N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶:操作与使用规程
N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶:操作与使用规程
N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶是一种在3位带有伯羟甲基官能团的Cbz保护哌啶构建模块,广泛用作药物化学和药物发现研究中的多功能合成中间体。
- 产品编号
- C121556
- 化学名称
- N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶
- 核心骨架
- 含3-羟甲基取代基的Cbz保护哌啶
- 保护基
- 苄氧羰基(Cbz / Z)
- 关键官能团
- 氨基甲酸酯(Cbz)、伯醇(CH2OH)
- 主要应用
- 药物发现和杂环化学的合成中间体
- 建议储存条件
- 阴凉干燥处储存,避免潮湿和光照
化合物概述与化学性质
N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶(Aladdin产品编号:C121556)是一种哌啶衍生物,其环氮以苄氧羰基(Cbz或Z)氨基甲酸酯形式保护,3位带有伯羟甲基(–CH2OH)基团。Cbz基团是有机合成化学中应用最广泛的氨基保护基之一,在多种反应条件下具有良好稳定性,可通过氢解(H2/Pd-C)或路易斯酸条件实现清洁脱除。
3位的伯醇为进一步结构修饰提供了多功能合成位点:可被氧化为醛或羧酸、转化为离去基团(甲磺酸酯、对甲苯磺酸酯或卤化物),或通过酯化或醚化与其他片段偶联。Cbz保护氮与游离羟基的组合使该化合物成为药物发现和农化研究中汇聚合成策略的理想双官能团构建模块。
安全、储存与操作规程
个人防护装备(PPE):操作N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶时,须佩戴适当的实验室个人防护装备,包括耐化学品手套(推荐丁腈手套)、实验室白大褂及安全眼镜或护目镜。在通风良好的区域或通风橱中操作,以减少粉尘或气溶胶的吸入暴露。
储存:将化合物储存于密封容器中,置于阴凉干燥处,避免直接光照和潮湿。长期暴露于潮湿环境可能导致氨基甲酸酯保护基随时间水解。确保储存区域无不相容化学品;远离强氧化剂、强碱和强酸。
废物处置:依据当地机构和政府关于有机化学废物的法规,对含有该化合物的所有废弃物进行处置。未经核实当地法规前,不得将废液直接倒入下水道。
注意:使用前请查阅本产品(C121556)的安全数据表(SDS),获取完整的危害信息、急救措施和法规分类。
典型合成操作规程
以下操作规程描述了N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶的常见转化反应。所有反应均应由经过培训的化学家在遵守标准实验室安全规范的前提下进行。
操作A:伯醇的甲磺酸酯活化
- 在惰性气氛(N2或Ar)下,将N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶(1.0当量)溶于无水二氯甲烷(DCM,约0.2–0.5 M)中。
- 在冰浴中将溶液冷却至0 °C。
- 加入三乙胺(Et3N,1.5当量),随后逐滴加入甲磺酰氯(MsCl,1.2当量)。
- 使反应体系升温至室温,搅拌1–2小时。用TLC监测反应进程。
- 用饱和NaHCO3水溶液淬灭,用DCM萃取,用MgSO4干燥,过滤,减压浓缩,得到甲磺酸酯中间体。
操作B:氢解脱除Cbz保护基
- 将N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶(1.0当量)溶于甲醇或乙醇(约0.1–0.3 M)中。
- 在惰性气氛下加入10% Pd/C(相对底物质量的10 wt%)。
- 抽真空并充入H2(气球压力,1 atm),重复三次。
- 在H2气氛下于室温剧烈搅拌2–4小时。用TLC或LC-MS监测反应进程。
- 用硅藻土过滤催化剂,用甲醇洗涤,减压浓缩滤液,得到3-(羟甲基)哌啶。
注意:在H2气氛下使用Pd/C进行氢解反应存在火灾和爆炸风险。请确保消除所有点火源,并遵守机构关于高压或气球氢气反应的安全规程。
质量控制与分析表征
建议收到Aladdin产品C121556的研究人员在将其用于关键合成步骤前,先验证化合物的身份和纯度。推荐的分析方法包括:
- 薄层色谱(TLC):在适当溶剂体系(如乙酸乙酯/正己烷 1:3至1:1)中展开化合物,用UV(254 nm)和/或KMnO4显色剂显色。伯醇和Cbz生色团应能清晰检测。
- 核磁共振(NMR):在CDCl3或DMSO-d6中记录1H和13C NMR谱图。确认苄基CH2(约5.1 ppm,2H)、Cbz苯基(7.3–7.4 ppm,5H)、羟甲基CH2(约3.4–3.6 ppm)及哌啶环质子(约1.5–3.8 ppm)的存在。注意,Cbz氨基甲酸酯在室温下可能存在旋转异构体(旋转体),导致NMR信号加宽或重叠。
