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AT 1,是由von Hippel-Lindau配体和BRD4配体相连的PROTAC
别名
(2S,4R)-1-(2R)-2-乙酰氨基-3-[[6-[2-[(6S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[ 3,2-f] [1,2,4]三唑并[4,3-a] [1,4]二氮杂pin-6-基]乙酰胺基]己基]硫基] -3-甲基丁酰基] -4-羟基-N-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基]吡咯烷氨酸-2-羧酰胺
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为什么选择此级别
提供 ≥98%(HPLC) 纯度,适用于对基线干扰要求严格的色谱和分析工作流程。
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储存与运输
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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
规格
别名
(2S,4R)-1-(2R)-2-乙酰氨基-3-[[6-[2-[(6S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[ 3,2-f] [1,2,4]三唑并[4,3-a] [1,4]二氮杂pin-6-基]乙酰胺基]己基]硫基] -3-甲基丁酰基] -4-羟基-N-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基]吡咯烷氨酸-2-羧酰胺
英文别名
(2S,4R)-1-(2R)-2-Acetamido-3-[[6-[2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetamido]hexyl]thio]-3-methylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidinine-2-carboxamide
生化机理
基于(+)-JQ1与von Hippel-Lindau(VHL)配体缀合的细胞渗透性靶向靶向嵌合蛋白(PROTAC®)化合物。与MZ1相比,基于三元复合晶体结构进行了合理设计,以提高BRD4降解的选择性。证明BRD4在1-3μM的细胞中发生了深度选择性的降解,而BRD2和BRD3的损失可忽略不计。PROTAC®是Arvinas Operations,Inc.的注册商标,已获得许可使用
名称和识别符
IUPAC Name
(2S,4R)-1-[(2R)-2-acetamido-3-[6-[[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.02,6]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]acetyl]amino]hexylsulfanyl]-3-methylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide
INCHI
1S/C48H58ClN9O5S3/c1-27-29(3)66-47-40(27)41(33-16-18-35(49)19-17-33)54-37(44-56-55-30(4)58(44)47)23-39(61)50-20-10-8-9-11-21-65-48(6,7)43(53-31(5)59)46(63)57-25-36(60)22-38(57)45(62)51-24-32-12-14-34(15-13-32)42-28(2)52-26-64-42/h12-19,26,36-38,43,60H,8-11,20-25H2,1-7H3,(H,50,61)(H,51,62)(H,53,59)/t36-,37+,38+,43-/m1/s1
InChi Key
SQNZDYHMCMIGGV-TZPPCSJFSA-N
Smiles
CC1=C(SC2=C1C(=NC(C3=NN=C(N32)C)CC(=O)NCCCCCCSC(C)(C)C(C(=O)N4CC(CC4C(=O)NCC5=CC=C(C=C5)C6=C(N=CS6)C)O)NC(=O)C)C7=CC=C(C=C7)Cl)C
Isomeric SMILES
CC1=C(SC2=C1C(=N[C@H](C3=NN=C(N32)C)CC(=O)NCCCCCCSC(C)(C)[C@@H](C(=O)N4C[C@@H](C[C@H]4C(=O)NCC5=CC=C(C=C5)C6=C(N=CS6)C)O)NC(=O)C)C7=CC=C(C=C7)Cl)C
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高级数据
系统学分类
| 界(kingdom) |
有机化合物 |
| 超类(Superclass) |
有机酸及其衍生物 |
| 类(Class) |
羧酸及其衍生物 |
| 亚类(Subclass) |
氨基酸、肽和类似物 |
| 中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) |
肽 |
| 直接上位类(Direct Parent) |
二肽 |
| 其他上位类(Alternative Parents) |
缬氨酸及其衍生物 脯氨酸及其衍生物 N-酰基-α氨基酸及其衍生物 α-氨基酸酰胺 噻吩并二氮卓类 吡咯烷酰胺 N-酰基吡咯烷 1,4-二氮卓类药物 4,5-二取代噻唑 氯苯类 芳基氯化物 三唑类 噻吩类 叔羧酸酰胺 乙酰胺 杂芳族化合物 仲羧酸酰胺 仲醇 酮亚胺 二烷基硫醚 氮杂环化合物 炔丙基型1,3-偶极有机化合物 亚磺酰基化合物 有机氯化物 羰基化合物 有机光子化合物 有机氧化物 碳氢化合物衍生物 |
| 分子骨架(Molecular Framework) |
芳香族杂多环化合物 |
| 取代基(Substituents) |
1,2,4-三唑 - 4,5-二取代-1,3-噻唑 - 乙酰胺 - 羟基苯甲酸酯 - α-氨基酸酰胺 - α-氨基酸或其衍生物 - α-二肽 - 芳香族杂多环化合物 - 芳基氯化物 - 芳基卤化物 - 氮杂环 - 吡唑 - 苯基化合物 - 羰基 - 羧酰胺基 - 氯苯 - 二烷基硫醚 - 卤苯 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 亚胺 - 酮亚胺 - 单环苯基基团 - N-乙酰基-α-氨基酸或其衍生物 - N-酰基吡咯烷 - 有机1,3-双极性化合物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机氯化物 - 有机卤化物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 有机硫化合物 - 对二氮杂卓 - 脯氨酸或其衍生物 - 丙炔型1,3-双极性有机化合物 - 吡咯烷 - 吡咯烷羧酸或其衍生物 - 吡咯烷-2-甲酰胺 - 醛基 - 醛基 - 硫酰基化合物 - 叔羧酸酰胺 - 噻唑 - 噻吩-对-二氮杂卓 - 硫醚 - 噻吩 - 缬氨酸或其衍生物 |
| 描述(Description) |
该化合物属于二肽类有机化合物。这类化合物由两个α-氨基酸通过肽键连接而成。 |
| 外部描述符(External Descriptors) |
暂无 |
三维结构
作用机制
| 作用机制 |
Action Type |
target ID |
Target Name |
Target Type |
Target Organism |
Binding Site Name |
参考文献 |
化学和物理性质
溶解性
溶于DMSO, 最高浓度 (mg/mL): 97.27, 最高浓度(mM): 100;溶于ethanol, 最高浓度 (mg/mL): 97.27, 最高浓度(mM): 100
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
4
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
12
可旋转键计数Rotatable Bond Count
18
精确质量Exact Mass
971.341 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
971.341 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
266.000 Ų
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
4
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
溶液计算器
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