反转录合成单链 cDNA 实验
反转录合成单链 cDNA 实验
cDNA 合成反应的体积,依赖于所用的锚定-任意引物组合的数目。下面提供的方案,适用于 24 个引物组合和两个样品。对于更多的样品和/或更多的引物组合,调整相应主体混合液的体积。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
操作方法
反转录合成单链cDNA实验
材料与仪器
RNA RT主体混合液 步骤 一、材料 1.核酸和寡核苷酸 来自方案2的RNA 为每个单独的H-T11M引物,分别配制RT主体混合液 蒸馏水 28.2ul 5XRT缓冲液 12.0ul 2.5mmol/LdNTP混合液 4.8ul H-T11M(原文为H-T1M。一译者改) 引物(这里M=G、A或C)6.0ul 2.专用设备 0.5ml离心管 0.2ml薄壁PCR管(GenHunterT101) 热循环仪[推荐使用GeneAmpPCRSystem9600(Perkin-ElmerCorporation,Norwalk,CT)或者Mastercycler(EppendorfScientific,Westbury,NY)] 3.附加试剂 RNAspectraFluorescentmRNA差异显示系统(GenHunterF501-F510R501-R510),包括蒸馏水、5XRT缓冲液[125mmol/LTris-HCl、pH8.3,188mmol/LKCl,7.5mmol/LMgCl2,25mmol/L二硫苏糖醇(DTT)]、FDDdNTP混合液(2.5mmol/L)、锚定引物(H-T11M)(2umol/U以及MMLV逆转录酶(100U/ul) 二、方法 cDNA合成 1.按照下面步骤,配制3个反应管(为3种H-T11M引物各准备一个)。 2.用DEPC处理过的H20,将RNA稀释到终浓度并充分混匀,置于冰上。 3.取5.0ul稀释的RNA(0.1ug/ul),加到0.5ml管子中,并充分混匀。 4.按照下面程序设置热循环仪:65°C 5min→37°C 60min→75°C 5min →4°C平衡。 5.将反应管放到热循环仪中,开始程序。 6.当反应进行到37°C10min时,暂停热循环仪,在每个管中加入2.5ulMMLV逆转录酶,迅速混匀后继续温育。 7.反转录结束后,最高转速短暂离心,收集冷凝水。 8.将反应管放在冰上或-20°C备用。 如需了解更多产品详情,请前往阿拉丁官网查询。
薄壁PCR管 离心管 热循环仪
各取42.5ulRT主体混合液,加到标记好的、无RNA酶的0.2ml薄壁PCR管中。记住要为所用的每个锚定引物(H-T11M)准备单独的RT反应!
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