重组人GPN1蛋白:特性与研究应用
重组人GPN1蛋白:特性与研究应用
Recombinant Human GPN1 Protein是一种研究级GPN环GTP酶,参与RNA聚合酶II的生物发生与核输入过程,为解析真核转录机器组装提供了定义明确的生化研究工具。
- 蛋白名称
- GPN环GTP酶1(GPN1);又名XAB1、MBD2相互作用蛋白
- 基因ID(人类)
- 11321(NCBI基因,智人GPN1)
- 蛋白家族
- GPN环GTP酶家族(GPN1、GPN2、GPN3)
- 主要生物学功能
- 促进RNA聚合酶II亚基的核输入与组装
- 货号
- rp374510
- 物种来源
- 人(智人)
- 产品形式
- 重组蛋白;具体制剂详情见产品数据表
GPN1是什么?基因、蛋白家族与生物学背景
GPN1(GPN环GTP酶1)是GPN环GTP酶蛋白家族的成员,人类中该家族包含三个旁系同源物:GPN1、GPN2和GPN3。该家族的特征是在GTP酶结构域的开关II区存在一个保守的GPN基序(Gly-Pro-Asn),使这些蛋白区别于其他GTP酶超家族成员。
人类GPN1基因(NCBI基因ID:11321)编码的蛋白在多种研究背景下被独立鉴定,因此产生了多个别名,包括XAB1(XPA结合蛋白1)和MBD2相互作用蛋白。该蛋白最初被描述为与核苷酸切除修复蛋白XPA相互作用的因子,后续研究主要将GPN1定性为参与RNA聚合酶II(RNAPII)生物发生的必需伴侣样GTP酶。
GPN1的同源蛋白在真核生物中高度保守,凸显了该蛋白在真核细胞生物学中的基本重要性。在酵母和哺乳动物细胞中进行的功能缺失研究一致表明,GPN1对细胞存活至关重要,这与其在维持功能性转录机器中的关键作用相符。
分子功能:在RNA聚合酶II核输入与组装中的作用
GPN1最广为研究的功能是其在RNA聚合酶II生物发生中的作用。RNA聚合酶II负责转录真核生物中所有蛋白质编码基因,是一个大型多亚基复合体(人类中有12个亚基,RPB1–RPB12),其正确组装和核定位需要专用的分子伴侣和组装因子。
GPN1与GPN2、GPN3共同构成RNAPII亚基细胞质组装途径的一部分。现有证据支持如下模型:GPN1(及相关GPN环GTP酶)在细胞质中与RNAPII亚基相互作用,并可能通过桥接与输入蛋白机器的相互作用来促进其核输入。GPN1的GTP水解被认为可驱动构象变化,从而在组装途径的适当阶段调控底物亚基的结合与释放。
GPN1功能的破坏导致RNAPII亚基(包括RPB1和RPB2)在细胞质中滞留,进而导致整体转录受损。这一表型已在酵母、果蝇和人类细胞模型中得到证实,验证了GPN1在不同物种间保守的机制作用。
此外,GPN1还与DNA损伤应答途径的组分存在相互作用,提示其在RNAPII生物发生之外可能具有其他潜在功能,这些方面仍是活跃的研究领域。
重组人GPN1蛋白的生化特性
重组人GPN1蛋白(阿拉丁科学货号:rp374510)采用重组表达系统生产,是特性明确的研究试剂。作为GPN环GTP酶,重组蛋白保留了GTP酶结构域相关的典型核苷酸结合和水解活性,适用于GTP结合、水解动力学及蛋白质-蛋白质相互作用分析等生化研究。
设计实验时需考虑的GPN1关键生化特性包括:
- GTP酶活性:GPN1能够结合并水解GTP。研究人员应参照随附数据表或通过实验滴定验证核苷酸需求及最优条件(Mg²⁺浓度、pH、温度)。
- 分子量:全长人GPN1的理论分子量约为37–38 kDa;SDS-PAGE上的表观分子量可能因构建体及所含亲和标签的不同而有所差异。
- 纯度与制剂:重组蛋白的纯度和缓冲液组成详见产品数据表(PP-8308系列)。研究人员应查阅数据表以了解储存条件、建议工作浓度及冻融操作指南。
- 标签信息:应从产品数据表确认亲和标签详情(如His标签、GST标签),以确保与下游检测或pull-down分析的兼容性。
与所有重组蛋白一样,建议终端用户在关键实验前,先在特定分析体系中对活性进行验证。
研究应用与实验注意事项
重组人GPN1蛋白是一种用途广泛的试剂,可应用于细胞生物学、生物化学和分子生物学研究的多种实验策略:
- 体外GTP酶分析:测定内在或受激发的GTP水解速率,以表征GPN1的生化活性,并筛选影响核苷酸转换的调节因子或结合伴侣。
- 蛋白质-蛋白质相互作用研究:将重组GPN1用作pull-down分析中的诱饵或猎物、共免疫沉淀对照,或表面等离子体共振(SPR)/生物层干涉(BLI)实验,以绘制其与RNAPII亚基、输入蛋白、GPN2、GPN3或其他细胞因子的相互作用网络。
- 结构生物学:重组GPN1可作为X射线晶体学、冷冻电镜或核磁共振研究的材料,用于阐明GTP结合、水解及底物蛋白相互作用的结构基础。
