重组人MBD4蛋白:操作与使用实验方案
重组人MBD4蛋白:操作与使用实验方案
Recombinant Human MBD4 Protein 是一种研究级重组蛋白,专为DNA错配修复、甲基-CpG结合及表观遗传调控研究而设计。
- 产品名称
- 重组人MBD4蛋白
- 货号
- rp377562
- 蛋白功能
- 参与DNA修复的甲基-CpG结合及DNA糖基化酶活性
- 应用
- 表观遗传学研究、DNA修复实验、生化研究
- 储存建议
- 避免反复冻融;长期储存于-80°C
- 物种来源
- 人(智人)
背景:MBD4生物学及研究意义
甲基-CpG结合结构域蛋白4(MBD4)是一种核蛋白,在基因组稳定性维持中发挥双重作用。其N端含有甲基-CpG结合结构域(MBD),可选择性识别对称甲基化的CpG二核苷酸;C端含有胸腺嘧啶DNA糖基化酶(TDG)结构域,负责碱基切除修复(BER)。
MBD4特异性切除甲基化CpG位点上与鸟嘌呤错配的胸腺嘧啶和尿嘧啶,从而抑制胞嘧啶自发脱氨基所引起的突变后果。MBD4功能缺失突变与结直肠癌及CpG位点C→T转换频率升高有关。
重组人MBD4蛋白是研究表观遗传调控、DNA甲基化偶联修复机制及癌症生物学的重要工具。
试剂制备与复溶
收到产品后,开封前先以低速(如1,000 × g,离心30秒)短暂离心,将管壁和管盖上的残余物收集至管底。
复溶:将冻干的重组人MBD4蛋白用无菌去离子水或适当缓冲液(如含0.1% BSA的PBS,或含150 mM NaCl和10%甘油的50 mM Tris-HCl,pH 7.5)复溶。缓慢加入复溶缓冲液,轻轻旋转小瓶混匀;切勿涡旋振荡,以防蛋白变性或聚集。
工作浓度:针对每种具体实验,通过实验摸索最适工作浓度。制备工作分装液以减少反复冻融次数。
注意:具体复溶体积和缓冲液组成应以货号rp377562随附产品说明书为准。
储存与操作规范
短期储存(不超过1周):将复溶后的蛋白储存于4°C,保持小瓶密封以防污染和蒸发。
长期储存:将复溶后的蛋白分装为单次用量,储存于-80°C,以减少反复冻融造成的蛋白活性损失和降解。
冻融次数:冻融次数应限制在2-3次以内。每次额外冻融均可能导致生物活性下降和蛋白聚集增加。
注意事项:避免长时间暴露于室温、反复冻融,以及存放于具有温度波动的无霜冰箱中。
注意:货号rp377562的具体储存条件请以随附产品说明书为准。
推荐应用与实验操作规程
重组人MBD4蛋白(rp377562)适用于以下研究应用:
- DNA糖基化酶活性检测:利用MBD4检测甲基化双链DNA底物中CpG位点G:T或G:U错配处胸腺嘧啶或尿嘧啶的碱基切除活性。典型实验格式包括放射性或荧光标记寡核苷酸切割实验。
- 电泳迁移率变动实验(EMSA):验证MBD4与含甲基化CpG的DNA探针的结合,用于研究蛋白质-DNA相互作用。
- 蛋白相互作用研究:用于pull-down或共免疫沉淀实验,以鉴定错配修复和表观遗传调控通路中的结合伴侣。
- Western Blot阳性对照:用作抗MBD4抗体验证的阳性对照。
针对每种应用,优化蛋白浓度、缓冲液组成、温度和孵育时间,并在每次实验中设置适当的阳性和阴性对照。
质量控制与故障排查
质量控制:重组人MBD4蛋白在关键实验前应通过SDS-PAGE和/或Western blot进行验证。请参照随附质量检验报告(CoA)确认分子量、纯度及批次间一致性。
常见问题及解决方案:
- 活性低或无活性:确认蛋白未经历过多冻融循环。确保实验缓冲液pH、盐浓度和辅因子已优化。如需要,确认DNA底物已被正确甲基化。
- 蛋白聚集:使用前在4°C以10,000 × g离心5分钟去除聚集体。可考虑添加载体蛋白(如BSA)。
- SDS-PAGE出现意外条带:少量额外条带可能代表翻译后修饰或降解产物;请参照CoA查看预期纯度图谱。
如需进一步技术支持,请携带批号及实验详情联系Aladdin Scientific技术支持团队。
常见问题
重组人MBD4蛋白的推荐复溶缓冲液是什么?
重组人MBD4蛋白通常用无菌去离子水或含0.1% BSA的PBS等生理缓冲液复溶,也可使用含甘油的Tris-HCl缓冲液以稳定活性。具体复溶缓冲液和体积请以产品说明书(货号:rp377562)为准。
重组人MBD4蛋白应如何储存以维持活性?
短期使用(不超过一周)时,将复溶后的蛋白密封储存于4°C。长期储存时,分装为单次用量后储存于-80°C。避免反复冻融,每次冻融循环均可能逐步降低蛋白活性。
重组人MBD4蛋白经过验证的应用有哪些?
重组人MBD4蛋白(rp377562)适用于DNA糖基化酶活性检测、研究甲基-CpG DNA结合的EMSA实验、蛋白相互作用研究(pull-down、共免疫沉淀),以及作为Western blot实验的阳性对照。各应用的最优条件需通过实验摸索确定。
为什么重组人MBD4蛋白在我的实验中可能表现出活性降低或无活性?
活性降低可能由反复冻融、蛋白聚集、缓冲液条件不佳(pH、盐浓度或辅因子浓度不当),或在需要甲基化DNA底物时使用了未甲基化DNA底物所致。使用前离心蛋白溶液、优化实验条件并验证底物甲基化状态,可解决上述问题。
参考文献
- Hendrich B, Hardeland U, Ng HH, Jiricny J, Bird A. The thymine glycosylase MBD4 can bind to the product of deamination at methylated CpG sites. Nature. 1999;401(6750):301-304. doi:10.1038/45843
- Bellacosa A, Cicchillitti L, Schepis F, et al. MED1, a novel human methyl-CpG-binding endonuclease, interacts with DNA mismatch repair protein MLH1. Proc Natl Acad Sci USA. 1999;96(7):3969-3974. doi:10.1073/pnas.96.7.3969
- Aladdin Scientific. Recombinant Human MBD4 Protein, SKU rp377562. Product Datasheet.
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
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