 界（kingdom) | 有机化合物 |
|---|---|
| 超类（Superclass) | 苯类化合物 |
| 类（Class) | 酚醚 |
| 亚类（Subclass） | 暂无 |
| 中间层级节点（Intermediate Tree Nodes） | 暂无 |
| 直接上位类(Direct Parent) | 酚醚 |
| 其他上位类（Alternative Parents） | 苯氧基化合物 甲苯 烷基芳基醚 吡唑烷酮类 羧酸酰肼 氮杂环化合物 有机光子化合物 有机氮化合物 有机氧化物 碳氢化合物衍生物 羰基化合物 |
| 分子骨架（Molecular Framework) | 芳香族杂单环化合物 |
| 取代基（Substituents） | 芳基醚 - 芳香族杂单环化合物 - 氮杂环 - 羰基 - 羧酸衍生物 - 羧酸肼 - 乙醚 - 烃衍生物 - 单环苯基基团 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 苯酚醚 - 苯氧基化合物 - 吡唑烷 - 吡唑烷酮 - 甲苯 |
| 描述（Description） | 该化合物属于苯酚醚类有机化合物。这类芳香化合物含有被苯环取代的醚基团。 |
| 外部描述符（External Descriptors） | 暂无 |
三维结构
交互式化学结构模型
关联靶点（人）
ARHGEF12
Tchem
Rho 鸟嘌呤核苷酸交换因子 12(Rho guanine nucleotide exchange factor 12)
(8 活性数据)
ROCK2
Tclin
Rho-associated protein kinase 2
(6206 活性数据)
NR1H4
Tclin
Bile acid receptor FXR
(6228 活性数据)
MCF7
(126967 活性数据)
RHOA
Tbio
Transforming protein RhoA
(190 活性数据)
TRIO
Tbio
Triple functional domain protein
(3 活性数据)
ITSN1
Tbio
Intersectin-1
(4 活性数据)
ARHGEF12
Tchem
Rho guanine nucleotide exchange factor 12
(11 活性数据)
| 活性类型 | Relation | Activity value | Units | Action Type | 期刊 | PubMed Id | doi | Assay Aladdin ID |
|---|
RHOA
Tbio
Rho GEF 11/Transforming protein RhoA
(1 活性数据)
RHOA
Tbio
A-kinase anchor protein 13/Transforming protein RhoA
(1 活性数据)
PKN1
Tchem
Serine/threonine-protein kinase N1/Transforming protein RhoA
(1 活性数据)
RHOA
Tbio
RhoGEF 1/Transforming protein RhoA
(12 活性数据)
RHOA
Tbio
Rho GTPase-activating protein 35/Transforming protein RhoA
(1 活性数据)
RHOA
Tbio
Protein diaphanous homolog 1/Transforming protein RhoA
(1 活性数据)
ROCK2
Tclin
Rho-associated protein kinase 2/Transforming protein RhoA
(1 活性数据)
RHOA
Tbio
Proto-oncogene DBL/Transforming protein RhoA
(1 活性数据)
关联靶点（其它种属）
Hdac6
Histone deacetylase 6 (222 活性数据)
NIH3T3 (5395 活性数据)
rep
Replicase polyprotein 1ab (378 活性数据)
SARS-CoV-2 (38078 活性数据)
作用机制
| 作用机制 | Action Type | target ID | Target Name | Target Type | Target Organism | Binding Site Name | 参考文献 |
|---|
化学和物理性质
分子量
384.400 g/mol
XLogP3
4.700
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
1
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
3
可旋转键计数Rotatable Bond Count
5
精确质量Exact Mass
384.147 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
384.147 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
58.600 Ų
重原子数Heavy Atom Count
29
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
626.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
0
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
1
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
1
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
安全和危险性（GHS）
信号词
警告
危险声明
H410: 对水生生物有剧毒并具有长期持续影响
WGK Germany
3
RIDADR
UN30779/PGIII
质检证书（CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
输入批号以搜索分析图谱:
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