重组人ATRIP蛋白:操作与使用实验方案
重组人ATRIP蛋白:操作与使用实验方案
Recombinant Human ATRIP Protein is a critical reagent for investigating the ATR-mediated DNA damage checkpoint pathway, and this protocol ensures its optimal reconstitution, storage, and functional deployment in your assays.
- 产品名称
- 重组人ATRIP蛋白
- 货号
- rp367058
- 蛋白功能
- ATRIP(ATR相互作用蛋白)是ATR激酶的必要结合伴侣,对ATR募集至DNA损伤及复制压力位点的RPA包被单链DNA至关重要。
- 建议储存条件
- 长期储存于-80°C;通过制备单次使用分装品避免反复冻融。
- 复溶方式
- 按产品数据表建议,使用无菌超纯水或适当缓冲液(如含0.1% BSA的PBS)进行复溶。
- 主要研究应用
- 生化结合实验、ATR-ATRIP复合物重建研究、DNA损伤检查点研究及蛋白质印迹阳性对照。
背景:ATRIP与ATR介导的DNA损伤应答
ATRIP(ATR相互作用蛋白)是DNA损伤应答(DDR)通路中的关键调控蛋白。它与ATR(共济失调毛细血管扩张和Rad3相关)激酶形成稳定的异源二聚体复合物,ATR是复制压力应答的核心调控因子。当DNA损伤发生时——尤其是停滞的复制叉或加工后的双链断裂处暴露的单链DNA(ssDNA)——RPA(复制蛋白A)迅速包被暴露的ssDNA。ATRIP直接识别RPA-ssDNA复合物,从而将ATR-ATRIP复合物募集至DNA损伤位点。这一募集事件是激活下游检查点效应因子的关键起始步骤,包括CHK1激酶的磷酸化,以阻止细胞周期进展,为DNA修复争取时间。
重组人ATRIP蛋白(rp367058)使研究人员能够在体外重建上述分子事件,为研究ATR-ATRIP复合物组装、蛋白质-蛋白质相互作用及检查点激活机制提供明确且可控的系统。
所需材料
- 重组人ATRIP蛋白,货号rp367058(Aladdin Scientific)
- 无菌、无核酸酶超纯水(18.2 MΩ·cm)
- 复溶缓冲液:磷酸盐缓冲液(PBS,pH 7.4)补充0.1% BSA(牛血清白蛋白)作为载体蛋白,或按产品数据表指定配方
- 低蛋白结合微量离心管(1.5 mL)
- 经校准的微量移液器及无菌吸头
- 台式微量离心机
- 干冰或液氮(用于快速冻结分装品)
- -80°C冰箱(长期储存)
- BCA或Bradford蛋白定量试剂盒(用于浓度验证)
- SDS-PAGE及蛋白质印迹试剂(可选,用于质量控制)
操作步骤:复溶、分装与储存
第一步 – 复溶前准备
- 从-80°C储存中取出小瓶,在冰上短暂平衡(切勿在室温下融化,以减少蛋白降解)。
- 短暂离心小瓶(1,000 × g,10秒),使冻干物质集中在瓶底。
- 提前准备好所有复溶缓冲液和低蛋白结合管,置于冰上备用。
第二步 – 复溶
- 按产品数据表规定,将推荐体积的无菌超纯水或PBS + 0.1% BSA缓冲液直接加入小瓶中。沿瓶壁轻柔移液,切勿涡旋振荡。
- 将小瓶在冰上静置5–10分钟,使蛋白充分溶解。
- 在手掌间轻柔滚动小瓶10–15秒以确保均匀混合;目视检查是否有颗粒物。
第三步 – 浓度验证(推荐)
- 取少量等份(通常1–2 µL),使用BCA或Bradford法测定蛋白浓度。
- 将测定浓度与质量检验证书(CoA)数值进行比较,确认回收率符合预期。
第四步 – 分装
- 将复溶蛋白分装至低蛋白结合微量离心管中,按单次使用量分装。分装量应与典型实验用量相符,避免剩余蛋白需再次冻存。
- 分装完成后立即在干冰或液氮中快速冻结。
第五步 – 储存
- 将快速冻结的分装品储存于-80°C。避免反复冻融,每次冻融循环均可显著降低蛋白活性和完整性。
- 短期使用(24–48小时内),分装品可保存于4°C;不建议在4°C长期储存。
实验应用与整合
重组人ATRIP蛋白(rp367058)适用于多种体外研究应用:
- 蛋白质-蛋白质相互作用研究:将ATRIP用作pull-down或共免疫沉淀实验中的诱饵或猎物蛋白,以绘制其与ATR、RPA70 N端结构域及其他DDR因子的相互作用图谱。
- 生化重建:与重组ATR一同重建ATR-ATRIP异源二聚体,研究激酶激活、底物磷酸化(如CHK1 Ser317/Ser345)及TopBP1或ETAA1激活因子的调控机制。
