重组人GID4蛋白:生物学特性与研究指南
重组人GID4蛋白:生物学特性与研究指南
Recombinant Human GID4 Protein是GID/CTLH E3泛素连接酶复合物的关键底物识别亚基,可选择性靶向携带Pro/N-末端降解信号的蛋白质,使其经蛋白酶体途径降解,是研究N-末端降解途径及泛素介导蛋白水解的重要工具。
- 蛋白名称
- 重组人GID4蛋白
- 产品编号
- rp372882
- 生物学功能
- GID/CTLH E3泛素连接酶复合物的底物识别亚基;识别Pro/N-末端降解序列
- 相关通路
- Pro/N-末端降解途径(N-末端规则途径的分支)
- 物种来源
- 人(智人)
- 研究应用
- 生化检测、蛋白质相互作用研究、结构研究、底物鉴定
GID4是什么?生物学背景
GID4(又称C17orf39)是由人类GID4基因编码的蛋白质,作为GID/CTLH(葡萄糖诱导降解/LisH C端)E3泛素连接酶复合物的主要底物识别受体发挥功能。GID/CTLH复合物是酵母Gid复合物的哺乳动物同源物,后者最初在酿酒酵母葡萄糖诱导代谢转换过程中被鉴定为糖异生酶降解的调控因子。
在泛素蛋白酶体系统(UPS)中,GID4专门识别携带Pro/N-末端降解信号的底物——该降解信号由N端脯氨酸或起始甲硫氨酸切割后暴露的脯氨酸所定义。通过与底物N端脯氨酸残基对接,GID4将底物募集至GID/CTLH复合物,后者催化底物多聚泛素化并经蛋白酶体途径降解。这一选择性识别机制使GID4处于广义N-末端降解途径中Pro/N-末端降解分支的核心位置。
GID4依赖性底物周转的失调与细胞周期进程、代谢重编程及潜在致癌过程相关,使GID4成为基础研究和转化研究领域的重要关注对象。
蛋白特征与制备
Aladdin Scientific提供的重组人GID4蛋白(货号:rp372882)采用重组表达系统生产,以确保高纯度和批次间一致性。研究人员需关注以下要点:
- 重组来源:通过异源表达体系生产,避免了组织纯化材料固有的批次差异。
- 人源序列:反映天然人GID4序列,确保与人类细胞生物学研究的相关性。
- 用途说明:专为体外研究应用设计,不适用于治疗、诊断或体内用途。
关于精确分子量、配方缓冲液、纯度等级、储存条件及批次特异性数据,研究人员应参阅随批次提供的质量检验报告(CoA)以及Aladdin Scientific提供的详细产品说明书。
研究应用
重组人GID4蛋白是适用于多种生化及细胞生物学实验的多功能试剂:
- 底物鉴定:用于pull-down或共免疫沉淀实验,以鉴定与GID4底物识别域结合的新型Pro/N-末端降解底物。
- 生化检测:适用于基于ELISA的相互作用检测、表面等离子体共振(SPR)及等温滴定量热法(ITC),用于表征GID4-底物结合动力学和亲和力。
- 结构研究:可用于X射线晶体学或冷冻电镜研究,以解析GID4单独或与底物/其他GID/CTLH亚基复合物的结构。
- 重建泛素化实验:可与E1、E2酶及其他GID/CTLH复合物组分共同纳入体外泛素化反应体系,用于研究底物多聚泛素化。
- 药物发现:可作为靶标蛋白用于小分子或多肽抑制剂筛选,以调控Pro/N-末端降解途径。
研究细胞周期调控、代谢信号传导或靶向蛋白降解(PROTAC)策略的研究人员,可能发现GID4作为可劫持E3连接酶组分具有特别重要的价值。
操作、储存与质量注意事项
为维护蛋白完整性和实验可重复性,使用重组人GID4蛋白时建议遵循以下通用最佳实践:
- 储存:按照产品说明书和CoA中规定的条件储存。重组蛋白通常在−80°C长期保存。避免反复冻融,以防止蛋白聚集和活性丧失。
- 分装:首次解冻后,将蛋白分装为单次使用量,以减少冻融损伤。
- 操作:使用过程中置于冰上,尽量减少室温暴露时间;使用低蛋白结合离心管以降低吸附损失。
- 质量验证:在关键实验前,通过SDS-PAGE验证蛋白完整性,并采用适当的功能性检测方法确认活性。
- 缓冲液兼容性:参阅说明书,确认所提供配方缓冲液与下游实验条件的兼容性;某些应用可能需要透析或缓冲液置换。
注意:具体储存温度、配方详情、纯度百分比及活性数据因批次而异,请始终参阅您所购批次随附的CoA。
GID4在靶向蛋白降解中的意义
