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为什么选择此级别
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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
dFKBP-1 is a potent and PROTAC-based FKBP12 degrader. dFKBP-1 incorporates the ligand SLF of FKBP12 , the Thalidomide based Cereblon ligand and a linker
In Vitro
dFKBP-1 potently decreases FKBP12 abundance in MV4;11 cells, leading to over 80% reduction of FKBP12 at 0.1 μM and 50% reduction at 0.01 μM. As with dBET1, destabilization of FKBP12 by dFKBP-1 is rescued by pre-treatment with Carfilzomib, MLN4924, free SLF or free Thalidomide. Cereblon (CRBN)-dependent degradation is established using previously published isogenic 293FT cell lines which are wild-type (293FT-WT) or deficient (293FT-CRBN −/− ) for CRBN. Treatment of 293FT-WT cells with dFKBP-1 induces potent, dose-dependent degradation of FKBP12, whereas 293FT-CRBN −/− are unaffected. MCE has not independently confirmed the accuracy of these methods. They are for reference only.
Form:Solid
IC50& Target:Cereblon FKBP
规格
英文别名
DTXSID901098019 | dFKBP-1 | MS-31862 | 2-Piperidinecarboxylic acid, 1-(3,3-dimethyl-1,2-dioxopentyl)-, (1R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[3-[[4-[[4-[[2-[[2-(2,6-dioxo-3-piperidinyl)-2,3-dihydro-1,3-dioxo-1H-isoindol-4-yl]oxy]acetyl]amino]butyl]amino]-1,4-dio
生化机理
dFKBP-1 包含 FKBP12 的配体 SLF(HY-114872)、基于沙利度胺的 Cereblon 配体和连接体。
名称和识别符
IUPAC Name
[(1R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[3-[[4-[4-[[2-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]oxyacetyl]amino]butylamino]-4-oxobutanoyl]amino]phenyl]propyl] (2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxylate
INCHI
1S/C53H64N6O14/c1-6-53(2,3)47(64)51(68)58-28-10-7-16-37(58)52(69)73-38(21-18-32-19-22-39(70-4)41(29-32)71-5)33-13-11-14-34(30-33)56-43(61)25-24-42(60)54-26-8-9-27-55-45(63)31-72-40-17-12-15-35-46(40)50(67)59(49(35)66)36-20-23-44(62)57-48(36)65/h11-15,17,19,22,29-30,36-38H,6-10,16,18,20-21,23-28,31H2,1-5H3,(H,54,60)(H,55,63)(H,56,61)(H,57,62,65)/t36?,37-,38+/m0/s1
InChi Key
RIBCWKRMNKOGRN-GGJINPDOSA-N
Smiles
CCC(C)(C)C(=O)C(=O)N1CCCCC1C(=O)OC(CCC2=CC(=C(C=C2)OC)OC)C3=CC(=CC=C3)NC(=O)CCC(=O)NCCCCNC(=O)COC4=CC=CC5=C4C(=O)N(C5=O)C6CCC(=O)NC6=O
Isomeric SMILES
CCC(C)(C)C(=O)C(=O)N1CCCC[C@H]1C(=O)O[C@H](CCC2=CC(=C(C=C2)OC)OC)C3=CC(=CC=C3)NC(=O)CCC(=O)NCCCCNC(=O)COC4=CC=CC5=C4C(=O)N(C5=O)C6CCC(=O)NC6=O
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高级数据
系统学分类
界(kingdom)
有机化合物
超类(Superclass)
苯丙素类和聚酮类
类(Class)
线性1,3-二芳基丙烷类化合物
亚类(Subclass)
暂无
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes)
暂无
直接上位类(Direct Parent)
线性1,3-二芳基丙烷类化合物
其他上位类(Alternative Parents)
α-氨基酸酯 邻苯二甲酰亚胺 二甲氧基苯 苄氧羰基 哌啶羧酸 N-酰基哌啶 异吲哚 苯胺类 哌啶二酮 苯氧基化合物 N-芳基酰胺 茴香醚 δ内酰胺 烷基芳基醚 N-取代羧酸酰亚胺 N-酰胺 叔羧酸酰胺 N-未取代羧酸酰亚胺 二羧酰亚胺 仲羧酸酰胺 酮类 羧酸酯 一元羧酸及其衍生物 氮杂环化合物 有机光子化合物 有机氧化物 碳氢化合物衍生物
分子骨架(Molecular Framework)
芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents)
芳基醚 - α-氨基酸酐 - α-氨基酸或其衍生物 - 苯胺类化合物 - 茴香醚 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 苯基化合物 - 苄氧羰基 - 羰基 - 羧酰胺基 - 羧酸衍生物 - 羧酸酰胺 - 羧酸酰亚胺 - 羧酸亚胺,正位取代 - 羧酸亚胺,正位未取代 - Delta-吡咯烷酮 - 二羧酰亚胺 - 二甲氧基苯 - 乙醚 - 脂肪酰基 - 脂肪酰胺 - 烃衍生物 - 异吲哚 - 异吲哚或其衍生物 - 异吲哚啉 - 异吲哚酮 - 酮 - 肟 - 线性1,3-二芳基丙烷类 - 甲氧基苯 - 单羧酸或其衍生物 - 单环苯基基团 - N-酰胺基胺 - N-酰基-哌啶 - N-芳基酰胺 - O-二甲氧基苯 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 苯酚醚 - 苯氧基化合物 - 邻苯二甲酰亚胺 - 哌嗪 - 哌嗪-3,4-二羟基-2-哌嗪酮 - 哌啶二酮 - 哌啶酮 - 醛基 - 叔羧酸酰胺
描述(Description)
该化合物属于线性1,3-二芳基丙烷类有机化合物。这类化合物以C6-C3-C6骨架为基础,两个苯环未相互连接。
外部描述符(External Descriptors)
暂无
三维结构
化学和物理性质
溶解性
DMSO : 100 mg/mL (99.10 mM; Need ultrasonic)
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
4
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
14
可旋转键计数Rotatable Bond Count
25
精确质量Exact Mass
1008.45 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
1008.45 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
262.000 Ų
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
2
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
1
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
溶液计算器
常见问题
本产品的纯度是多少?
本产品的化学纯度(含量)为 ≥95%。批次的具体数值以分析证书(COA)为准。
本产品应如何储存?
请于2–8 °C条件下保存。需冷藏保存以维持规定的有效期。
本产品如何运输?
本产品采用湿冰冷藏运输。收货后请立即拆包,并按上述储存条件保存。
本产品的 CAS 号、分子式和分子量是多少?
本产品的 CAS 号为 1799711-22-0,分子式为 C53H64N6O14,分子量为 1009.11 g/mol。InChIKey RIBCWKRMNKOGRN-GGJINPDOSA-N。
如何获取批次专用COA?
每个订单都会随附分析证书(COA),您也可以从账户订单历史中下载。如需订购前的COA,请联系您的客户代表,或使用PDP上的"申请COA"按钮——我们将提供代表性批次的COA。
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