- ELISA和结合实验:在夹心ELISA格式中用作捕获或检测抗原,以验证抗体特异性或测量结合亲和力。
- 蛋白质印迹阳性对照:在细胞裂解液旁加入定量重组ATRIP,以确认抗体性能并验证预期分子量处的条带大小。
- 结构与生物物理学研究:可作为SPR(表面等离子体共振)、ITC(等温滴定量热法)或冷冻电镜样品制备的组分,需预先验证纯度和缓冲液相容性。
注意:实验使用前请对照产品数据表和质量检验证书确认具体应用的适用性。
故障排除指南
| 问题 | 可能原因 | 建议解决方案 |
|---|---|---|
| 蛋白未完全溶解 | 复溶体积不足或温度过低 | 适量增加缓冲液体积;在冰上延长平衡时间;轻柔滚动——切勿涡旋 |
| 蛋白浓度低于预期 | 蛋白因吸附于管壁而损失 | 使用低蛋白结合管;在复溶缓冲液中添加载体蛋白(BSA) |
| 储存后活性丧失 | 反复冻融或储存温度不当 | 确保分装品快速冻结并储存于-80°C;使用单次使用分装品 |
| 蛋白质印迹出现非特异性条带 | 蛋白聚集或降解 | 使用前在4°C以10,000 × g离心5分钟;验证储存条件 |
| pull-down实验中检测不到ATR相互作用 | 缓冲液离子强度不当或缺少辅因子 | 优化盐浓度(通常100–150 mM NaCl);若需要激酶活性,加入ATP和Mg²⁺ |
常见问题
重组人ATRIP蛋白(rp367058)推荐使用何种复溶缓冲液?
蛋白应使用无菌超纯水或含0.1% BSA载体蛋白的PBS(pH 7.4)进行复溶,以减少吸附损失。请始终参阅具体产品数据表获取最新复溶说明,因配方细节可能因批次而异。
如何储存重组人ATRIP蛋白以保持其活性?
为长期保存,将单次使用分装品在干冰或液氮中快速冻结后储存于-80°C。避免反复冻融,因为每次冻融循环都会逐渐降低蛋白完整性和活性。对于24–48小时内的实验,分装品可保存于4°C,但不建议长期冷藏储存。
重组人ATRIP蛋白的主要研究应用有哪些?
重组人ATRIP蛋白主要用于研究DNA损伤应答中的ATR-ATRIP检查点复合物。主要应用包括与ATR和RPA的体外结合实验、ATR-ATRIP异源二聚体的生化重建、蛋白质印迹阳性对照、ELISA抗原制备,以及SPR或ITC等生物物理相互作用研究。
为何ATRIP被认为对ATR激酶活性至关重要?
ATRIP是ATR的必要结合伴侣;两种蛋白作为稳定的异源二聚体复合物共同表达和发挥功能。ATRIP含有RPA结合结构域,介导整个ATR-ATRIP复合物募集至损伤位点的RPA包被ssDNA处。若没有ATRIP,ATR无法有效定位至DNA损伤位点,也无法激活包括CHK1磷酸化在内的检查点级联反应。
在用于灵敏实验前,如何验证复溶ATRIP蛋白的质量?
建议进行两个质量控制步骤:首先,使用BCA或Bradford法测定蛋白浓度,并与CoA标注值比较以确认预期回收率。其次,在还原条件下进行SDS-PAGE,验证在预期分子量处出现单一主要条带。使用经验证的抗ATRIP抗体进行蛋白质印迹是可选的确认性鉴定手段。
参考文献
- Cortez D, Guntuku S, Qin J, Elledge SJ. ATR and ATRIP: partners in checkpoint signaling. Science. 2001;294(5547):1713-1716. doi:10.1126/science.1065521
- Zou L, Elledge SJ. Sensing DNA damage through ATRIP recognition of RPA-ssDNA complexes. Science. 2003;300(5625):1542-1548. doi:10.1126/science.1083430
- Ball HL, Cortez D. ATRIP oligomerization is required for ATR-dependent checkpoint signaling. Journal of Biological Chemistry. 2005;280(36):31390-31396. doi:10.1074/jbc.M504961200
- Aladdin Scientific. Recombinant Human ATRIP Protein, SKU rp367058. Product Datasheet.
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
危险品化学品经营许可证(带存储)