3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸:性质、用途及研究指南
3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸:性质、用途及研究指南
3-(4-Pyridyl)-D-alanine是一种非经典的对映体纯D构型氨基酸,其侧链含有4-吡啶甲基,被广泛用作多肽化学、拟肽设计及药物化学研究中的多功能构建模块。
- 化学名称
- 3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸
- 分子式
- C₈H₁₀N₂O₂
- 分子量
- 166.18 g/mol
- 立体化学
- α碳为D构型(R构型)
- 主要官能团
- α-氨基、α-羧酸、吡啶环(4位)
- 产品编号
- A107875
- 典型应用
- 多肽合成、拟肽研究、配位化学、药物发现
化学结构与理化性质
3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸属于吡啶丙氨酸非经典氨基酸家族。其骨架保留了标准α-氨基酸支架——α-氨基和α-羧酸——而侧链以4-吡啶甲基(4-甲基吡啶基)取代了典型的烷基或芳基取代基。该化合物在生理pH下以两性离子形式存在,与天然氨基酸类似。
吡啶氮的存在赋予了该化合物独特性质:它可作为氢键受体、金属配位位点及弱碱(吡啶pKₐ≈5.2),相对于其苯丙氨酸类似物,显著扩展了其应用范围。α碳的D构型对许多选择性切割L-氨基酸残基的蛋白水解酶具有抵抗性,使D构型构建模块在制备代谢稳定多肽方面具有吸引力。
主要理化参数(具体数值请参阅审核标记):
- 分子式:C₈H₁₀N₂O₂
- 分子量:166.18 g/mol
- 外观:通常为白色至类白色结晶固体
- 溶解性:溶于水及稀酸或稀碱水溶液;在常用有机溶剂中溶解度有限
合成方法与产品可及性
3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸可通过多种用于非经典D-氨基酸的成熟合成策略制备:
- 不对称合成:手性相转移催化或使用手性辅助试剂(如希夫碱甘氨酸等价物),通过与4-吡啶甲基亲电试剂的对映选择性烷基化,引入正确的D-立体中心。
- 外消旋体拆分:利用D-氨基酸选择性酶或手性拆分剂对外消旋3-(4-吡啶基)丙氨酸进行化学或酶法拆分,可获得高对映纯度的D-对映体。
- 化学酶法路线:具有D-选择性的转氨酶或D-氨基酸脱氢酶可将适当功能化的酮酸前体转化为目标D-氨基酸。
对于大多数研究实验室,从可靠的试剂供应商采购是最实际的方法。Aladdin Scientific以研究级规格供应3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸(产品编号:A107875),是自主合成的省时替代方案。
研究应用
D-氨基酸骨架与具有金属螯合和氢键供体功能的吡啶侧链相结合,使3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸成为多个研究领域中的多功能工具:
多肽与拟肽化学
将D-氨基酸残基引入多肽可带来局部构象约束,并提高蛋白水解稳定性。4-吡啶基侧链还可实现选择性金属配位、pH响应行为以及与生物靶标的额外非共价相互作用。这些特性被用于酶抑制剂、受体配体和抗菌肽的设计。
配位化学与金属多肽
侧链的吡啶氮可与过渡金属(如Cu²⁺、Zn²⁺、Pd²⁺)配位,从而构建金属多肽催化剂、超分子组装体和生物无机模型化合物。D构型残基为此类结构增添了立体化学多样性。
药物发现与药物化学
非经典D-氨基酸是拟肽药物设计中的重要药效团元素。与纯碳环芳香侧链相比,吡啶环可提高水溶性,通过氢键协助靶标结合,并可作为候选药物中某些芳香杂环的生物电子等排体。
生化探针
吡啶丙氨酸残基的标记或修饰衍生物被用作生化探针,用于研究酶活性位点几何结构、底物特异性及蛋白质-配体相互作用。
操作、储存与安全注意事项
与大多数研究级氨基酸衍生物一样,在操作3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸时应遵守标准实验室安全规程:
- 储存:存放于阴凉干燥处,避免直接光照,置于密封容器中。具体温度建议应以产品质量检验报告(CoA)为准。
- 操作:使用适当的个人防护装备(PPE),包括实验服、手套和护目镜。称量时避免产生粉尘。
- 溶解提示:配制储备液时,建议先溶于稀盐酸(0.1 M)或稀氢氧化钠水溶液,再稀释至目标缓冲体系。
- 稳定性:在推荐储存条件下,该化合物作为干燥固体通常稳定。应避免长时间暴露于潮湿、高温或光照环境中。
使用前请务必查阅Aladdin Scientific提供的最新安全数据表(SDS),以获取全面的危害信息。
常见问题
3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸与其L-对映体有何区别?
3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸与3-(4-吡啶基)-L-丙氨酸是镜像对映体,分子式和分子量相同,但α碳的空间构型不同(R构型vs S构型)。D型不被大多数哺乳动物蛋白酶识别,使含该残基的多肽具有更高的代谢稳定性。在生化和药理学研究中,由于靶蛋白的立体选择性,两种对映体可表现出显著不同的生物活性。
在多肽合成或生物测定中,应如何溶解3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸?
该化合物最方便的溶解方法是溶于水或稀酸水溶液(如0.1 M盐酸)配制浓缩储备液,再稀释至合适的反应缓冲液中。用于固相多肽合成(SPPS)时,通常使用其保护形式(如Fmoc-或Boc-保护衍生物),溶解于DMF或NMP中。大规模使用前,请务必在特定溶剂体系中验证溶解度。
3-(4-吡啶基)-D-丙氨酸是否适用于金属螯合应用?
是的。4-吡啶基侧链中的吡啶氮是多种过渡金属(包括铜、锌和钯)的有效配体。将其引入多肽后,可与主链酰胺氮或其他配位残基共同形成多齿配位环境。这使该化合物在构建金属多肽、超分子结构和催化支架方面具有重要价值。具体的配位几何构型和亲和力取决于金属离子种类及周围的多肽序列。
产品编号A107875提供何种纯度规格?
产品编号A107875的具体纯度信息应以Aladdin Scientific提供的产品质量检验报告(CoA)为准。研究级氨基酸构建模块通常以≥98%纯度(HPLC)供应,但建议客户在用于灵敏应用前,从CoA核实纯度及对映体纯度(ee%)数据。
参考文献
- Barrett, G. C.; Elmore, D. T. Amino Acids and Peptides. Cambridge University Press, 1998. (General reference for amino acid chemistry and properties.)
- Genscript / general literature on D-amino acids in peptide medicinal chemistry: Kolbrun Kristmundsdottir et al. Use of D-amino acids in peptide design — review-level textbook knowledge.
- Metzler-Nolte, N. Bioorganometallic Chemistry of Amino Acids, Peptides and Proteins. Angew. Chem. Int. Ed., 2001. (Reference for metal coordination by amino acid side chains including pyridine-containing residues.)
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
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