N-(4,6-二甲基吡啶-2-基)-4-(5-(三氟甲基)吡啶-2-基)哌嗪

CAS: 1542213-00-2 货号: N649509 分子式: C18H20F3N5S 分子量: 395.45 PubChem CID: 49853368
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文献证明

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概述


N-(4,6-dimethylpyridin-2-yl)-4-(5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)pipera is a human phosphoglycerate dehydrogenase ( PHGDH ) inhibitor, cytotoxic to PHGDH-dependent cancer cells, and reduces glucose-derived serine production, with an IC 50 of 3.7 μM against PHGDH
In Vitro(for reference only)
N-(4,6-dimethylpyridin-2-yl)-4-(5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)pipera is cytotoxic to MDA-MB-468, with an EC 50 of 15.2 μM.
Form:Solid
IC50& Target:IC50: 3.7 μM (PHGDH)

规格

规格或纯度
≥99%
英文名称
N-(4,6-dimethylpyridin-2-yl)-4-(5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)pipera
生化机理
N-(4,6-二甲基吡啶-2-基)-4-(5-(三氟甲基)吡啶-2-基)哌嗪是一种人磷酸甘油脱氢酶(PHGDH)抑制剂,对依赖 PHGDH 的癌细胞具有细胞毒性,可减少葡萄糖衍生丝氨酸的产生,对 PHGDH 的 IC 50 为 3.7 μM。
储存条件
-20°C储存
运输条件
超低温运输
纯度
≥99%
名称和识别符
分子类型
小分子
IUPAC Name
N-(4,6-dimethylpyridin-2-yl)-4-[5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]piperazine-1-carbothioamide
INCHI
1S/C18H20F3N5S/c1-12-9-13(2)23-15(10-12)24-17(27)26-7-5-25(6-8-26)16-4-3-14(11-22-16)18(19,20)21/h3-4,9-11H,5-8H2,1-2H3,(H,23,24,27)
InChi Key
HHKPPMSUPATMKP-UHFFFAOYSA-N
Smiles
CC1=CC(=NC(=C1)NC(=S)N2CCN(CC2)C3=NC=C(C=C3)C(F)(F)F)C
Isomeric SMILES
CC1=CC(=NC(=C1)NC(=S)N2CCN(CC2)C3=NC=C(C=C3)C(F)(F)F)C
PubChem CID
分子量
395.45

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高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机杂环化合物
类(Class) 二嗪烷
亚类(Subclass) 哌嗪类
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 吡啶基哌嗪
其他上位类(Alternative Parents) N-芳基哌嗪  二烷基芳胺  甲基吡啶  氨基吡啶及其衍生物  咪唑内酰胺类  杂芳族化合物  硫脲类  氮杂环化合物  有机光子化合物  有机氟化物  碳氢化合物衍生物  烷基氟化物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂单环化合物
取代基(Substituents) 氟化烷基 - 烷基溴化物 - 氨基吡啶 - 芳香族杂单环化合物 - 氮杂环 - 二烷基芳基胺 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 咪唑内酰胺 - 甲基吡啶 - N-芳基哌嗪 - 有机硝基化合物 - 有机氟化物 - 有机卤化物 - 有机氮化合物 - 有机氮化合物 - 有机硫化合物 - 吡啶 - 吡啶基哌嗪 - 硫代脲
描述(Description) 该化合物属于吡啶基哌嗪类有机化合物。这类化合物具有吡啶基哌嗪骨架,其结构特征为吡啶环通过非环状单键与哌嗪环相连(非共环结构)。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





关联靶点(人)
ALDH1A1 Tchem Aldehyde dehydrogenase 1A1 (77053 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
MDA-MB-468 (9477 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
HepG2 (196354 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
HSD17B4 Tbio Peroxisomal multifunctional enzyme type 2 (123 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
关联靶点(其它种属)
Bacillus subtilis (32866 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
ffp 4'-phosphopantetheinyl transferase ffp (24982 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
作用机制
作用机制 Action Type target ID Target Name Target Type Target Organism Binding Site Name 参考文献
化学和物理性质
溶解性
DMSO : 130 mg/mL (328.74 mM; Need ultrasonic)
分子量
395.400 g/mol
XLogP3
3.500
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
1
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
7
可旋转键计数Rotatable Bond Count
2
精确质量Exact Mass
395.139 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
395.139 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
76.400 Ų
重原子数Heavy Atom Count
27
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
510.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
0
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
安全和危险性(GHS)
象形图
信号词
警告
危险声明

H402: 对水生生物有害

H413: 可能对水生生物造成长期的有害影响

预防措施声明

P273: 避免释放到环境中。

P280: 戴防护手套/穿防护服/戴防护眼罩/戴防护面具。

P391: 收集溢出物

P501: 将内容物/容器处理到。。。

质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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溶液计算器