Paromomycin (Aminosidine) sulfate 是一种的广谱氨基糖苷类抗生素 (antibiotic)，具有杀螨杀菌作用，是新霉素 (HY-B0470) 衍生物。Paromomycin sulfate 通过与细菌 30S 核糖体 A 位点的 RNA 寡核苷酸特异性结合，使 mRNA 的翻译提前终止，并抑制蛋白质合成。Paromomycin sulfate 可用于细菌和寄生虫感染的研究。

Product Application：

Paromomycin sulfate salt has been used as aÂ reference compound in antileishmanial activity, RNA-binding ligand and interacts with aptamer. This interaction prevents the binding (and cutting) of dicer to RNA duplex. It has also been used in cell culture applications at 100mg/L. Paromomycin inhibits the initiation and elongation steps of protein synthesis by binding to 16S ribosomal RNA. Paramomycin binds to the A site, which causes defective polypeptide chains to be produced and leads to cell death.

规格

别名

硫酸巴龙霉素

英文别名

规格或纯度

10mM in Water

英文名称

Paromomycin Sulfate

生化机理

广谱氨基糖苷类抗生素。蛋白质合成抑制剂。与16S核糖体RNA结合。口服具有活性

储存条件

-80℃储存

运输条件

特低温运输

名称和识别符

PubChem SID

528771625

分子类型

小分子

IUPAC Name

(2S,3S,4R,5R,6R)-5-amino-2-(aminomethyl)-6-[(2R,3S,4R,5S)-5-[(1R,2R,3S,5R,6S)-3,5-diamino-2-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-hydroxycyclohexyl]oxy-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxyoxane-3,4-diol;sulfuric acid

INCHI

1S/C23H45N5O14.H2O4S/c24-2-7-13(32)15(34)10(27)21(37-7)41-19-9(4-30)39-23(17(19)36)42-20-12(31)5(25)1-6(26)18(20)40-22-11(28)16(35)14(33)8(3-29)38-22;1-5(2,3)4/h5-23,29-36H,1-4,24-28H2;(H2,1,2,3,4)/t5-,6+,7+,8-,9-,10-,11-,12+,13-,14-,15-,16-,17-,18-,19-,20-,21-,22-,23+;/m1./s1

InChi Key

LJRDOKAZOAKLDU-UDXJMMFXSA-N

Smiles

C1C(C(C(C(C1N)OC2C(C(C(C(O2)CO)O)O)N)OC3C(C(C(O3)CO)OC4C(C(C(C(O4)CN)O)O)N)O)O)N.OS(=O)(=O)O

Isomeric SMILES

C1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1N)O[C@@H]2[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O)N)O[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO)O[C@@H]4[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@@H](O4)CN)O)O)N)O)O)N.OS(=O)(=O)O

关联CAS

7542-37-2；84420-34-8

分子量

615.63 (free base basis)

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高级数据

系统学分类

分类树（Taxonomy Tree）

界（kingdom) 有机化合物
- 超类（Superclass) 有机氧化合物
  - 类（Class) 有机氧化合物
    - 亚类（Subclass）碳水化合物和碳水化合物结合物
      - 第5级 (level 5) 氨基糖
        第6级 (level 6) 氨基糖苷类
        第7级 (level 7) 氨基环醇糖苷
        第8级 (level 8) 2-脱氧链霉胺氨基糖苷类
        第9级 (level 9) 4,5-二取代的2-脱氧链霉胺

界（kingdom)	有机化合物
超类（Superclass)	有机氧化合物
类（Class)	有机氧化合物
亚类（Subclass）	碳水化合物和碳水化合物结合物
中间层级节点（Intermediate Tree Nodes）	氨基糖 - 氨基糖苷类 - 氨基环醇糖苷 - 2-脱氧链霉胺氨基糖苷类
直接上位类(Direct Parent)	4,5-二取代的2-脱氧链霉胺
其他上位类（Alternative Parents）	双糖 O-糖基化合物氨基环醇及其衍生物环己醇环己胺有机硫酸氧烷四氢呋喃 1,2-氨基醇缩醛氧环化合物有机氧化物单烷基胺碳氢化合物衍生物伯醇有机光子化合物
分子骨架（Molecular Framework)	脂肪族杂单环化合物
取代基（Substituents）	1,2-氨基醇 - 4,5-二取代-2-脱氧链霉胺 - 乙醛酸 - 羟基苯甲酸酯 - 脂肪族杂单环化合物 - 氨基酸 - 氨基环醇或其衍生物 - 环醇 - 环醇或其衍生物 - 环己醇 - 环己胺 - 二糖 - 糖基化合物 - 烃衍生物 - O-羧基化合物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机磺酰胺 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 氧杂环丁烷 - 初级醇 - 初级脂肪胺 - 初级胺 - 醛基 - 硫代二羧酸 - 四氢呋喃
描述（Description）	该化合物属于有机化合物中的4,5-二取代-2-脱氧链霉胺类。这类化合物是2-脱氧链霉胺氨基糖苷，其糖苷键连接于呋喃糖基的C4位与C5位。
外部描述符（External Descriptors）	暂无

三维结构

交互式化学结构模型

球棍
棍棒
线框模型
空间填充
显示氢气
动画

关联靶点（人）

HEK293 (82097 活性数据)

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HFF (3142 活性数据)

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PCDH15 Tbio Protocadherin-15 (27 活性数据)

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SLCO1B1 Tchem Solute carrier organic anion transporter family member 1B1 (2672 活性数据)

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SLCO1B3 Tchem Solute carrier organic anion transporter family member 1B3 (2517 活性数据)

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RPSA Tbio 80S Ribosome (239 活性数据)

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关联靶点（其它种属）

Escherichia coli (133304 活性数据)

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Bacillus subtilis (32866 活性数据)

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rep Replicase polyprotein 1ab (378 活性数据)

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Bacillus spizizenii (1898 活性数据)

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SARS-CoV-2 (38078 活性数据)

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作用机制

作用机制	Action Type	target ID	Target Name	Target Type	Target Organism	Binding Site Name	参考文献

化学和物理性质

敏感性

对湿度敏感

比旋光度

48° (C=1,H2O)

分子量

713.700 g/mol

XLogP3

氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count

氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count

可旋转键计数Rotatable Bond Count

精确质量Exact Mass

713.264 Da

单同位素质量Monoisotopic Mass

713.264 Da

拓扑极表面积Topological Polar Surface Area

430.000 Å²

重原子数Heavy Atom Count

形式电荷Formal Charge

复杂度Complexity

952.000

同位素原子数Isotope Atom Count

定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count

未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count

定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count

未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count

所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds

共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count

安全和危险性（GHS）

RTECS

WK2320000

Merck Index

7041

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