实验方案(Protocols)

2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶:操作与使用实验方案

2-Chloro-5-fluoro-4-methoxy-6-methylpyrimidine is a versatile halogenated pyrimidine intermediate widely employed as a reactive building block in the synthesis of pharmaceutical compounds and agrochemicals, offering orthogonal reactivity at the chloro, fluoro, and methoxy substituents for selective functionalization.

化学名称
2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶
货号
C734312
分子式
C6H6ClFN2O
分子量
176.57 g/mol
主要官能团
嘧啶环上的氯基(C2位)、氟基(C5位)、甲氧基(C4位)、甲基(C6位)
主要应用
药物中间体、农用化学品砌块、杂环合成
推荐储存条件
阴凉干燥处,密封储存,避免潮湿和光照

概述与化学性质

2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶(货号:C734312;分子式 C6H6ClFN2O;分子量176.57 g/mol)是一种多取代嘧啶杂环化合物,芳香环上含有四个不同的取代基。C2位氯基、C5位氟基、C4位甲氧基和C6位甲基的组合赋予该化合物丰富且正交的反应活性,使其成为新药研发和农药化学中备受青睐的合成砌块。

吸电子的氟和氯取代基使芳环对亲核芳香取代反应(SNAr)更为活泼,由于电子效应和空间效应,C2位氯基通常比C5位氟基表现出更高的亲电反应活性。C4位甲氧基在强反应条件下可被取代,或在温和条件下保留以引导后续转化。这些特性使化学家能够在复杂的多步合成中实现顺序、选择性的官能团化。

安全与操作要求

在使用2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶之前,请查阅阿拉丁科学提供的最新安全数据表(SDS)。虽然该化合物未被列为高毒性物质,但在任何情况下均须遵守卤代有机化合物的标准实验室防护规程。

  • 个人防护装备(PPE):佩戴耐化学品丁腈手套、实验服及安全眼镜或面罩。在开放环境中处理粉末状物料时,需额外佩戴呼吸防护装备。
  • 通风:所有称量、溶解和反应步骤必须在通风良好的通风柜中进行,以防止吸入粉尘或蒸气。
  • 皮肤及眼睛接触:皮肤接触后应立即用肥皂和清水冲洗至少15分钟;眼睛接触后应用大量清水冲洗并立即就医。
  • 废物处置:所有废弃物、溶剂冲洗液及受污染物品应按照地方机构和政府关于卤代有机废物的相关法规进行处置。

储存方案

妥善储存对于长期维持2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶的化学完整性和纯度至关重要。请遵循以下指南以最大限度延长保质期:

  1. 温度:除产品标签另有说明需冷藏储存外,应在室温(15–25 °C)阴凉干燥处储存,避免接触热源或直接暴露于阳光下。
  2. 防潮:化合物应存放于密封容器中并加入干燥剂,以防止长期暴露于大气湿度时甲氧基发生水解或卤素取代基降解。
  3. 避光:若需长期储存,应使用棕色玻璃瓶或用铝箔包裹容器,因为卤代杂环化合物可能对紫外线诱导的分解敏感。
  4. 容器完整性:每次使用后,重新密封前用干燥氮气或氩气吹扫储存容器的顶部空间,以尽量减少水分和氧气的接触。
  5. 隔离存放:远离强碱、强氧化剂和还原剂储存,以防止意外反应。

溶液配制与反应设置

以下逐步操作描述了以2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶作为合成砌块配制储备液及设置反应的方法。

所需材料

  • 2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶(C734312)
  • 无水非质子溶剂(如DMF、DMSO、乙腈或THF)
  • 分析天平(精度±0.1 mg)
  • 容量玻璃器皿(容量瓶或刻度注射器)
  • 磁力搅拌子和搅拌板
  • 惰性气氛管路(N2或Ar),用于对水分敏感的反应

操作步骤

  1. 去皮称量:在通风柜内,将所需量的2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶准确称入洁净、干燥的玻璃瓶中。
  2. 溶剂选择:该化合物预期可在常见极性非质子溶剂(如DMF、DMSO和乙腈)中良好溶解,在THF和DCM中也具有预期溶解性。请在具体浓度和应用场景下通过实验验证溶解度。
  3. 溶解:加入适量无水溶剂以达到所需浓度,轻轻搅拌或振荡直至目视确认完全溶解。
  4. 反应设置:若存在对水分或空气敏感的共试剂,应在惰性气氛下将溶液转移至反应容器中。确保所有玻璃器皿在使用前经烘箱干燥并在惰性气体下冷却。
  5. 亲核芳香取代(SNAr):对于以C2位氯基为目标的SNAr反应,在非质子溶剂中,以适当碱(如K2CO3、Cs2CO3或Et3N)为碱源,在室温至100 °C范围内(根据亲核试剂活性调节),将砌块与所需胺、硫醇或醇盐亲核试剂混合反应。
  6. 监测:使用适当溶剂体系通过TLC或HPLC监测反应进程。起始物料和产物通常在254 nm处显示不同的紫外吸收。
  7. 后处理:反应完成后,进行标准水相后处理,用适当有机溶剂萃取,经无水MgSO4或Na2SO4干燥,过滤后在减压条件下浓缩。

