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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
中文介绍: Gambogenic acid 是黄藤中的有效成分,具有抗癌活性。Gambogenic acid 为有效的 EZH2 抑制剂,特异性地与 EZH2-SET 结构域的 Cys668 位点共价结合,诱导 EZH2 泛素化。
Information
Gambogenic acid is an active ingredient in gamboge, with anticancer activity. Gambogenic acid acts as an effective inhibitor of EZH2, specifically and covalently binds to Cys668 within the EZH2-SET domain, and induces EZH2 ubiquitination.
Targets
FGFR ; EZH2
规格
英文别名
2-Butenoic acid,4-[(1R,3aS,5S,12aS)-9-[(2E)-3,7-dimethyl-2,6-octadien-1-yl]-3a,4,5,7-tetrahydro-8,10-dihydroxy-3,3-dimethyl-11-(3-methyl-2-buten-1-yl)-7,13-dioxo-1,5-methano-1H,3H-furo[3,4-d]xanthen-1-yl
生化机理
甘宝酸(Gambogenic Acid)是从甘宝中发现的,它是厄洛替尼耐药的非小细胞肺癌(NSCLC)中表皮生长因子受体(FGFR)信号通路的抑制剂,具有抗肿瘤作用。甘博原酸还是一种有效的 EZH2 抑制剂,它能特异性地与 EZH2-SET 结构域中的 Cys668 共价结合,并引发 EZH2 泛素化。
名称和识别符
IUPAC Name
(Z)-4-[(1S,2S,13S,15R)-7-[(2E)-3,7-dimethylocta-2,6-dienyl]-6,8-dihydroxy-17,17-dimethyl-5-(3-methylbut-2-enyl)-10,14-dioxo-3,16-dioxapentacyclo[11.4.1.02,11.02,15.04,9]octadeca-4,6,8,11-tetraen-15-yl]-2-methylbut-2-enoic acid
INCHI
1S/C38H46O8/c1-20(2)10-9-11-22(5)13-15-25-30(39)26(14-12-21(3)4)33-29(31(25)40)32(41)27-18-24-19-28-36(7,8)46-37(34(24)42,38(27,28)45-33)17-16-23(6)35(43)44/h10,12-13,16,18,24,28,39-40H,9,11,14-15,17,19H2,1-8H3,(H,43,44)/b22-13+,23-16-/t24-,28+,37+,38-/m1/s1
InChi Key
RCWNBHCZYXWDOV-VSFMGBBVSA-N
Smiles
CC(=CCCC(=CCC1=C(C(=C2C(=C1O)C(=O)C3=CC4CC5C3(O2)C(C4=O)(OC5(C)C)CC=C(C)C(=O)O)CC=C(C)C)O)C)C
Isomeric SMILES
CC(=CCC/C(=C/CC1=C(C(=C2C(=C1O)C(=O)C3=C[C@@H]4C[C@@H]5[C@@]3(O2)[C@](C4=O)(OC5(C)C)C/C=C(/C)\C(=O)O)CC=C(C)C)O)/C)C
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高级数据
系统学分类
界(kingdom)
有机化合物
超类(Superclass)
有机杂环化合物
类(Class)
苯并吡喃类
亚类(Subclass)
1-苯并吡喃
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes)
二苯并吡喃 - 黄酮类
直接上位类(Direct Parent)
山酮
其他上位类(Alternative Parents)
色酮 芳香单萜类化合物 芳基酮 酚类 氧杂环己烷 环己酮 烷基芳基醚 乙烯基酸 氧杂环戊烷 氧环化合物 一元羧酸及其衍生物 二烷基醚 羧酸 有机氧化物 碳氢化合物衍生物
分子骨架(Molecular Framework)
芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents)
芳基醚 - 芳香族杂多环化合物 - 芳香单萜类化合物 - 芳基溴化物 - 苯基化合物 - 羰基 - 羧酰胺基 - 羧酸衍生物 - 苯并吡喃 - 环己烯酮 - 二烷基醚 - 乙醚 - 烃衍生物 - 酮 - 单羧酸或其衍生物 - 单萜类化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机氧化合物 - 氧杂环 - 氧杂环戊烷 - 氧杂环丁烷 - 苯酚 - 乙烯基羧酸 - 黄酮
描述(Description)
该化合物属于黄酮类有机化合物。这类多环芳烃化合物含有黄烯基团,其第9位碳原子与酮基团共轭。黄烯是一种三环化合物,由两个苯环通过吡喃环线性连接而成。
外部描述符(External Descriptors)
暂无
三维结构
产品属性
ALogP
7.717
HBD Count
2
Rotatable Bond
10
关联靶点(人)
关联靶点(其它种属)
作用机制
作用机制
Action Type
target ID
Target Name
Target Type
Target Organism
Binding Site Name
参考文献
化学和物理性质
溶解性
Solubility (25°C) In vitro DMSO: 100 mg/mL (158.53 mM);
DMSO(mg / mL) Max Solubility
10
DMSO(mM) Max Solubility
15.8537135992394
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
3
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
8
可旋转键计数Rotatable Bond Count
10
精确质量Exact Mass
630.319 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
630.319 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
130.000 Ų
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
4
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
2
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
2
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
溶液计算器
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