靶向蛋白降解(TPD)这一新兴领域已引发了利用E3泛素连接酶降解疾病相关靶蛋白的广泛兴趣。GID4作为GID/CTLH复合物中可被配体靶向的底物受体,已作为PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)和分子胶策略中潜在E3连接酶工具备受关注。
由于GID4识别明确的结构特征——N端脯氨酸——这为小分子配体设计提供了可操作的结合口袋。研究人员已开始探索基于GID4的PROTAC,利用该识别口袋将新底物(本身不携带Pro/N-末端降解信号的目的蛋白)募集至GID/CTLH复合物,从而定向驱动其泛素化和降解。
这一应用使重组人GID4蛋白不仅成为N-末端降解途径基础研究的重要生化工具,也成为快速扩展中的TPD药物发现管线的有力支撑。从事化学生物学、药物化学或癌症生物学研究的实验室,可考虑将该蛋白纳入研究工具库。
常见问题
GID4蛋白的生物学作用是什么?
GID4作为GID/CTLH E3泛素连接酶复合物的底物识别受体,专门识别携带N端脯氨酸残基(Pro/N-末端降解信号)的蛋白质,将其募集至复合物并促进其多聚泛素化和蛋白酶体降解。这一功能使GID4成为N-末端降解途径中Pro/N-末端降解分支的核心调控因子。
重组人GID4蛋白适用于哪些研究应用?
重组人GID4蛋白适用于生化相互作用检测(pull-down、SPR、ITC)、底物鉴定、体外泛素化实验、结构生物学研究(晶体学、冷冻电镜)以及小分子抑制剂筛选。此外,该蛋白还用于靶向蛋白降解研究,包括利用GID4底物结合口袋的PROTAC开发。
如何储存重组人GID4蛋白以维持其活性?
重组蛋白通常在−80°C长期保存以维持稳定性。应避免反复冻融;首次解冻后立即分装为单次使用量。使用过程中置于冰上,并使用低蛋白结合离心管。请始终参照产品说明书及随批次提供的质量检验报告(CoA)中规定的具体储存条件。
GID4为何与PROTAC及靶向蛋白降解研究相关?
GID4具有识别N端脯氨酸残基的明确结合口袋,使其成为PROTAC设计中颇具吸引力的E3连接酶工具。通过开发与该口袋结合的小分子配体,研究人员可构建双功能分子,将GID4/CTLH复合物活性重定向至非天然底物,从而实现对疾病相关靶蛋白的选择性降解。
如何确认重组人GID4蛋白批次的质量和纯度?
每批重组人GID4蛋白均附有质量检验报告(CoA),提供批次特异性数据,包括纯度(通常通过SDS-PAGE和/或HPLC评估)、分子量确认及内毒素水平。研究人员还可在实验室内通过SDS-PAGE凝胶电泳进行完整性验证,并根据具体应用选择合适的功能性检测方法。
参考文献
- Dong C, et al. Molecular basis of GID4-mediated recognition of degrons for the Pro/N-end rule pathway. Nature Chemical Biology, 2018. doi:10.1038/s41589-018-0036-1
- Sherpa D, et al. GID E3 ligase supramolecular chelate assembly configures multipurpose ubiquitin ligation. Nature Structural & Molecular Biology, 2021. doi:10.1038/s41594-021-00652-z
- Yoshida Y, et al. Ubiquitination of exposed glycine at the N-terminus of proteins by the GID4/CTLH E3 ligase complex. Science, 2021.
- Varshavsky A. N-degron and C-degron pathways of protein degradation. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 2019. doi:10.1073/pnas.1816596116
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