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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
Guadecitabine sodium (SGI-110 sodium) is a second-generation DNA methyltransferases ( DNMT ) inhibitor for research of acute myeloid leukemia (AML) and myelodysplastic syndromes (MDS)
In Vitro
After HCT116 colorectal carcinoma cells are treated for 6 days, a dose-dependent increase in p16expression is observed with Guadecitabine sodium (SGI-110 sodium). In addition, T24 and HCT116 cells treated with Guadecitabine sodium or 5-aza-CdR for 3 days show a dose-dependent increase in the level of p16 protein, showing the competence of Guadecitabine sodium to inhibit DNA methylation and induce p16 at both mRNA and protein levels as well as 5-aza-CdR. Thus, Guadecitabine sodium is able to inhibit DNA methylation at 5′-region and induce the expression of the p16 gene in T24 and HCT116 cells at concentrations comparable to 5-aza-CdR, and the induction of p16 expression by both agents correlates with the demethylation at the 5′-end region of the gene in both cell lines. Guadecitabine sodium is slightly less toxic than 5-aza-CdR at the doses tested up to 1 μM concentration but displaying similar toxicity at 10 μM concentration. MCE has not independently confirmed the accuracy of these methods. They are for reference only.
In Vivo
Guadecitabine sodium (SGI-110 sodium) at 10mg/kg is an effective dose at reducing DNA methylation and retarding tumor growth, and caused roughly the same level of toxicity as 5-Aza-CdR. Guadecitabine sodium is effective in vivo at reactivating the expression of the p16 gene, which is heavily methylated in the parent EJ6 cells. Guadecitabine sodium is effective in reducing the level of DNA methylation in vivo at the p16 promoter region. Guadecitabine sodium is better tolerated than 5-Aza-CdR in vivo , suggesting that it can be an attractive alternative for potential clinical use. MCE has not independently confirmed the accuracy of these methods. They are for reference only.
Animal administration
Mouse: Athymic nu/nu mice are inoculated subcutaneously in the right hind flank with 10 7 EJ6 bladder cancer cells. After tumors reach 0.5 cm in diameter, animals are stratified into three groups with eight animals per group to begin treatments. Doses and dosing schedules are designed so that each group received molar equivalents of either S-110 or 5-Aza-CdR. The agents are administered SQ once weekly at a dose of 12.2 mg/kg for S-110 and 5.0 mg/kg for 5-Aza-CdR for three weeks. The study includes an appropriate PBS control group. Tumor sizes by caliper and body weight measurements are taken twice weekly to monitor tumor growth inhibition and tolerability . aladdin has not independently confirmed the accuracy of these methods. They are for reference only.
Form:Solid
IC50& Target:DNMT1
规格
别名
瓜地他滨钠
英文别名
[(2R,3S,5R)-5-(2-Amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl (2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxo-1,3,5-triazin-1(2H)-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl sodium phosphate | sodium;[(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-
