DBCO-S-S-PEG3-biotin

CAS: 1430408-09-5 货号: D595750 分子式: C42H56N6O8S3 分子量: 869.12 PubChem CID: 91757910
有货
级别和纯度: ≥95%
别名
N-[24-(11,12-二脱氧二苯并[b,f]吖辛因-5(6H)-基)-13,21,24-三氧代-3,6,9-三氧杂-16,17-二硫杂-12,20-二氮杂二十四烷-1-基]-5-[(3aS,4S,6aR)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基]戊酰胺
储存条件
避光,-20°C储存,充氩
运输条件
超低温运输
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规格
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1mg
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文献证明

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概述

DBCO-S-S-PEG3-biotin 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。DBCO-S-S-PEG3-biotin 是一种点击化学试剂。它含有 DBCO 基团,可以和含有 Azide 基团的分子发生环张力 (strain) 促进的炔-叠氮环加成反应 (SPAAC)。

DBCO-S-S-PEG3-biotin is a cleavable reagent for introduction of a biotin moiety to azide-containing biomolecules using copper-free Click Chemistry. The hydrophilic spacer arm provides better solubility to the labeled molecules in aqueous media. The disulfide bond in this linker can be cleaved using reducing agents such as DTT, BME and TCEP to remove the biotin label.

规格

别名
N-[24-(11,12-二脱氧二苯并[b,f]吖辛因-5(6H)-基)-13,21,24-三氧代-3,6,9-三氧杂-16,17-二硫杂-12,20-二氮杂二十四烷-1-基]-5-[(3aS,4S,6aR)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基]戊酰胺
英文别名
Dibenzocyclooctyne-S-S-PEG3-Biotin | N-[24-(11,12-Didehydrodibenzo[b,f]azocin-5(6H)-yl)-13,21,24-trioxo-3,6,9-trioxa-16,17-dithia-12,20-diazatetracos-1-yl]-5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanamide
规格或纯度
≥95%
英文名称
DBCO-S-S-PEG3-biotin
储存条件
避光,-20°C储存,充氩
运输条件
超低温运输
纯度
≥95%
名称和识别符
分子类型
小分子
IUPAC Name
5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-[2-[2-[2-[2-[3-[2-[[4-(2-azatricyclo[10.4.0.04,9]hexadeca-1(16),4,6,8,12,14-hexaen-10-yn-2-yl)-4-oxobutanoyl]amino]ethyldisulfanyl]propanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]pentanamide
INCHI
1S/C42H56N6O8S3/c49-37(12-6-5-11-36-41-34(30-57-36)46-42(53)47-41)43-18-21-54-23-25-56-26-24-55-22-19-44-39(51)17-27-58-59-28-20-45-38(50)15-16-40(52)48-29-33-9-2-1-7-31(33)13-14-32-8-3-4-10-35(32)48/h1-4,7-10,34,36,41H,5-6,11-12,15-30H2,(H,43,49)(H,44,51)(H,45,50)(H2,46,47,53)/t34-,36-,41-/m0/s1
InChi Key
ZJVGOGQIAYMKAS-MZOCQUDTSA-N
Smiles
C1C2C(C(S1)CCCCC(=O)NCCOCCOCCOCCNC(=O)CCSSCCNC(=O)CCC(=O)N3CC4=CC=CC=C4C#CC5=CC=CC=C53)NC(=O)N2
Isomeric SMILES
C1[C@H]2[C@@H]([C@@H](S1)CCCCC(=O)NCCOCCOCCOCCNC(=O)CCSSCCNC(=O)CCC(=O)N3CC4=CC=CC=C4C#CC5=CC=CC=C53)NC(=O)N2
PubChem CID
分子量
869.12

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高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机杂环化合物
类(Class) 生物素及其衍生物
亚类(Subclass) 暂无
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 生物素及其衍生物
其他上位类(Alternative Parents) 噻吩并咪唑烷类  苯类化合物  咪唑啉酮类  N-酰胺  噻吩类  硫杂环戊烷  叔羧酸酰胺  尿素  二烷基二硫化物  仲羧酸酰胺  亚磺酰基化合物  二烷基硫醚  氮杂环化合物  二烷基醚  碳氢化合物衍生物  羰基化合物  有机氧化物  有机氮化合物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents) 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 苯基化合物 - 生物素衍生物 - 羰基 - 羧酰胺基 - 羧酸衍生物 - 二烷基醚 - 二烷基二硫化物 - 二烷基硫醚 - 乙醚 - 脂肪酰基 - 脂肪酰胺 - 烃衍生物 - 咪唑烷酮 - 咪唑烷酮 - N-酰胺基胺 - 有机二硫化物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机硫化合物 - 醛基 - 硫酰基化合物 - 叔羧酸酰胺 - 噻吩咪唑烷 - 硫醚 - 硫杂环丁烷 - 噻吩 - 脲
描述(Description) 该化合物属于生物素及其衍生物类有机化合物。这类化合物含有与四氢噻吩环共轭的脲基(四氢咪唑啉)环。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





化学和物理性质
敏感性
光敏感;湿度敏感;热敏感
分子量
869.100 g/mol
XLogP3
1.400
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
5
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
11
可旋转键计数Rotatable Bond Count
27
精确质量Exact Mass
868.332 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
868.332 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
252.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
59
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
1420.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
3
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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