计算溶液所需的质量、体积或浓度。
| 活性类型 | 活性值-log(M) | 作用机制 | 期刊 | 参考文献(PubMed IDs) |
|---|
GSK-J4, 赖氨酸去甲基化酶 5B 抑制剂；赖氨酸去甲基化酶 5C 抑制剂；赖氨酸去甲基化酶 6A 抑制剂；赖氨酸去甲基化酶 6B 抑制剂
有货
为什么选择此级别
Moligand™ 级 ，适用于对基线干扰要求严格的色谱和分析工作流程。
储存与运输
-80℃储存。特低温运输 。请查阅批次 COA 获取详细规格。
质量文档
SDS、COA、产品数据表及规格说明书均可下载。可通过批号查询获取批次 COA。
文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
产品介绍：
GSK-J4 是一种有效的 H3K27me3/me2 去甲基化酶 JMJD3/KDM6B 和 UTX/KDM6A 双抑制剂，IC50 分别为 8.6 μM 和 6.6 μM。GSK-J4 抑制 LPS 诱导的人原代巨噬细胞产生 TNF-α，IC50 值为 9 μM。GSK-J4 是 GSK-J1 的细胞通透性前药。GSK-J4 诱导内质网应激相关的细胞凋亡 (apoptosis)。
Product Application:
GSK-J4 has been used to study the effect of KDM2B (Jumonji (JmjC) domain histone 3 lysine 36 (H3K36) di-demethylase) inhibition on the survival and DNA repair potential of glioblastoma cells. It has also been used in sulforhodamine B (SRB) cell growth assay and cell viability assay.
规格
别名
N-[2-(2-吡啶基)-6-(1,2,4,5-四氢-3H-3-苯并ze庚因-3-基)-4-嘧啶基]-β-丙氨酸乙酯
英文别名
MFCD22683852 | Ethyl 3-((6-(4,5-dihydro-1H-benzo[d]azepin-3(2H)-yl)-2-(pyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl)amino)propanoate | Z1543021064 | AC-32705 | J-016640 | BRD-K98203492-001-01-1 | HB1407 | ETHYL 3-{[2-(PYRIDIN-2-YL)-6-(1,2,4,5-TETRAHYDRO-3-BENZAZEPIN-3-YL)
规格或纯度
Moligand™, 10mM in DMSO
英文名称
GSK-J4
生化机理
GSK-J4 是一种细胞渗透性原药，可被巨噬细胞酯酶迅速水解为 GSK-J1，这是一种强效的选择性 Jumonji H3K27 去甲基化酶抑制剂。含 Jumonji C 结构域的组蛋白去甲基化酶（JHDMs）是一种依赖于铁（II）和α-酮戊二酸的酶，能使甲基化的组蛋白赖氨酸残基含氧，从而使其去甲基化。GSK-J1 对 KDM6 亚家族成员 JMJD3 和 UTX 具有选择性，在 JMJD3 试验中的 IC50 为 60 nM，而对 JMJ 家族的其他去甲基化酶以及 100 多种经测试的激酶和组蛋白去乙酰化酶没有活性。GSK-J4 原药能抑制 LPS 刺激的人巨噬细胞产生 TNF-α，IC50 为 9 μM，还能阻止类风湿性关节炎患者的巨噬细胞产生 TNF-α。
储存条件
-80℃储存
运输条件
特低温运输
作用类型
抑制剂
作用机制
赖氨酸去甲基化酶 5B 抑制剂；赖氨酸去甲基化酶 5C 抑制剂；赖氨酸去甲基化酶 6A 抑制剂；赖氨酸去甲基化酶 6B 抑制剂
名称和识别符
PubChem SID
分子类型
小分子
IUPAC Name
ethyl 3-[[2-pyridin-2-yl-6-(1,2,4,5-tetrahydro-3-benzazepin-3-yl)pyrimidin-4-yl]amino]propanoate
INCHI
1S/C24H27N5O2/c1-2-31-23(30)10-14-26-21-17-22(28-24(27-21)20-9-5-6-13-25-20)29-15-11-18-7-3-4-8-19(18)12-16-29/h3-9,13,17H,2,10-12,14-16H2,1H3,(H,26,27,28)
InChi Key
WBKCKEHGXNWYMO-UHFFFAOYSA-N
Smiles
CCOC(=O)CCNC1=CC(=NC(=N1)C2=CC=CC=N2)N3CCC4=CC=CC=C4CC3
Isomeric SMILES
CCOC(=O)CCNC1=CC(=NC(=N1)C2=CC=CC=N2)N3CCC4=CC=CC=C4CC3
分子量
417.51
Reaxy-Rn
22471772
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=22471772&ln=
技术文档
高级数据
系统学分类
分类树（Taxonomy Tree）
| 界（kingdom) | 有机化合物 |
|---|---|
| 超类（Superclass) | 有机杂环化合物 |
| 类（Class) | 二嗪类 |
| 亚类（Subclass） | 嘧啶和嘧啶衍生物 |
| 中间层级节点（Intermediate Tree Nodes） | 暂无 |
| 直接上位类(Direct Parent) | 吡啶基嘧啶 |
| 其他上位类（Alternative Parents） | 苯并氮杂卓类 β氨基酸及其衍生物 二烷基芳胺 仲烷基芳胺 氨基嘧啶及其衍生物 氮杂卓类 吡啶及其衍生物 苯类化合物 咪唑内酰胺类 杂芳族化合物 羧酸酯 一元羧酸及其衍生物 氮杂环化合物 羰基化合物 有机氧化物 有机光子化合物 碳氢化合物衍生物 |
| 分子骨架（Molecular Framework) | 芳香族杂多环化合物 |
