A-395, 胚胎外胚层发育抑制剂

CAS: 2089148-72-9 货号: A607294 分子式: C26H35FN4O2S 分子量: 486.65 PubChem CID: 123132213
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文献证明

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概述

A-395 是一种多梳抑制复合物 2 (PRC2) 蛋白质-蛋白质相互作用的拮抗剂,可有效抑制三聚体 PRC2 复合物 (EZH2-EED-SUZ12),IC50为 18 nM。

靶点活性:PRC2:18 nM


A-395 is an antagonist of polycomb repressive complex 2 (PRC2) protein-protein interactions that potently inhibits the trimeric PRC2 complex (EZH2-EED-SUZ12, IC50: 18 nM).


规格

规格或纯度
Moligand™, ≥95%
英文名称
A-395
生化机理
体外:胚胎外胚层发育(EED)蛋白是多聚核抑制复合体 2(PRC2)的一个重要亚基。A-395 可拮抗 EED 的 H3K27me3 结合功能。A-395 与 H3K27me3 结合袋中的 EED 结合,从而阻止异位激活 PRC2 的催化活性。A-395 能够竞争 H3K27me3 肽与 EED 的结合,其 IC 50 为 7 nM。A-395 能以高度选择性的方式有效地减少 H3K27 甲基标记,从而调节细胞中 PRC2 的活性,而与之相近的化学类似物 A-395N 却不能。A-395 可抑制 H3K27me2 和 H3K27me3,其 IC 50 值分别为 390 nM 和 90 nM。此外,A-395 还能抑制对 SAM 竞争性 EZH2 抑制剂敏感的人类肿瘤细胞系的生长。MCE 尚未独立确认这些方法的准确性。仅供参考。
储存条件
-20°C储存
运输条件
超低温运输
作用类型
抑制剂
作用机制
胚胎外胚层发育抑制剂
纯度
≥95%
名称和识别符
PubChem SID
分子类型
小分子
IUPAC Name
(3R,4S)-1-(7-fluoro-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)-N,N-dimethyl-4-[4-(4-methylsulfonylpiperazin-1-yl)phenyl]pyrrolidin-3-amine
INCHI
1S/C26H35FN4O2S/c1-28(2)25-18-30(24-12-9-20-5-4-6-23(27)26(20)24)17-22(25)19-7-10-21(11-8-19)29-13-15-31(16-14-29)34(3,32)33/h4-8,10-11,22,24-25H,9,12-18H2,1-3H3/t22-,24?,25+/m1/s1
InChi Key
REVJNSVNICWODC-KIDMSAQOSA-N
Smiles
CN(C)C1CN(CC1C2=CC=C(C=C2)N3CCN(CC3)S(=O)(=O)C)C4CCC5=C4C(=CC=C5)F
Isomeric SMILES
CN(C)[C@H]1CN(C[C@@H]1C2=CC=C(C=C2)N3CCN(CC3)S(=O)(=O)C)C4CCC5=C4C(=CC=C5)F
PubChem CID
分子量
486.65

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系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机杂环化合物
类(Class) 二嗪烷
亚类(Subclass) 哌嗪类
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 苯基哌嗪类
其他上位类(Alternative Parents) N-芳基哌嗪  苯基吡咯烷  Indanes  二烷基芳胺  苯胺和取代苯胺  芳烷基胺  N-烷基吡咯烷  磺酰基  吡咯类  有机磺酸及其衍生物  三烷基胺  氟乙烯  氟烯烃  烯胺  氮杂环化合物  有机光子化合物  有机氟化物  有机氧化物  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents) 3-苯基吡咯烷 - 氨基酸 - 苯胺或取代苯胺 - 芳烷基胺 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 苯基化合物 - 二烷基芳基胺 - 萘醌 - 氟萘 - 卤代乙烯 - 烃衍生物 - 茚烷 - 单环苯基基团 - N-烷基吡咯烷 - N-芳基哌嗪 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机磺酸或其衍生物 - 有机氟化物 - 有机卤化物 - 有机氮化合物 - 有机氮化合物 - 有机磺酸或其衍生物 - 有机硫化合物 - 苯基哌嗪 - 吡咯 - 吡咯烷 - 磺酰基 - 三元脂肪胺 - 三级脂肪族/芳香族胺 - 三芳基胺 - 乙烯基氟化物 - 乙烯基卤化物
描述(Description) 该化合物属于苯基哌嗪类有机化合物。这类化合物具有苯基哌嗪骨架,即哌嗪环与苯基相连的结构。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





关联靶点(人)
EED Tchem 多梳蛋白EED(Polycomb protein EED) (7 活性数据)
活性类型 活性值-log(M) 作用机制 期刊 参考文献(PubMed IDs)
ABL1 Tclin Tyrosine-protein kinase ABL (18331 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
GSK3B Tclin Glycogen synthase kinase-3 beta (11785 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
CSNK1D Tchem Casein kinase I delta (4546 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
CDK2 Tchem Cyclin-dependent kinase 2 (9050 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
AURKA Tchem Serine/threonine-protein kinase Aurora-A (10240 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
U2OS (164939 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
BRD4 Tchem Bromodomain-containing protein 4 (13122 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
EED Tchem Polycomb protein EED (645 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
KARPAS-422 (454 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
TRIM24 Tchem Transcription intermediary factor 1-alpha (2087 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
BRPF1 Tchem Peregrin (2217 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
EZH2 Tclin EZH2/SUZ12/EED complex (20 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
HEK-293T (167025 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
关联靶点(其它种属)
Mapk1 MAP kinase ERK2 (650 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
Fgfr3 Fibroblast growth factor receptor 3 (21 活性数据)
活性类型 Relation Activity value Units Action Type 期刊 PubMed Id doi Assay Aladdin ID
作用机制
作用机制 Action Type target ID Target Name Target Type Target Organism Binding Site Name 参考文献
化学和物理性质
分子量
486.600 g/mol
XLogP3
3.100
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
0
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
7
可旋转键计数Rotatable Bond Count
5
精确质量Exact Mass
486.246 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
486.246 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
55.500 Ų
重原子数Heavy Atom Count
34
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
789.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
2
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
1
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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批号(Lot Number) 证书类型 货号
E2420503 分析证书 A607294
E2420506 分析证书 A607294
E2420507 分析证书 A607294
E2420508 分析证书 A607294
E2420511 分析证书 A607294
E2420512 分析证书 A607294
E2420513 分析证书 A607294
E2420515 分析证书 A607294
溶液计算器