GNE-371

CAS: 1926986-36-8 货号: G647415 分子式: C24H25N5O3 分子量: 431.49 PubChem CID: 121335283
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文献证明

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概述

​NE-371 是一种针对人类转录起始因子 TFIID 亚基 1 和类转录起始因子 TFIID 亚基 1 的第二溴端结构域的高效选择性化学探针,对 TAF1(2) 的 IC50 值为10 nM。

GNE-371 is a potent and selective chemical probe for the second bromodomains of human transcription-initiation-factor TFIID subunit 1 and transcription-initiation-factor TFIID subunit 1-like, with an IC 50 of 10 nM for TAF1(2).

In Vitro

GNE-371 (compound 27) binds TAF1(2) with an IC 50 of 10 nM while maintaining excellent selectivity over other bromodomain-family members. GNE-371 is also active in a cellular-TAF1(2) target-engagement assay (IC 50 =38 nM) and exhibits anti-proliferative synergy with the BET inhibitor JQ1, suggesting engagement of endogenous TAF1 by GNE-371 and further supporting the use of GNE-371 in mechanistic and target-validation studies. MCE has not independently confirmed the accuracy of these methods. They are for reference only.

Form:Solid

IC50& Target:IC50: 10 nM (TAF1(2))

规格

规格或纯度
Moligand™, ≥98%
英文名称
GNE-371
生化机理
GNE-371 是一种针对人类转录启动因子 TFIID 亚基 1 和转录启动因子 TFIID 亚基 1-like 第二溴结构域的强效选择性化学探针,对 TAF1(2) 的 IC 50 为 10 nM。
储存条件
避光,-20°C储存,充氩
运输条件
超低温运输
纯度
≥98%
名称和识别符
分子类型
未知
IUPAC Name
6-but-3-enyl-4-[1-methyl-6-(morpholine-4-carbonyl)benzimidazol-4-yl]-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-7-one
INCHI
1S/C24H25N5O3/c1-3-4-7-29-14-19(17-5-6-25-22(17)24(29)31)18-12-16(13-20-21(18)26-15-27(20)2)23(30)28-8-10-32-11-9-28/h3,5-6,12-15,25H,1,4,7-11H2,2H3
InChi Key
XJRUWGFZGQNPPD-UHFFFAOYSA-N
Smiles
CN1C=NC2=C(C=C(C=C21)C(=O)N3CCOCC3)C4=CN(C(=O)C5=C4C=CN5)CCC=C
Isomeric SMILES
CN1C=NC2=C(C=C(C=C21)C(=O)N3CCOCC3)C4=CN(C(=O)C5=C4C=CN5)CCC=C
PubChem CID
分子量
431.49

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系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机杂环化合物
类(Class) 吡咯并吡啶
亚类(Subclass) 暂无
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 吡咯并吡啶
其他上位类(Alternative Parents) 吗啉羧酸及其衍生物  苯并咪唑类  吡啶酮类  N-取代咪唑  苯类化合物  叔羧酸酰胺  吡咯类  杂芳族化合物  内酰胺类  氧环化合物  二烷基醚  氮杂环化合物  有机光子化合物  有机氮化合物  有机氧化物  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents) 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 吡唑 - 苯基化合物 - 苯并咪唑 - 羧酰胺基 - 羧酸衍生物 - 二烷基醚 - 乙醚 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 咪唑 - 肟 - Morpholine - 莠草酸 - N-取代咪唑 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 氧杂吡嗪烷 - 吡啶 - 吡啶酮 - 吡咯 - 吡咯吡嗪 - 叔羧酸酰胺
描述(Description) 该化合物属于吡咯吡啶类有机化合物。这类化合物含有吡咯吡啶结构单元,即吡咯环与吡啶环共轭的结构。吡咯是由四个碳原子和一个氮原子构成的五元环,吡啶则是由五个碳原子和一个氮原子构成的六元环。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





关联靶点(人)
TAF11 Tchem 转录起始因子TFIID亚基11(Transcription initiation factor TFIID subunit 11) (1 活性数据)
活性类型 活性值-log(M) 作用机制 期刊 参考文献(PubMed IDs)
TAF1 Tchem 转录起始因子TFIID亚基1(Transcription initiation factor TFIID subunit 1) (1 活性数据)
活性类型 活性值-log(M) 作用机制 期刊 参考文献(PubMed IDs)
TAF1L Tchem 转录起始因子TFIID亚基1类(Transcription initiation factor TFIID subunit 1-like) (1 活性数据)
活性类型 活性值-log(M) 作用机制 期刊 参考文献(PubMed IDs)
TP53 Tchem Cellular tumor antigen p53 (48468 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
NCI-H23 (49055 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
BRD4 Tchem Bromodomain-containing protein 4 (13122 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
CECR2 Tchem Cat eye syndrome critical region protein 2 (340 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
BRD9 Tchem Bromodomain-containing protein 9 (684 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
TAF1L Tchem Transcription initiation factor TFIID subunit 1-like (141 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
TAF1 Tchem Transcription initiation factor TFIID subunit 1 (441 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
作用机制
作用机制 Action Type target ID Target Name Target Type Target Organism Binding Site Name 参考文献
化学和物理性质
溶解性
DMSO : 50 mg/mL (115.88 mM; Need ultrasonic)
敏感性
对光线敏感;对空气敏感
分子量
431.500 g/mol
XLogP3
1.500
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
1
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
4
可旋转键计数Rotatable Bond Count
5
精确质量Exact Mass
431.196 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
431.196 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
83.500 Ų
重原子数Heavy Atom Count
32
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
780.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
0
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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本产品的 CAS 号、分子式和分子量是多少?
本产品的 CAS 号为 1926986-36-8,分子式为 C24H25N5O3,分子量为 431.49 g/mol。InChIKey XJRUWGFZGQNPPD-UHFFFAOYSA-N。
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