- 高效液相色谱(HPLC):采用反相HPLC(C18色谱柱,乙腈/水含0.1% TFA梯度,220 nm或254 nm UV检测)评估纯度。
- 质谱(MS):通过ESI-MS或APCI-MS确认分子离子,与预期分子式核对。
请查阅每批C121556随附的分析证书(CoA),获取批次特定的纯度数据和分析结果。
在药物发现和药物化学中的应用
N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶作为一种富含sp3杂化中心、易于官能化的构建模块,在药物化学家的工具库中占据重要地位。哌啶是FDA批准的小分子药物中出现频率最高的环系之一,而3位取代的区域化学选择性为获得与更常见的4位取代类似物不同的药效团空间向量提供了可能。
主要应用领域包括:
- 片段和先导物扩展:羟甲基可转化为胺、醚、酯或卤化物,实现化合物库的快速多样化。
- 接头化学:伯醇可作为化学生物学探针及PROTAC/降解剂分子中PEG接头、弹头或报告基团的连接位点。
- 不对称合成:3位手性中心(在对映纯形式中)可用于在目标分子中引入手性。
- 天然产物合成:Cbz-哌啶骨架作为核心基序出现在众多仿生物碱合成研究方案中。
研究人员应通过查阅CoA或联系Aladdin Scientific技术支持,确认所收到批次的立体化学构型(外消旋体或对映纯体)。
常见问题
如何从N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶上脱除Cbz保护基?
Cbz基团最常通过催化氢解脱除:在室温下,在10% Pd/C存在下,将化合物在甲醇或乙醇中于1 atm H2气氛中搅拌2–4小时,然后过滤硅藻土并浓缩。当分子中其他官能团与H2/Pd-C不相容时,也可采用路易斯酸条件(如TMSBr或HBr/乙酸)脱除保护基。
为什么该化合物的NMR信号出现加宽或重叠?
Cbz氨基甲酸酯在室温下因N–C(O)键旋转受阻而产生旋转异构体混合物,在NMR谱图中表现为信号加宽或重叠,这是正常的物理性质,并非杂质所致。将NMR样品加热(例如在DMSO-d6中升温至50–60 °C)或在较高温度下采集谱图,通常可使信号合并为尖锐的单峰。
N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶是否有单一对映体供应?
外消旋混合物与单一对映体的商业供应情况因供应商和批次而异。请查阅产品C121556当前的分析证书(CoA),或联系Aladdin Scientific技术支持团队确认现有库存的立体化学规格。
哪些溶剂适合用于N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶的合成反应?
该化合物通常可溶于常见有机溶剂,包括二氯甲烷、THF、乙酸乙酯、甲醇、乙醇、DMF和DMSO。对于涉及羟基的无水反应(如甲磺酰化、对甲苯磺酰化),应使用干燥溶剂(DCM、THF)并在惰性气氛条件下进行。由于化合物具有适中的极性,水相后处理操作较为简便。
应如何储存C121556以长期保持其品质?
将N-Cbz-(3-羟甲基)哌啶储存于密封容器中,置于阴凉干燥处,避免光照和潮湿。Cbz氨基甲酸酯在长期暴露于潮湿或强酸/强碱条件下易发生水解,因此建议在干燥剂存在下储存。如需长期储存,建议在惰性气体保护下于2–8 °C冷藏。
参考文献
- Wuts, P. G. M.; Greene, T. W. Greene's Protective Groups in Organic Synthesis, 4th ed.; Wiley-Interscience: Hoboken, NJ, 2007.
- Roughley, S. D.; Jordan, A. M. The Medicinal Chemist's Toolbox: An Analysis of Reactions Used in the Pursuit of Drug Candidates. J. Med. Chem. 2011, 54, 3451–3479. doi:10.1021/jm200187y
- Vitaku, E.; Smith, D. T.; Njardarson, J. T. Analysis of the Structural Diversity, Substitution Patterns, and Frequency of Nitrogen Heterocycles among U.S. FDA Approved Pharmaceuticals. J. Med. Chem. 2014, 57, 10257–10274. doi:10.1021/jm501100b
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