常见问题(FAQs)

SiR Dye 1:特性、应用及常见问题解答

SiR dye 1是一种基于硅罗丹明的远红色荧光染料,专为活细胞标记和超分辨率荧光显微镜应用而设计。

产品名称
SiR Dye 1
货号
S1451912
染料类别
硅罗丹明(SiR)远红色荧光染料
主要应用
活细胞荧光及超分辨率显微镜成像(如STED、SIM、STORM)
主要优势
细胞可渗透,因环境敏感荧光特性而具有低背景信号
参考编号/交叉参考
MCE-TJY:HY-D1103

SiR Dye 1是什么?

SiR Dye 1(货号S1451912)是硅罗丹明(SiR)荧光染料家族的一员。硅罗丹明染料由经典罗丹明骨架衍生而来,以硅原子取代桥接氧原子,将激发和发射光谱红移至远红色区域(通常激发波长约650 nm,发射波长约670 nm)。这种远红色光谱特性可最大程度减少生物样品的自发荧光,降低光毒性,并兼容大多数共聚焦和STED显微镜系统上常见的远红色激光线(如647 nm或660 nm)。

SiR染料的标志性特性是其细胞渗透性和荧光生成性:该染料在非荧光、细胞可渗透的螺环(闭合)形式与荧光性开放两性离子形式之间存在平衡。与蛋白质靶标结合或处于疏水环境时,平衡向荧光性开放形式移动,从而在活细胞中实现低背景、免洗或最少洗涤的标记。

关键特性与光谱特征

包括SiR Dye 1在内的硅罗丹明染料通常具有以下与研究应用相关的理化和光物理特性:

  • 激发最大值:约645–652 nm(远红色区域;兼容647 nm激光线)
  • 发射最大值:约661–674 nm
  • 细胞渗透性:高;螺环闭合形式可被动扩散穿越细胞膜
  • 光稳定性:与许多绿色或黄色荧光探针相比,SiR染料具有更高的光稳定性,适合延时成像和STED成像
  • 荧光生成性:与靶标结合后荧光显著增强,无需大量洗涤步骤即可降低背景信号
  • 生物相容性:在适当工作浓度下适用于活细胞实验

注意:SiR Dye 1(S1451912)的具体摩尔消光系数、量子产率及精确光谱最大值应以产品数据表为准。上述数值为SiR染料类的代表性参考值。

在生物学研究中的应用

SiR Dye 1凭借其远红色光谱窗口、细胞渗透性和荧光生成性,广泛应用于多种荧光显微镜和细胞生物学领域:

  • 超分辨率显微镜:SiR染料是STED(受激发射损耗)显微镜中成熟的探针,可在活细胞中实现细胞结构的纳米级可视化,同样兼容结构照明显微镜(SIM)和单分子定位方法(如STORM/PALM)。
  • 特异性细胞器或蛋白质的活细胞标记:当与适当的靶向配体(如HaloTag配体、SNAP标签底物或细胞器靶向基团)偶联时,SiR染料可在活细胞中实现肌动蛋白、微管蛋白、溶酶体或DNA等靶标的特异性低背景成像。
  • 多色成像:SiR Dye 1的远红色发射与常见绿色(如GFP、Alexa Fluor 488)和红色(如Cy3、Alexa Fluor 555)荧光团光谱差异显著,可实现光谱串扰最小的多色共标记实验。
  • 延时成像与动态研究:高光稳定性和活细胞兼容性使SiR Dye 1适用于追踪动态细胞过程的长时间成像。

操作、储存和安全注意事项

妥善操作和储存SiR Dye 1(S1451912)对于维持试剂完整性和确保实验结果的重现性至关重要:

  • 储存:按产品数据表和质检报告(COA)上的说明储存(通常在−20°C,避光防潮)。将储备液分装,避免反复冻融。
  • 溶剂:SiR染料通常溶于无水DMSO制备储备液。请在产品数据表中确认推荐溶剂和储备液浓度。
  • 光敏感性:所有荧光染料在制备和储存过程中应避免长时间光照,以防储备液发生光漂白。
  • 工作浓度:活细胞成像的最佳工作浓度应针对每种细胞类型和应用场景通过实验确定。染料浓度过高可能会增加背景信号或细胞毒性。
  • 安全性:按照标准实验室安全规程操作。请查阅Aladdin Scientific提供的SiR Dye 1(S1451912)安全数据表(SDS),获取具体危害信息。

