NCGC00247743

CAS: 1435192-04-3 货号: N651353 分子式: C24H29N3O2 分子量: 391.51 PubChem CID: 89564218
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-20°C储存
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超低温运输
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文献证明

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概述


NCGC00247743 is a histone lysine demethylase KDM4 inhibitor.

In Vitro

Based on structure-activity relationship studies, a series of chemical compounds are derived from 8-hydroxyquinoline (8HQ) and shown to be active inhibitors of KDM4E and KDM4A. The effect of these compounds is tested on the growth of LNCaP cells and NCGC00247751 (A1), NCGC00244536 (B3), and NCGC00247743 (I9) are selected. These inhibitors inhibit LNCaP cell growth with IC 50 s in the μM range. These compounds also inhibit the enzymatic activity of other KDM4 isoforms although, interestingly, the potency and efficacy of B3 and A1 for KDM4A, 4C, and 4D are lower compared to that of NCGC00247743 (I9), suggesting a potential selectivity of the inhibitors for different isoforms of KDM4. MCE has not independently confirmed the accuracy of these methods. They are for reference only.

Form:Solid

IC50& Target:KDM4

规格

规格或纯度
≥98%
英文名称
NCGC00247743
生化机理
NCGC00247743 是一种组蛋白赖氨酸去甲基化酶 KDM4 抑制剂。
储存条件
-20°C储存
运输条件
超低温运输
作用类型
抑制剂
纯度
≥98%
名称和识别符
分子类型
小分子
IUPAC Name
N-[6-(dimethylamino)hexyl]-3-(8-hydroxyquinolin-6-yl)benzamide
INCHI
1S/C24H29N3O2/c1-27(2)14-6-4-3-5-12-26-24(29)20-10-7-9-18(15-20)21-16-19-11-8-13-25-23(19)22(28)17-21/h7-11,13,15-17,28H,3-6,12,14H2,1-2H3,(H,26,29)
InChi Key
RAUALYDCIUPMKI-UHFFFAOYSA-N
Smiles
CN(C)CCCCCCNC(=O)C1=CC=CC(=C1)C2=CC(=C3C(=C2)C=CC=N3)O
Isomeric SMILES
CN(C)CCCCCCNC(=O)C1=CC=CC(=C1)C2=CC(=C3C(=C2)C=CC=N3)O
PubChem CID
分子量
391.51

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高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机杂环化合物
类(Class) 喹啉及其衍生物
亚类(Subclass) 苯基喹啉
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 苯基喹啉
其他上位类(Alternative Parents) 羟基喹啉  8-羟基喹啉  苯甲酰胺类  苯甲酰衍生物  1-羟基-4-未取代苯类化合物  1-羟基-2-未取代苯类化合物  吡啶及其衍生物  杂芳族化合物  三烷基胺  仲羧酸酰胺  氨基酸及其衍生物  氮杂环化合物  有机氧化合物  有机氧化物  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents) 1-羟基-2-未取代苯环化合物 - 1-羟基-4-未取代苯环化合物 - 8-羟基喹啉 - 氨基酸 - 氨基酸或其衍生物 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 苯甲酰胺 - 苯基化合物 - 苯甲酸或衍生物 - 苯甲酰 - 羧酰胺基 - 羧酸衍生物 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 羟基喹啉 - 单环苯基基团 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 苯酚 - 苯基吡啶 - 吡啶 - 醛基 - 三元脂肪胺 - 三芳基胺
描述(Description) 该化合物属于苯基喹啉类有机化合物。这类杂环化合物含有被苯基取代的喹啉结构单元。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





关联靶点(人)
KDM4A Tchem Lysine-specific demethylase 4A (52245 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
KDM4C Tchem Lysine-specific demethylase 4C (1129 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
作用机制
作用机制 Action Type target ID Target Name Target Type Target Organism Binding Site Name 参考文献
化学和物理性质
溶解性
DMSO : 62.5 mg/mL (159.64 mM; Need ultrasonic)
分子量
391.500 g/mol
XLogP3
4.200
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
2
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
4
可旋转键计数Rotatable Bond Count
9
精确质量Exact Mass
391.226 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
391.226 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
65.500 Ų
重原子数Heavy Atom Count
29
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
499.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
0
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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