5-甲基胞苷

CAS: 2140-61-6 货号: M168577 分子式: C10H15N3O5 分子量: 257.24
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文献证明

在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 2 篇同行评审文献引用。

概述

5-甲基胞苷是 大肠杆菌 中 RNA 的成分。它存在于植物、动物和细菌来源的 RNA 中。它是存在于转移 RNA (tRNA) 中的 C 衍生物之一。


应用:

5-甲基胞苷用于 DNA 甲基化过程(表观遗传学)的研究。


规格

英文别名
NSC-363933 | M1931 | s6138 | 5-Methylcytidine | 5-methyl-cytidine | DTXSID401016977 | 4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methyl-1,2-dihydropyrimidin-2-one | AC-32357 | AM83948 | EINECS 218-390-8 | Adenosine receptor ago
规格或纯度
≥99%
英文名称
5-Methylcytidine
生化机理
内源性修饰核苷。DNA甲基化标记。5-甲基胞嘧啶衍生物。5-甲基转移酶Trm4底物。当5-甲基转移酶Trm4耗尽时,在不带电荷的组蛋白tRNA分子中积累。5-甲基胞苷是一种烷基化的嘧啶,在核酸的 α-螺旋和 β-螺旋中具有重要的堆积增强作用,提高了核酸的解链温度,改善了热稳定性,从而达到稳定结构的目的。
储存条件
室温
运输条件
常规运输
备注
如果有可能,您尽量在使用的当天配置溶液,并在当天使用完它。但是,如果您需要预先配制储备溶液,我们建议您将溶液等份保存在-20°C的密封小瓶中。通常,它们最多可以使用一个月。在使用前和打开样品瓶之前,我们建议您让您的产品在室温下平衡至少1小时。需要更多关于溶解度,用法和处理的建议吗?请访问我们的常见问题(FAQ)页面以获取更多详细信息。
纯度
≥99%
名称和识别符
PubChem SID
分子类型
小分子
IUPAC Name
4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidin-2-one
INCHI
1S/C10H15N3O5/c1-4-2-13(10(17)12-8(4)11)9-7(16)6(15)5(3-14)18-9/h2,5-7,9,14-16H,3H2,1H3,(H2,11,12,17)/t5-,6-,7-,9-/m1/s1
InChi Key
ZAYHVCMSTBRABG-JXOAFFINSA-N
Smiles
CC1=CN(C(=O)N=C1N)C2C(C(C(O2)CO)O)O
Isomeric SMILES
CC1=CN(C(=O)N=C1N)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O
分子量
257.24
Reaxy-Rn
25358540
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=25358540&ln=

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高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 核苷、核苷酸及其类似物
类(Class) 嘧啶核苷
亚类(Subclass) 暂无
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 嘧啶核苷
其他上位类(Alternative Parents) 糖胺  戊糖  羟基嘧啶  氢化嘧啶  四氢呋喃  杂芳族化合物  仲醇  氧环化合物  氮杂环化合物  伯醇  有机光子化合物  有机氮化合物  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂单环化合物
取代基(Substituents) 羟基苯甲酸酯 - 芳香族杂单环化合物 - 氮杂环 - 糖基化合物 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 羟吡啶 - 羟基嘧啶 - 单糖 - N-羧酰胺基-α-氨基酸或其衍生物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 五碳单糖 - 初级醇 - 嘧啶 - 嘧啶核苷 - 醛基 - 四氢呋喃
描述(Description) 该化合物属于嘧啶核苷类有机化合物。这类化合物由嘧啶碱基与核糖基或脱氧核糖基相连构成。
外部描述符(External Descriptors) methylcytidine
三维结构
交互式化学结构模型





关联靶点(其它种属)
L1210 (27553 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
L1210/ara C (6 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
Vero (26788 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
作用机制
作用机制 Action Type target ID Target Name Target Type Target Organism Binding Site Name 参考文献
化学和物理性质
溶解性
可溶于水
比旋光度
15° (C=2,H2O)
熔点
211 °C(dec.)
分子量
257.240 g/mol
XLogP3
-2.000
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
4
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
5
可旋转键计数Rotatable Bond Count
2
精确质量Exact Mass
257.101 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
257.101 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
129.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
18
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
422.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
4
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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批号(Lot Number) 证书类型 货号
G2617050 分析证书 M168577
D1903148 分析证书 M168577
L2201233 分析证书 M168577
I2212116 分析证书 M168577
I2212117 分析证书 M168577
I2212118 分析证书 M168577
I2212119 分析证书 M168577
H2513051 分析证书 M168577
L2110174 分析证书 M168577
A2309471 分析证书 M168577
技术文档和文章
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