注意:S1451912的具体储存条件、推荐溶剂及浓度范围应以最新产品数据表为准。

订购信息

SiR Dye 1可通过Aladdin Scientific以货号S1451912购买。如需了解当前价格、可用包装规格及库存情况,请访问Aladdin Scientific官网或联系当地Aladdin Scientific销售代表。大批量及定制包装可根据需求提供。

交叉参考:本产品在MCE-TJY目录中亦被标注为HY-D1103,可帮助研究人员从多个供应商获取该化合物或交叉参考文献方案。

常见问题

SiR Dye 1是什么?它与经典罗丹明染料有何不同?

SiR Dye 1是一种硅罗丹明荧光染料,其中氧杂蒽核心中的氧原子被硅原子取代,将激发和发射光谱红移至远红色区域(约650/670 nm)。与在绿色或黄绿色范围发射且可能受到高细胞自发荧光干扰的经典罗丹明染料不同,SiR Dye 1在生物背景最小的光谱窗口工作。此外,SiR染料具有荧光生成性——它以非荧光螺环形式存在,与靶标结合后开环并产生强荧光,无需大量洗涤即可实现低背景成像。

SiR Dye 1适合用于STED超分辨率显微镜吗?

是的。包括SiR Dye 1在内的硅罗丹明染料是活细胞STED显微镜中应用最广泛的探针之一,这得益于其与标准STED损耗激光(通常为775 nm)匹配的远红色激发和发射特性、高光稳定性以及活细胞兼容性。其荧光生成特性也有助于保持低背景,这对于在纳米尺度分辨率下实现高对比度至关重要。SiR Dye 1还可能兼容其他超分辨率成像方式,如SIM和单分子定位显微镜。

SiR Dye 1(S1451912)推荐使用哪些溶剂和储存条件?

SiR染料通常溶于无水DMSO制备储备液,因为在没有载体溶剂的情况下,其水溶性可能有限。储备液和干燥原料一般在−20°C避光防潮储存。为保持储备液的完整性,建议制备单次用量的分装液,以减少冻融次数。请参阅Aladdin Scientific提供的S1451912官方产品数据表和质检报告,以获取该产品确认的储存条件和溶解度数据。

SiR Dye 1能否与GFP或其他常见荧光团一起用于多色荧光成像?

是的。SiR Dye 1的远红色发射(约670 nm)与常见荧光团(如GFP约510 nm、YFP约530 nm、Alexa Fluor 488、mCherry约610 nm和Cy3约570 nm)的发射光谱充分分离,使其成为多色共标记实验中减少光谱串扰的优选探针。研究人员应在其具体显微镜系统上验证滤光片组兼容性,并在与Cy5或Alexa Fluor 647等深红移染料联用时确认光谱重叠计算结果。

如何确定SiR Dye 1用于活细胞成像的最佳工作浓度?

SiR Dye 1的最佳工作浓度必须通过实验确定,因为它取决于具体的细胞类型、靶标丰度、标记策略(如HaloTag、SNAP标签或直接偶联物)以及成像方式。SiR类染料在活细胞实验中的典型起始范围为亚微摩尔浓度(如100 nM至1 µM),但应通过滴定优化浓度,以平衡特异性信号、背景信号和细胞毒性。应始终设置适当的阴性对照(未标记细胞或缺乏靶蛋白的细胞),以评估所选浓度下的背景荧光。

参考文献

  1. Lukinavicius G, et al. A near-infrared fluorophore for live-cell super-resolution microscopy of cellular proteins. Nature Chemistry, 2013.
  2. Aladdin Scientific product datasheet: SiR Dye 1, catalog number S1451912.
  3. MCE-TJY product reference: HY-D1103 (SiR Dye 1 cross-reference).

产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。

目录: 常见问题(FAQs)

Da — 若无特别说明,分子量单位默认为道尔顿。   Mw — 重均分子量。   Mn — 数均分子量。

产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。

引用本文

阿拉丁科学.《SiR Dye 1:特性、应用及常见问题解答》. 阿拉丁知识库,更新于 2026年10月10日。 https://www.aladdin-e.com/zh_cn/faqs/sir-dye-1-properties-applications-faqs.html
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