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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
Information
BRD0539 BRD0539 is a potent inhibitor of Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9) with IC50 of 22 μM in an in vitro DNA cleavage assay.
Targets
SpCas9 (Cell-free assay) 22 μM
In vitro
BRD0539 is stable in human plasma and reversibly inhibits SpCas9. BRD0539 does not interfere with the SpCas9:gRNA interaction. BRD0539 dose-dependently blocks the formation of the DNA-bound state in a dose-dependent fashion. BRD0539 impairs the perturbation induced by the 4PAM DNA. BRD0539 is able to inhibit SpCas9 in the eGFP-disruption assay.
Cell Research(from reference)
Cell lines:U2OS.eGFP.PEST cells
Concentrations:15 μM
Incubation Time:2–24 h
规格
英文别名
1H-Pyrrolo[3,2-c]quinoline-4-methanol,8-(2-fluorophenyl)-2,3,3a,4,5,9b-hexahydro-1-[(4-methylphenyl)sulfonyl]-,(3aR,4R,9bR)-
生化机理
BRD0539 是化脓性链球菌 Cas9(SpCas9)的强效抑制剂,在体外 DNA 裂解试验中的 IC50 值为 22 μM。
名称和识别符
IUPAC Name
[(3aR,4R,9bR)-8-(2-fluorophenyl)-1-(4-methylphenyl)sulfonyl-2,3,3a,4,5,9b-hexahydropyrrolo[3,2-c]quinolin-4-yl]methanol
INCHI
1S/C25H25FN2O3S/c1-16-6-9-18(10-7-16)32(30,31)28-13-12-20-24(15-29)27-23-11-8-17(14-21(23)25(20)28)19-4-2-3-5-22(19)26/h2-11,14,20,24-25,27,29H,12-13,15H2,1H3/t20-,24+,25-/m1/s1
InChi Key
CZOIXFMISSBIJL-DCEDVJGZSA-N
Smiles
CC1=CC=C(C=C1)S(=O)(=O)N2CCC3C2C4=C(C=CC(=C4)C5=CC=CC=C5F)NC3CO
Isomeric SMILES
CC1=CC=C(C=C1)S(=O)(=O)N2CC[C@H]3[C@@H]2C4=C(C=CC(=C4)C5=CC=CC=C5F)N[C@H]3CO
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=56848416&ln=
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高级数据
系统学分类
界(kingdom)
有机化合物
超类(Superclass)
有机杂环化合物
类(Class)
喹啉及其衍生物
亚类(Subclass)
苯基喹啉
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes)
暂无
直接上位类(Direct Parent)
苯基喹啉
其他上位类(Alternative Parents)
N,N-二取代对甲苯磺酰胺 吡咯并喹啉 苯磺酰胺类 氢化喹啉 苯磺酰基化合物 芳烷基胺 氟苯类 仲烷基芳胺 有机磺酰胺 芳基氟化物 磺酰基 吡咯烷 1,2-氨基醇 氮杂环化合物 伯醇 有机氟化物 有机氧化物 碳氢化合物衍生物
分子骨架(Molecular Framework)
芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents)
1,2-氨基醇 - 羟基苯甲酸酯 - 氨基酸 - 芳烷基胺 - 芳香族杂多环化合物 - 芳基氟化物 - 芳基卤化物 - 氮杂环 - 苯磺酰胺 - 苯磺酰基 - 苯基化合物 - 氟萘 - 卤苯 - 烃衍生物 - 单环苯基基团 - N,N-二取代对甲苯磺酰胺 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机磺酸或其衍生物 - 有机氟化物 - 有机卤化物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机硫酰胺 - 有机磺酸或其衍生物 - 有机硫化合物 - 对甲苯磺酰胺 - 苯基吡啶 - 初级醇 - 吡咯烷 - 吡咯喹啉 - 二级脂肪族/芳香族胺 - 醛基 - 磺酰基 - 四氢喹啉 - 甲苯 - 对甲苯磺酰胺
描述(Description)
该化合物属于苯基喹啉类有机化合物。这类杂环化合物含有被苯基取代的喹啉结构单元。
外部描述符(External Descriptors)
暂无
三维结构
作用机制
作用机制
Action Type
target ID
Target Name
Target Type
Target Organism
Binding Site Name
参考文献
化学和物理性质
溶解性
Solubility (25°C) In vitro DMSO: 91 mg/mL (201.08 mM); Ethanol: 31 mg/mL (68.5 mM); Water: Insoluble;
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
2
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
6
可旋转键计数Rotatable Bond Count
4
精确质量Exact Mass
452.157 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
452.157 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
78.000 Ų
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
3
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
溶液计算器
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