2'-脱氧胞苷-5'-单磷酸

CAS: 1032-65-1 货号: D420411 分子式: C9H14N3O7P 分子量: 307.2 Beilstein号: 41062 EC号: 213-849-9
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文献证明

在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 5 篇同行评审文献引用。

概述

2'-脱氧胞苷5'-单磷酸(dCMP)利用尿苷单磷酸(UMP)/单磷酸胞苷(CMP)激酶(EC 2.7.4.4)的底物,形成dCDP,其在磷酸化为dCTP时支持DNA生物合成。

It consists of a 2′-deoxy-β-D-ribofuranose, linked through an N-β-D-glycosidic linkage to a heterocycle nitrogen cytosine.

2′-Deoxycytidine 5′-monophosphate (dCMP) is used as a substrate of uridine monophosphate (UMP)/cytidine monophosphate (CMP) kinase (EC 2.7.4.4) to form dCDP which upon phosphorylation to dCTP supports DNA biosynthesis.

It consists of a 2′-deoxy-β-D-ribofuranose, linked through an N-β-D-glycosidic linkage to a heterocycle nitrogen cytosine.

规格

英文别名
deoxycytidine dihydrogen phosphate | Deoxycytidylate | 1njc | deoxycytidylic acid | 2'-Deoxycytidine 5'-monophosphate, Sigma Grade, >=95.0% | Cytidine 5'-(dihydrogen phosphate) | SCHEMBL48317 | deoxycytidine monophosphate | AS-64039 | dCMP | 1nje | 2'-DEO
规格或纯度
10mM in DMSO
英文名称
2′-Deoxycytidine 5′-monophosphate
生化机理
核苷单磷酸酯用作尿苷单磷酸酯(UMP)/胞苷单磷酸酯(CMP)激酶(EC 2.7.4.4)的底物,形成dCDP,磷酸化为dCTP后可支持DNA生物合成。
储存条件
-80℃储存
运输条件
特低温运输
名称和识别符
PubChem SID
EC号
213-849-9
分子类型
小分子
IUPAC Name
[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
INCHI
1S/C9H14N3O7P/c10-7-1-2-12(9(14)11-7)8-3-5(13)6(19-8)4-18-20(15,16)17/h1-2,5-6,8,13H,3-4H2,(H2,10,11,14)(H2,15,16,17)/t5-,6+,8+/m0/s1
InChi Key
NCMVOABPESMRCP-SHYZEUOFSA-N
Smiles
C1C(C(OC1N2C=CC(=NC2=O)N)COP(=O)(O)O)O
Isomeric SMILES
C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=CC(=NC2=O)N)COP(=O)(O)O)O
分子量
307.2
Beilstein号
41062
Reaxy-Rn
14609574
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=14609574&ln=

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系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 核苷、核苷酸及其类似物
类(Class) 嘧啶核苷酸
亚类(Subclass) 嘧啶脱氧核苷酸
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 嘧啶脱氧核糖核苷单磷酸
直接上位类(Direct Parent) 嘧啶2'-脱氧核糖核苷单磷酸酯
其他上位类(Alternative Parents) 嘧啶酮类  单烷基磷酸酯  氨基嘧啶及其衍生物  咪唑内酰胺类  氢化嘧啶  四氢呋喃  杂芳族化合物  仲醇  氧环化合物  氮杂环化合物  伯胺  有机光子化合物  有机氧化物  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂单环化合物
取代基(Substituents) 羟基苯甲酸酯 - 烷基磷酸酯 - 氨基酸 - 氨基吡啶 - 芳香族杂单环化合物 - 氮杂环 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 羟吡啶 - 咪唑内酰胺 - 单烷基磷酸酯 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机磷酸酯 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 磷酸酯 - 初级胺 - 嘧啶 - 嘧啶-2'-脱氧核糖核苷单磷酸 - 嘧啶酮 - 醛基 - 四氢呋喃
描述(Description) 该化合物属于嘧啶2'-脱氧核苷单磷酸类有机化合物。此类嘧啶核苷酸的核糖基团上连接单磷酸基团,且2位缺失羟基。
外部描述符(External Descriptors) Deoxyribonucleotides
三维结构
交互式化学结构模型





关联靶点(人)
CMPK1 Tchem UMP-CMP kinase (152 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
关联靶点(其它种属)
Deoxycytidylate deaminase (6 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
作用机制
作用机制 Action Type target ID Target Name Target Type Target Organism Binding Site Name 参考文献
化学和物理性质
敏感性
对湿度敏感;对热敏感
比旋光度
37° (C=1,H2O)
熔点
161 °C(dec.)
分子量
307.200 g/mol
XLogP3
-3.400
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
4
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
7
可旋转键计数Rotatable Bond Count
4
精确质量Exact Mass
307.057 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
307.057 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
155.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
20
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
502.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
3
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
安全和危险性(GHS)
象形图
信号词
警告
危险声明

H302: 吞食有害

H312: 皮肤接触有害

H332: 吸入有害

预防措施声明

P261: 避免吸入灰尘/烟雾/气体/雾/蒸汽/喷雾

P264: 处理后要彻底洗手。

P270: 使用本产品时,请勿进食、饮水或吸烟。

P271: 仅在室外或通风良好的地方使用。

P280: 戴防护手套/穿防护服/戴防护眼罩/戴防护面具。

P321: 特殊处理(请参阅此标签上的...)。

P330: 漱口

P302+P352: 如皮肤沾染:用水充分清洗。

P304+P340: 如误吸入:将人转移到空气新鲜处,保持呼吸舒适体位。

P362+P364: 脱掉沾污的衣服,清洗后方可重新使用。

P501: 将内容物/容器处理到。。。

P301+P317: 如果被吞咽:请寻求医疗帮助。

P317: 寻求紧急医疗救助。

WGK Germany
3
个人防护装备
Eyeshields, Gloves, type N95 (US), type P1 (EN143) respirator filter
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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技术文档和文章
此产品的引用文献
溶液计算器