质量控制与故障排查

确保起始物料的质量并监测反应结果是获得可重复结果的关键步骤。

验证起始物料纯度

收到货物后,使用以下方法验证2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶的身份和纯度:

  • 1H NMR:预期信号应与甲氧基(OCH3,约3H单峰)和甲基(CH3,嘧啶环上约3H单峰)一致;由于C4、C5和C6位均已完全取代,环上不应出现烯烃或芳香质子信号。C5位氟的偶合可能呈现特征性的双峰模式。
  • 19F NMR:预期出现单一氟共振信号,确认C5位单氟取代。
  • HPLC:在C18反相色谱柱上运行;纯度应达到产品质量检验报告(CoA)上标注的规格。

常见问题与解决方法

  • SNAr转化率低:提高反应温度、换用极性更强的溶剂或使用更强的碱。确保亲核试剂略微过量(1.1–1.5当量)。
  • 多产物生成:严格控制温度;较低温度可能提高C2位相对于C4位甲氧基取代的选择性。必要时采用保护基策略。
  • 化合物分解:检查储存条件;分解可能提示水分污染。使用新开封或经严格干燥的物料。
  • 溶解性差:尝试换用其他溶剂(DMSO、NMP)或温和加热(40–50 °C)以助溶。除非反应特别需要,否则避免使用含水介质。

常见问题

溶解2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶推荐使用哪些溶剂?

建议使用极性非质子溶剂(如DMF、DMSO、乙腈和THF)溶解该化合物,在二氯甲烷(DCM)中通常也具有良好溶解性。由于在酸性或碱性水相条件下甲氧基取代基可能发生水解,一般不建议使用含水溶剂。

嘧啶环上哪个位置对亲核取代反应最为活泼?

在标准SNAr条件下,C2位氯基通常是亲核芳香取代反应中亲电活性最强的位点,因为当环上氮原子处于稳定Meisenheimer络合物的位置时,氯是比氟更好的离去基团。然而,实际选择性取决于亲核试剂的性质、溶剂、温度和所用碱,因此应通过实验优化反应条件。

如何储存2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶以保持其纯度?

该化合物应密封存放于阴凉干燥处,避免受潮、受热和直接光照。每次使用后,重新密封前用干燥氮气或氩气吹扫容器顶部空间。应与强碱、氧化剂和还原剂分开存放。具体储存温度建议请参阅产品质量检验报告和安全数据表。

可以使用哪些分析技术来确认该化合物的身份?

2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶的身份可通过1H NMR(特征性甲氧基和甲基单峰)、19F NMR(C5位单一氟共振信号)和质谱(预期[M+H]+与分子量176.57一致)确认。可在C18反相色谱柱上进行HPLC分析,对照质量检验报告上的规格评估纯度。

该化合物适合用于交叉偶联反应吗?

是的,C2位氯取代基使2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶可作为过渡金属催化交叉偶联反应(如Suzuki-Miyaura、Negishi或Buchwald-Hartwig胺化反应)的亲电偶联底物,以C–Cl键作为亲电偶联位点。应根据具体偶联伙伴和目标转化选择合适的钯或镍催化剂及配体。

参考文献

  1. Aladdin Scientific. Product Information and Certificate of Analysis: 2-Chloro-5-fluoro-4-methoxy-6-methylpyrimidine, SKU C734312. Aladdin Scientific, Shanghai.
  2. Clayden, J.; Greeves, N.; Warren, S. Organic Chemistry, 2nd ed.; Oxford University Press: Oxford, 2012. Chapter on Nucleophilic Aromatic Substitution.
  3. Manske, R. H. F.; Kulka, M. Organic Reactions; Wiley: New York. General protocols for handling and storing halogenated heterocyclic compounds.

产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。

目录: 实验方案(Protocols)

Da — 若无特别说明,分子量单位默认为道尔顿。   Mw — 重均分子量。   Mn — 数均分子量。

产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。

引用本文

阿拉丁科学.《2-氯-5-氟-4-甲氧基-6-甲基嘧啶:操作与使用实验方案》. 阿拉丁知识库,更新于 2026年10月22日。 https://www.aladdin-e.com/zh_cn/faqs/2-chloro-5-fluoro-4-methoxy-6-methylpyrimidine-handling-use-protocol.html
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