Dmt-2'fluoro-da(bz) amidite

CAS: 136834-22-5 货号: D649647 分子式: C47H51FN7O7P 分子量: 875.9 EC号: 890-259-3 PubChem CID: 12042896
有货
级别和纯度: ≥98%(mixture of isomers)
别名
2'fluoro-da(bz)亚磷酰胺单体 | DMT-2'-氟-dA(Bz)亚磷酰胺 | N-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-3'-O-[(2-氰基乙氧基)(二异丙基氨基)膦基]-2'-脱氧-2'-氟腺苷 | N-苯甲酰基-5'-O-[双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]-3'-O-[(2-氰基乙氧基)(二异丙基氨基)膦基]-2'-脱氧-2'-氟腺苷
储存条件
-20°C储存,充氩
运输条件
超低温运输
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规格
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文献证明

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概述


Dmt-2'fluoro-da(bz) amidite, an uniformly modified 2'-deoxy-2'-fluoro phosphorothioate oligonucleotide, is a nuclease-resistant antisense compound with high affinity and specificity for RNA targets. Dmt-2'fluoro-da(bz) amidite is also an intermediate for 5’-DMT-3’-phosphoramidite synthesis.

Form:Solid

规格

别名
2'fluoro-da(bz)亚磷酰胺单体 | DMT-2'-氟-dA(Bz)亚磷酰胺 | N-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-3'-O-[(2-氰基乙氧基)(二异丙基氨基)膦基]-2'-脱氧-2'-氟腺苷 | N-苯甲酰基-5'-O-[双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]-3'-O-[(2-氰基乙氧基)(二异丙基氨基)膦基]-2'-脱氧-2'-氟腺苷
英文别名
DMT-2'Fluoro-dA(bz) Phosphoramidite, configured for ABI | (2R,3R,4R,5R)-5-(6-Benzamido-9H-purin-9-yl)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-fluorotetrahydrofuran-3-yl (2-cyanoethyl) diisopropylphosphoramidite | A858248 | N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-5-
规格或纯度
≥98%(mixture of isomers)
英文名称
Dmt-2'fluoro-da(bz) amidite
生化机理
Dmt-2'-氟-da(bz)脒是一种均匀修饰的 2'-脱氧-2'-氟硫代磷酸酯寡核苷酸,是一种抗核酸酶的反义化合物,对 RNA 靶点具有高亲和力和特异性。Dmt-2'-氟-da(bz)亚酰胺也是一种能与 RNA 结合的中间体。
储存条件
-20°C储存,充氩
运输条件
超低温运输
纯度
≥98%(mixture of isomers)
名称和识别符
PubChem SID
EC号
890-259-3
分子类型
小分子
IUPAC Name
N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-3-fluorooxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
INCHI
1S/C47H51FN7O7P/c1-31(2)55(32(3)4)63(60-27-13-26-49)62-42-39(61-46(40(42)48)54-30-52-41-43(50-29-51-44(41)54)53-45(56)33-14-9-7-10-15-33)28-59-47(34-16-11-8-12-17-34,35-18-22-37(57-5)23-19-35)36-20-24-38(58-6)25-21-36/h7-12,14-25,29-32,39-40,42,46H,13,27-28H2,1-6H3,(H,50,51,53,56)/t39-,40-,42-,46-,63?/m1/s1
InChi Key
VCCMVPDSLHFCBB-MSIRFHFKSA-N
Smiles
CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)OC1C(OC(C1F)N2C=NC3=C(N=CN=C32)NC(=O)C4=CC=CC=C4)COC(C5=CC=CC=C5)(C6=CC=C(C=C6)OC)C7=CC=C(C=C7)OC
Isomeric SMILES
CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@@H]1[C@H](O[C@H]([C@@H]1F)N2C=NC3=C(N=CN=C32)NC(=O)C4=CC=CC=C4)COC(C5=CC=CC=C5)(C6=CC=C(C=C6)OC)C7=CC=C(C=C7)OC
关联CAS
PubChem CID
分子量
875.9

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系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 核苷、核苷酸及其类似物
类(Class) 核苷和核苷酸类似物
亚类(Subclass) 核糖核苷亚磷酰胺
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 核糖核苷亚磷酰胺
其他上位类(Alternative Parents) 咪唑并嘧啶类  苄醚  苯甲酰胺类  苯氧基化合物  甲氧基苯  苯甲酰衍生物  茴香醚  烷基芳基醚  嘧啶和嘧啶衍生物  N-取代咪唑  N-酰胺  单糖  咪唑内酰胺类  四氢呋喃  咪唑啉  杂芳族化合物  炔丙基型1,3-偶极有机化合物  氧环化合物  腈类  甲脒  二烷基醚  羧酸酰胺  甲脒类  氮杂环化合物  有机光子化合物  有机氟化物  有机氧化物  碳氢化合物衍生物  烷基氟化物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents) 2-碘苯酚 - 芳基醚 - 氟化烷基 - 烷基溴化物 - 氨基脒 - 茴香醚 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 吡唑 - 苯甲酰胺 - 苯基化合物 - 苯甲酸或衍生物 - 苯甲酰 - 苄基醚 - 碳腈 - 羧酰胺基 - 羧酰亚胺 - 羧酸衍生物 - 二烷基醚 - 乙醚 - 甲酰胺 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 咪唑哌啶 - 咪唑内酰胺 - 甲氧基苯 - 单环苯基基团 - 单糖 - N-酰胺基胺 - N-取代咪唑 - 氰基化合物 - 有机1,3-双极性化合物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机氟化物 - 有机卤化物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 苯酚醚 - 苯氧基化合物 - 丙炔型1,3-双极性有机化合物 - 嘧啶 - 核糖核苷磷酰胺酯 - 四氢呋喃
描述(Description) 该化合物属于核糖核苷磷酰胺酯类有机化合物。这类核糖核苷类似物由核碱基(通常为嘌呤或嘧啶)与核糖或脱氧核糖连接而成,其2'、3'或5'位通过磷酰胺酯基团进行保护。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
化学和物理性质
溶解性
DMSO : 100 mg/mL (114.17 mM; Need ultrasonic)
敏感性
对热敏感;对湿度敏感
分子量
875.900 g/mol
XLogP3
7.500
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
1
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
13
可旋转键计数Rotatable Bond Count
19
精确质量Exact Mass
875.357 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
875.357 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
155.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
63
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
1420.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
4
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
1
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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批号(Lot Number) 证书类型 货号
L2504296 分析证书 D649647
L2504297 分析证书 D649647
L2504298 分析证书 D649647
L2504299 分析证书 D649647
溶液计算器