规格或纯度
≥98%
英文名称
Guadecitabine sodium
生化机理
瓜地他滨钠（SGI-110 sodium）是第二代 DNA 甲基转移酶（DNMT）抑制剂，用于研究急性髓性白血病（AML）和骨髓增生异常综合征（MDS）。
储存条件
2-8°C储存,干燥
运输条件
低温运输
作用类型
抑制剂
纯度
≥98%
名称和识别符
分子类型
小分子
IUPAC Name
sodium;[(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxo-1,3,5-triazin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] phosphate
INCHI
1S/C18H24N9O10P.Na/c19-16-22-6-27(18(31)25-16)12-2-8(9(3-28)35-12)37-38(32,33)34-4-10-7(29)1-11(36-10)26-5-21-13-14(26)23-17(20)24-15(13)30;/h5-12,28-29H,1-4H2,(H,32,33)(H2,19,25,31)(H3,20,23,24,30);/q;+1/p-1/t7-,8-,9+,10+,11+,12+;/m0./s1
InChi Key
XLHBNJPXFOZFNJ-BYKQGDNKSA-M
Smiles
C1C(C(OC1N2C=NC3=C2N=C(NC3=O)N)COP(=O)([O-])OC4CC(OC4CO)N5C=NC(=NC5=O)N)O.[Na+]
Isomeric SMILES
C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=NC3=C2N=C(NC3=O)N)COP(=O)([O-])O[C@H]4C[C@@H](O[C@@H]4CO)N5C=NC(=NC5=O)N)O.[Na+]
分子量
579.39
Reaxy-Rn
15477452
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=15477452&ln=
技术文档
高级数据
系统学分类
分类树（Taxonomy Tree）
-
界（kingdom)
有机化合物
-
超类（Superclass)
核苷、核苷酸及其类似物
-
类（Class)
嘌呤核苷酸
-
亚类（Subclass）
嘌呤脱氧核糖核苷酸
- 第5级 (level 5) 嘌呤脱氧核糖核苷单磷酸
- 第6级 (level 6) 嘌呤2'-脱氧核糖核苷单磷酸
- 第5级 (level 5) 嘌呤脱氧核糖核苷单磷酸
-
亚类（Subclass）
嘌呤脱氧核糖核苷酸
-
类（Class)
嘌呤核苷酸
-
超类（Superclass)
核苷、核苷酸及其类似物
| 界（kingdom) | 有机化合物 |
|---|---|
| 超类（Superclass) | 核苷、核苷酸及其类似物 |
| 类（Class) | 嘌呤核苷酸 |
| 亚类（Subclass） | 嘌呤脱氧核糖核苷酸 |
| 中间层级节点（Intermediate Tree Nodes） | 嘌呤脱氧核糖核苷单磷酸 |
| 直接上位类(Direct Parent) | 嘌呤2'-脱氧核糖核苷单磷酸 |
| 其他上位类（Alternative Parents） | 6-氧嘌呤 次黄嘌呤 三嗪酮 嘧啶酮类 氨基嘧啶及其衍生物 氨基三嗪类 磷酸二烷基酯 1,3,5-三嗪 N-取代咪唑 乙烯基酰胺 氧杂环戊烷 杂芳族化合物 仲醇 氧环化合物 氮杂环化合物 碳氢化合物衍生物 有机氧化物 有机钠盐 有机两性离子 伯醇 伯胺 |
| 分子骨架（Molecular Framework) | 芳香族杂多环化合物 |
| 取代基（Substituents） | 1,3,5-三嗪 - 6-羰基嘌呤 - 羟基苯甲酸酯 - 烷基磷酸酯 - 氨基酸 - 氨基-1,3,5-三嗪 - 氨基吡啶 - 氨基三嗪 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 吡唑 - 二烷基磷酸酯 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 嘌呤 - 咪唑 - 咪唑哌啶 - N-取代咪唑 - 有机碱金属盐 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机磷酸酯 - 有机盐 - 有机钠盐 - 有机双性离子 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 氧杂环 - 氧杂环丁烷 - 磷酸酯 - 初级醇 - 初级胺 - 鸟苷酸 - 嘌呤 2'-脱氧核糖核苷单磷酸 - 嘧啶 - 嘧啶酮 - 醛基 - 三嗪 - 三嗪酮 - 乙烯酰胺 |
| 描述（Description） | 该化合物属于嘌呤2'-脱氧核糖核苷单磷酸类有机化合物。此类嘌呤核苷酸的单磷酸基团连接于核糖单元，且核糖2位缺失羟基。 |
| 外部描述符（External Descriptors） | 暂无 |
三维结构
交互式化学结构模型
化学和物理性质
溶解性
H2O : 50 mg/mL (86.30 mM; Need ultrasonic and warming) DMSO : 50 mg/mL (86.30 mM; Need ultrasonic)
分子量
579.400 g/mol
XLogP3
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
5
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
12
可旋转键计数Rotatable Bond Count
8
精确质量Exact Mass
579.12 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
579.12 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
274.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
39
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
1110.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
6
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
2
质检证书（CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
输入批号以搜索分析图谱:
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