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为什么选择此级别
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储存与运输
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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 2 篇同行评审文献引用。
概述
5-甲基胞苷是 大肠杆菌 中 RNA 的成分。它存在于植物、动物和细菌来源的 RNA 中。它是存在于转移 RNA (tRNA) 中的 C 衍生物之一。
应用:
5-甲基胞苷用于 DNA 甲基化过程(表观遗传学)的研究。
规格
英文别名
NSC-363933 | M1931 | s6138 | 5-Methylcytidine | 5-methyl-cytidine | DTXSID401016977 | 4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methyl-1,2-dihydropyrimidin-2-one | AC-32357 | AM83948 | EINECS 218-390-8 | Adenosine receptor ago
生化机理
内源性修饰核苷。DNA甲基化标记。5-甲基胞嘧啶衍生物。5-甲基转移酶Trm4底物。当5-甲基转移酶Trm4耗尽时,在不带电荷的组蛋白tRNA分子中积累。5-甲基胞苷是一种烷基化的嘧啶,在核酸的 α-螺旋和 β-螺旋中具有重要的堆积增强作用,提高了核酸的解链温度,改善了热稳定性,从而达到稳定结构的目的。
备注
如果有可能,您尽量在使用的当天配置溶液,并在当天使用完它。但是,如果您需要预先配制储备溶液,我们建议您将溶液等份保存在-20°C的密封小瓶中。通常,它们最多可以使用一个月。在使用前和打开样品瓶之前,我们建议您让您的产品在室温下平衡至少1小时。需要更多关于溶解度,用法和处理的建议吗?请访问我们的常见问题(FAQ)页面以获取更多详细信息。
名称和识别符
IUPAC Name
4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidin-2-one
INCHI
1S/C10H15N3O5/c1-4-2-13(10(17)12-8(4)11)9-7(16)6(15)5(3-14)18-9/h2,5-7,9,14-16H,3H2,1H3,(H2,11,12,17)/t5-,6-,7-,9-/m1/s1
InChi Key
ZAYHVCMSTBRABG-JXOAFFINSA-N
Smiles
CC1=CN(C(=O)N=C1N)C2C(C(C(O2)CO)O)O
Isomeric SMILES
CC1=CN(C(=O)N=C1N)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=25358540&ln=
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高级数据
系统学分类
| 界(kingdom) |
有机化合物 |
| 超类(Superclass) |
核苷、核苷酸及其类似物 |
| 类(Class) |
嘧啶核苷 |
| 亚类(Subclass) |
暂无 |
| 中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) |
暂无 |
| 直接上位类(Direct Parent) |
嘧啶核苷 |
| 其他上位类(Alternative Parents) |
糖胺 戊糖 羟基嘧啶 氢化嘧啶 四氢呋喃 杂芳族化合物 仲醇 氧环化合物 氮杂环化合物 伯醇 有机光子化合物 有机氮化合物 碳氢化合物衍生物 |
| 分子骨架(Molecular Framework) |
芳香族杂单环化合物 |
| 取代基(Substituents) |
羟基苯甲酸酯 - 芳香族杂单环化合物 - 氮杂环 - 糖基化合物 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 羟吡啶 - 羟基嘧啶 - 单糖 - N-羧酰胺基-α-氨基酸或其衍生物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 五碳单糖 - 初级醇 - 嘧啶 - 嘧啶核苷 - 醛基 - 四氢呋喃 |
| 描述(Description) |
该化合物属于嘧啶核苷类有机化合物。这类化合物由嘧啶碱基与核糖基或脱氧核糖基相连构成。 |
| 外部描述符(External Descriptors) |
methylcytidine |
三维结构
关联靶点(其它种属)
作用机制
| 作用机制 |
Action Type |
target ID |
Target Name |
Target Type |
Target Organism |
Binding Site Name |
参考文献 |
化学和物理性质
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
4
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
5
可旋转键计数Rotatable Bond Count
2
精确质量Exact Mass
257.101 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
257.101 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
129.000 Ų
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
4
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
技术文档和文章
此产品的引用文献
溶液计算器
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