6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺:性质与研究用途
6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺:性质与研究用途
6-Chloro-N-methylpyrazin-2-amine is a halogenated, nitrogen-rich heterocyclic building block widely employed in medicinal chemistry and pharmaceutical synthesis as a versatile electrophilic intermediate for the construction of bioactive pyrazine-containing scaffolds.
- IUPAC命名
- 6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺
- 分子式
- C₅H₆ClN₃
- 分子量
- 143.57 g/mol
- CAS号
- 待核实——源材料中未确认
- 货号
- C195280
- 官能团
- 芳香族C–Cl键(亲电位点);仲胺(N–CH₃,亲核位点)
- 核心骨架
- 吡嗪(1,4-二嗪)环
化学特性与结构
6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺属于氯代吡嗪衍生物类化合物,该类平面芳香族二嗪化合物因其富含氢键受体氮原子及良好的药代动力学特性而备受重视。该化合物的吡嗪环在6位带有氯代取代基,2位带有甲氨基,在一个紧凑分子中形成两个正交反应位点。
由于环上氮原子的吸电子效应,芳香族C–Cl键被活化,易于发生亲核芳香取代反应(SNAr),在温和条件下与胺类、硫醇及醇氧化物反应活性较高。同时,仲胺(–NHCH₃)可参与酰化、磺酰化或还原胺化反应,为文库合成提供了进一步衍生的位点。
吡嗪环上的两个氮原子与碳环类似物相比赋予分子较好的水溶性,并有助于药物候选分子获得良好的ADMET特性,这也是吡嗪基团在已获批药物及临床候选化合物中频繁出现的主要原因。
合成与反应性
6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺的合成通常采用二氯吡嗪前体的选择性胺化方法。常见路线包括在严格优化的温度和化学计量条件下,以甲胺对2,6-二氯吡嗪进行受控单取代,实现对某一氯原子的区域选择性。此外,也可采用N-甲基吡嗪-2-胺的定向卤代方法。
在下游合成应用中,该化合物最常在C6氯代位发生SNAr反应。典型亲核试剂包括:用于生成二氨基吡嗪类似物的伯胺和仲胺、提供醚连接产物的醇钠,以及生成硫醚衍生物的硫醇钠。这些转化在适当的溶剂和碱性条件下无需过渡金属催化即可进行,在放大生产中具有实际优势。
当需要与芳基伴侣形成碳-碳或碳-氮键时,还可在C–Cl位进行Buchwald-Hartwig胺化或Suzuki-Miyaura偶联等过渡金属催化交叉偶联反应,从而大幅扩展可获取的化学空间。
研究与制药应用
含卤素和氨基取代基的吡嗪衍生物是激酶抑制剂、抗寄生虫药、抗真菌药及CNS活性化合物中公认的药效基团。6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺作为一种优势构建模块,使药物化学家能够在苗头化合物到先导化合物及先导化合物优化阶段,迅速将甲氨基吡嗪核心引入先导结构。
该化合物还被用作合成更复杂二氨基吡嗪骨架的关键中间体,这类骨架构成了多种蛋白激酶抑制剂的基础。甲氨基提供氢键供体,能够与ATP结合口袋铰链区骨架羰基结合,这是激酶药理学中公认的结合基序。
除药物发现外,6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺还在农用化学品研究、材料科学(如利用吡嗪氮原子螯合能力合成金属有机框架或配位聚合物)以及分析方法开发参比化合物等领域具有应用价值。
操作、储存与安全注意事项
与大多数卤代芳香胺类似,操作6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺时应佩戴适当的个人防护装备,包括丁腈手套、防护眼镜及实验室外套。称量或溶解化合物的操作应在通风良好的通风柜中进行,以尽量减少粉尘或蒸气的吸入暴露。
该化合物应储存于阴凉干燥处,远离强氧化剂、酸和碱。密封容器有助于防止吸潮,长期保持试剂品质。通常建议冷藏(2–8 °C)以长期保持纯度,但具体条件应参照每批次产品随附的质量分析证书(COA)进行确认。
研究人员在使用前应查阅阿拉丁科学提供的安全数据表(SDS),以获取全面的危险分类信息、急救措施、废弃物处理指导及运输法规要求。废弃物处理必须符合适用的地方和国家关于卤代有机化合物的相关法规。
常见问题
6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺在药物发现中有何应用?
该化合物是构建含吡嗪药效基团的多功能杂环构建模块。C6氯代基团可通过SNAr或交叉偶联反应实现骨架多样化,而甲氨基则可与激酶结合口袋铰链区残基结合或进一步官能化,因此在激酶抑制剂项目及苗头化合物到先导化合物优化中具有重要价值。
如何储存6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺以保持其纯度?
将化合物存放于密封容器中,置于阴凉干燥处,避免受潮、远离强氧化剂和直射光。通常建议在2–8 °C冷藏以保证长期稳定性。请务必参照阿拉丁科学随批次提供的质量分析证书(CoA)核实具体储存条件。
6-氯-N-甲基吡嗪-2-胺中的C–Cl键能否进行过渡金属催化的交叉偶联反应?
可以。芳香族C–Cl键与钯催化反应相容,包括用于C–C键形成的Suzuki-Miyaura偶联反应和用于C–N键形成的Buchwald-Hartwig胺化反应。这些反应通常需要合适的钯预催化剂、膦配体和碱,其优化条件可能取决于具体的偶联伴侣和反应规模。
在药物化学中,吡嗪环相较于其他杂环有何优势?
吡嗪环提供两个对位排列的氢键受体环氮原子,可改善水溶性并实现与生物靶点的双齿相互作用。其平面芳香体系有利于π-堆积相互作用,且环的缺电子特性使C–Cl键活化,有利于无需金属催化的SNAr反应,从而促进类似物的快速合成。
参考文献
- Joule, J. A.; Mills, K. Heterocyclic Chemistry, 5th ed.; Wiley-Blackwell: Oxford, 2010. (General reference on pyrazine chemistry and SNAr reactivity.)
- Roughley, S. D.; Jordan, A. M. The Medicinal Chemist's Toolbox: An Analysis of Reactions Used in the Pursuit of Drug Candidates. J. Med. Chem. 2011, 54, 3451–3479. (Discusses prevalence of SNAr and cross-coupling in drug discovery.) doi:10.1021/jm200187y
- Küenburg, B. et al. Development of a Pilot-Scale Synthesis of the Antiparasitic Agent... (Placeholder: pyrazine intermediates in API synthesis — specific reference needs verification.)
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