- 抗体验证和免疫印迹标准品:用作阳性对照抗原,以验证抗GPN1抗体的特异性,并建立免疫印迹实验的定量标准。
- 重组分析:参与利用纯化组分研究RNAPII亚基组装或核输入机制的体外重组系统。
- 药物发现与抑制剂筛选:作为纯化的GTP酶,GPN1蛋白可支持针对GPN环GTP酶家族的小分子抑制剂高通量筛选。
研究转录调控、RNA聚合酶生物发生、核转运机制或基因组完整性通路的研究人员,将发现重组人GPN1蛋白是其实验工具箱的重要补充。
储存、操作与质量保证
妥善储存和操作重组人GPN1蛋白对于保持生物活性和实验重复性至关重要。重组蛋白的一般最佳实践如下:
- 储存温度:长期保存请置于–80 °C。根据制剂不同,短期储存于–20 °C可能可行;请参阅产品数据表获取具体指导。
- 冻融循环:尽量减少反复冻融次数,以避免蛋白质活性降低和聚集。强烈建议收货后立即分装。
- 工作浓度:针对每种分析类型通过实验确定最优工作浓度。请参阅数据表中的建议范围。
- 无菌与污染控制:当蛋白质用于细胞实验时,应在无菌条件下操作。
- 质量控制:阿拉丁科学的重组蛋白均经过质量控制检测;典型的质控参数包括SDS-PAGE纯度评估以及(如适用)功能活性验证。请查阅随产品批次提供的分析证书(CoA)。
如需重组人GPN1蛋白(rp374510)的技术支持或有相关问题,请联系阿拉丁科学技术支持团队。
常见问题
GPN1在人类细胞中的功能是什么?
GPN1是一种GPN环GTP酶,在RNA聚合酶II(RNAPII)的生物发生中发挥重要作用。它促进RNAPII亚基在细胞质中的核输入和正确组装。GPN1功能缺失导致RNAPII亚基在细胞质中滞留,进而损害整体转录。
重组人GPN1蛋白适用于哪些实验应用?
重组人GPN1蛋白(rp374510)适用于体外GTP酶活性分析、蛋白质-蛋白质相互作用研究(pull-down、SPR、BLI)、作为阳性对照抗原进行抗体验证、结构生物学研究、核输入或RNAPII组装重组分析,以及针对GPN环GTP酶家族的小分子抑制剂筛选。
应如何储存重组人GPN1蛋白以维持其活性?
为长期保存,重组人GPN1蛋白应储存于–80 °C。应尽量减少反复冻融次数;强烈建议收货后立即分装。请务必查阅产品专用数据表和分析证书,以了解所收批次的制剂详情和确认的储存建议。
GPN1蛋白有哪些别名?
GPN1在多种研究背景下被独立鉴定,也被称为XAB1(XPA结合蛋白1)和MBD2相互作用蛋白。基因符号GPN1和GPN环GTP酶1的命名现已成为文献中使用的标准命名法。
GPN1在不同物种间是否保守?
是的,GPN1的同源蛋白在真核生物中高度保守,从酵母到人类均有分布。在酵母、果蝇和哺乳动物细胞模型中进行的功能研究均证实了GPN1在RNAPII生物发生中的重要作用,确认了该蛋白家族在真核生物进化过程中保守的机制重要性。
参考文献
- Forget D, Lacombe AA, Cloutier P, Al-Khoury R, Bouchard A, Lavallée-Adam M, Faubert D, Jeronimo C, Blanchette M, Coulombe B. The protein interaction network of the human transcription machinery reveals a role for the conserved GTPase RPAP4/GPN1 and microtubule assembly in nuclear import and biogenesis of RNA polymerase II. Mol Cell Proteomics. 2010.
- Niesser J, Wagner FR, Kostrewa D, Mühlbauer M, Gärtner W, Cramer P, et al. Structure of GPN-loop GTPase Npa3 and implications for RNA polymerase II assembly. Mol Cell Biol. 2016.
- Carre C, Shiekhattar R. Human GTPases associate with RNA polymerase II to mediate its nuclear import. Mol Cell Biol. 2011.
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
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