如何选择血浆游离RNA提取试剂
如何选择血浆游离RNA提取试剂
在分子生物学研究与临床诊断领域,血浆游离RNA(cfRNA)作为一种极具价值的循环生物标志物,正受到日益广泛的关注。然而,由于其含量极微、极易降解,且存在于成分复杂的血浆样本中,如何高效、高质地提取cfRNA便成为了后续所有分析成功与否的基石。
一、什么是外周血,什么是全血,什么是血清,什么是血浆?
v外周血(peripheral blood):指在体表血管(动/静脉、毛细血管)中循环、可通过常规采血获得的血液,相对“骨髓血、脐带血”等而言。
v全血(whole blood):未经分离的完整血液=血浆(液体部分)+血细胞(红细胞、白细胞、血小板)。
v血清(serum):血液凝固后挤出并离心得到的上清液;不含纤维蛋白原和大部分凝血因子。
v血浆(plasma):采血时加抗凝,离心后得到的上清液;保留纤维蛋白原和凝血因子。
名称 | 获取方式 | 是否加抗凝剂 | 典型用途 |
外周血 | 从外周静/动脉或毛细血管采集的循环血;样本形态可为全血/血清/血浆 | 依实验而定 | 临床化验、流式、基因检测等 |
全血 | 采血后不分层直接使用(实验用全血多加抗凝以保持“完整”) | 常加 | 血常规、全血PCR、某些免疫学实验 |
血清 | 不加抗凝→室温凝固→离心取上清 | 否 | 生化指标、抗体/激素/细胞因子等免疫学检测 |
血浆 | 是 | 凝血功能检测、部分生化/分子检测、血浆制品 |
二、血浆游离RNA含量过少,选择何种方法提取?
血浆cfRNA含量极低、片段短且易降解,常用路线主要有三类:①酚-氯仿/TRIzol-LS类有机法;②硅胶磁珠法;③硅胶离心柱法。三者均可获得合格cfRNA,但适配场景与权衡不同:
①酚-氯仿法(含TRIzol-LS)
v适用:预算敏感或需同批回收RNA+蛋白/代谢物的研究型场景。
v要点:推荐加入载体(糖原或线性丙烯酰胺)与相分离助剂(如Phase-Lock Gel),严格控时控温、全程RNase-free。
v局限:有机溶剂操作与批间可变性较大;残留酚/盐会抑制RT-qPCR/文库建库,需充分洗涤或后续纯化。
②硅胶磁珠法
v适用:中—大体积血浆(通常0.5–4 mL及以上)、高通量与自动化平台;便于并联处理与上/下游集成。
v要点:可按体积线性放大;对超短片段(如miRNA)保留度取决于配方与结合盐度,选型需关注对小片段的验证数据。
v局限:不同品牌在回收率/抑制物携带方面差异明显;需校正洗脱体积与洗涤强度以兼顾产量与纯度。
③硅胶离心柱法
v适用:常规体积(单柱装载多为200–600 µL/次,可多次上样或合并多柱洗脱),手工流程、下游RT-qPCR/测序常规应用。
v要点:流程简洁、重现性好;可选miRNA专用或总RNA方案。
v局限:装载体积有限;如需处理≥1 mL血浆,通常需分次装载或前置富集。
三、血浆游离RNA试剂盒的选择标准?
(1)提取得率要高
血浆游离RNA实验中,试剂/试剂盒选型直接决定提取得率。选择不当常导致RNA浓度不足,进而无法开展后续基因克隆、基因/病原核酸检测、测序及分子杂交等分析。优选高回收率、低抑制组分的产品可显著提升起始RNA量与方法灵敏度,从源头提高整体实验成功率。
(2)提取的RNA纯度要高
核酸纯度常用A260/A280判定,即样品在260 nm与280 nm吸光度之比。纯RNA的A260/A280约为2.0(可接受范围通常1.9–2.1)。
v蛋白或酚污染会使A260/A280下降(<2.0)。
vDNA污染亦会使该比值向~1.8靠拢(相对RNA为下降)。
v同时关注A260/A230:理想应>2.0;若显著偏低,多为盐、糖或有机溶剂残留。
实操要点
v选用低抑制组分的试剂/柱,按说明充分洗涤并延长干燥步骤以去除有机残留。
v必要时加入DNase消化,降低基因组DNA干扰。
v全流程防RNase:无RNA酶耗材、戴手套、快速操作与低温保存。
v纯度合格后再进行定量与下游(qPCR、测序、杂交等),可显著提升数据可靠性。
四、阿拉丁的典型产品
Ø游离RNA(血清血浆尿液)提取试剂(货号R665870)本品灵活处理不同起始量的样品,在有效裂解样本的同时,可有效保存RNA的完整性,提取的总RNA完整性好,无蛋白和DNA污染,提取的RNA可用于RT-PCR、Northern Blot和分子克隆等下游实验。
五、常见问答
Q1:血浆样本应如何保存以避免cfRNA降解?
A:血浆游离RNA极易被RNase降解。采血后应立即离心分离血浆,并在2小时内完成RNA提取;若无法即时处理,应将血浆分装后置于−80℃保存,避免反复冻融。建议使用EDTA抗凝管,避免肝素干扰后续酶反应。
Q2:血浆游离RNA的提取体积对结果影响大吗?
A:影响显著。由于cfRNA含量极低,通常需使用≥200 µL的血浆体积以获得足够RNA量。若样本稀少,可通过多次提取并合并RNA溶液的方式提高总体回收量。
Q3:提取后的RNA浓度过低,如何改善?
A:
v提高起始样本量:在保证试剂比例的前提下,适当增加血浆体积。
v优化洗脱体积:可减少最终洗脱体积(例如从50 µL降至30 µL)以提高浓度。
v延长裂解时间或加强混匀:有助于充分释放cfRNA。
v确保试剂新鲜、避免吸附损失:使用低吸附离心管保存RNA。
Q4:为什么提取的RNA纯度(A260/A230)偏低?
A:主要因洗脱液中残留盐、醇或有机物。可通过增加洗涤次数或延长离心干燥时间解决。若偏低明显,说明清洗不彻底或干燥不足,应检查洗涤液体积与离心参数。
Q5:提取的RNA可直接用于下游测序或qPCR吗?
A:可以,但建议在上样前进行纯度与完整性检测。若存在DNA污染,需经DNase I处理。高纯度、高完整性的RNA样本可确保qPCR循环阈值(Ct)稳定、测序数据质量高。
综上所述,成功进行血浆游离RNA研究始于对样本本质的清晰认知,成于对提取方法与试剂的审慎选择。面对cfRNA含量稀少的核心挑战,采用高回收率、高纯度的离心柱法是目前经过实践验证的可靠策略。通过严格考量试剂盒的得率、纯度以及操作便捷性,研究者能够有效突破技术瓶颈,为下游精准的基因表达分析、病原体检测及高通量测序奠定坚实基础。
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