| 取代基（Substituents） | 氨基酸 - 氨基酸或其衍生物 - 氨基吡啶 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 氮杂环戊烷 - 苯并噁嗪 - 苯基化合物 - β-氨基酸或其衍生物 - 羰基 - 羧酸衍生物 - 羧酸酰胺 - 二烷基芳基胺 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 咪唑内酰胺 - 单羧酸或其衍生物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 吡啶 - 吡啶基嘧啶 - 二级脂肪族/芳香族胺 - 醛基 |
| 描述（Description） | 该化合物属于吡啶嘧啶类有机化合物。这类化合物具有吡啶嘧啶骨架，即吡啶通过键与嘧啶相连（非共环）。 |
| 外部描述符（External Descriptors） | 暂无 |
三维结构
交互式化学结构模型
关联靶点（人）
KDM5C
Tchem
赖氨酸特异性脱甲基酶5C(Lysine-specific demethylase 5C)
(1 活性数据)
KDM6A
Tchem
赖氨酸特异性去甲基化酶6A(Lysine-specific demethylase 6A)
(1 活性数据)
KDM6B
Tchem
赖氨酸特异性去甲基化酶6B(Lysine-specific demethylase 6B)
(1 活性数据)
KDM5B
Tchem
赖氨酸特异性去甲基化酶5B(Lysine-specific demethylase 5B)
(1 活性数据)
ABL1
Tclin
Tyrosine-protein kinase ABL
(18331 活性数据)
GSK3B
Tclin
Glycogen synthase kinase-3 beta
(11785 活性数据)
CSNK1D
Tchem
Casein kinase I delta
(4546 活性数据)
CDK2
Tchem
Cyclin-dependent kinase 2
(9050 活性数据)
AURKA
Tchem
Serine/threonine-protein kinase Aurora-A
(10240 活性数据)
U2OS
(164939 活性数据)
HepG2
(196354 活性数据)
BRD4
Tchem
Bromodomain-containing protein 4
(13122 活性数据)
KDM6A
Tchem
Lysine-specific demethylase 6A
(39 活性数据)
KDM5A
Tchem
Lysine-specific demethylase 5A
(893 活性数据)
TRIM24
Tchem
Transcription intermediary factor 1-alpha
(2087 活性数据)
BRPF1
Tchem
Peregrin
(2217 活性数据)
HEK-293T
(167025 活性数据)
KDM5B
Tchem
Lysine-specific demethylase 5B
(814 活性数据)
关联靶点（其它种属）
Mapk1
MAP kinase ERK2 (650 活性数据)
Hdac6
Histone deacetylase 6 (222 活性数据)
Fgfr3
Fibroblast growth factor receptor 3 (21 活性数据)
RAW264.7 (28094 活性数据)
rep
Replicase polyprotein 1ab (378 活性数据)
SARS-CoV-2 (38078 活性数据)
作用机制
| 作用机制 | Action Type | target ID | Target Name | Target Type | Target Organism | Binding Site Name | 参考文献 |
|---|
化学和物理性质
分子量
417.500 g/mol
XLogP3
4.300
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
1
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
7
可旋转键计数Rotatable Bond Count
8
精确质量Exact Mass
417.216 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
417.216 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
80.200 Ų
重原子数Heavy Atom Count
31
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
546.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
0
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
安全和危险性（GHS）
象形图
信号词
警告
危险声明
H319: 引起严重眼睛刺激
H335: 可能引起呼吸道刺激
预防措施声明
P261: 避免吸入灰尘/烟雾/气体/雾/蒸汽/喷雾
P264: 处理后要彻底洗手。
P271: 仅在室外或通风良好的地方使用。
P280: 戴防护手套/穿防护服/戴防护眼罩/戴防护面具。
P321: 特殊处理（请参阅此标签上的...）。
P302+P352: 如皮肤沾染：用水充分清洗。
P304+P340: 如误吸入：将人转移到空气新鲜处，保持呼吸舒适体位。
P305+P351+P338: 如进入眼睛：用水小心冲洗几分钟。如戴隐形眼镜并可方便地取出，取出隐形眼镜。继续冲洗。
P362+P364: 脱掉沾污的衣服，清洗后方可重新使用。
P405: 密闭存放
P403+P233: 存放在通风良好的地方。保持容器密闭。
P501: 将内容物/容器处理到。。。
P264+P265: 处理后彻底洗手[和…]。不要触摸眼睛。
P337+P317: 如果眼睛刺激持续：寻求医疗帮助。
P332+P317: 如果出现皮肤刺激：请寻求医疗帮助。
P319: 如果你感到不适，请寻求医疗帮助。
质检证书（CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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溶液计算器
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