实验方案(Protocols)

单链 cDNA 的合成实验

简介

本方案利用的是总RNA,因为如果使用18SrRNA作内对照,在后续实验中就不能使用带poly(A)的RNA。并且必须用DNA酶处理RNA,以去除所有污染的基因组DNA。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。

操作方法

单链cDNA的合成实验

步骤

一、材料

1. 缓冲液、溶液和试剂

去除 RNA 酶的双蒸水

10XRT-PCR 缓冲液(去除 RNA 酶的双蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)

2. 酶和酶缓冲液

MMLV 逆转录酶(100~200U/ul)

SUPERaseINRNA 酶抑制剂(20U/ul;Ambion)

3. 核酸和寡核苷酸

dNTP 混合物(10 mmol/L,包含所有四种 dNTP)

随机引物(5umol/L)

总 RNA(达到 2.5ug)

4. 实验器材

薄壁的 PCR 管

二、方法

1. 在冰上加 2ul50umol/L 的随机引物到薄壁的 PCR 管中(一个反应一管)。

2. 加入 2.5ug 的总 RNA。

3. 加入 4ul 的 10 mmol/LdNTP 混合物。

4. 添加去除 RNA 酶的双蒸水(RNaSe-freeH20),使体积达到 16ul。

5.70°C 加热 10min, 变性二级结构,然后立即放在冰上。

6. 加 2ul 的 10XRT-PCR 缓冲液。

7. 加1ul 的 20U/ulSUPERaselN。

8. 加1ul 的 100~200U/ulMMLV 逆转录酶。

9.42°C 温浴 1h。

10.95°C 加热10min, 灭活逆转录酶。

11. 继续扩增步骤或停止反应,-2°C 储存。


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Da — 若无特别说明,分子量单位默认为道尔顿。   Mw — 重均分子量。   Mn — 数均分子量。

产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。

引用本文

阿拉丁科学.《单链 cDNA 的合成实验》. 阿拉丁知识库,更新于 2024年12月23日。 https://www.aladdin-e.com/zh_cn/faqs/single-stranded-cdna-synthesis.html