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| 活性类型 | 活性值-log(M) | 作用机制 | 期刊 | 参考文献(PubMed IDs) |
|---|
Cl-amidine TFA
有货
为什么选择此级别
提供 ≥97% 纯度，适用于对基线干扰要求严格的色谱和分析工作流程。
储存与运输
-20°C储存。超低温运输 。请查阅批次 COA 获取详细规格。
质量文档
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文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
Information
Cl-amidine Cl-amidine is an irreversible pan- peptidylarginine deiminase (PAD) inhibitor with IC50 values of 5.9 ± 0.3 μM, 0.8 ± 0.3 μM, 6.2 ± 1.0 μM for PAD4, PAD1 and PAD3, respectively. Cl-amidine induces apoptosis .
Targets
PAD1 (Cell-free assay); PAD4 (Cell-free assay); PAD3 (Cell-free assay) 0.8 μM; 5.9 μM; 6.2 μM
In vitro
Cl-amidine antagonizes the PAD4-mediated enhancement of the the p300GBD-GRIP1 interaction in a dose-dependent manner. The inhibitory effect of this compound is not a nonspecific one but is targeted at the active PAD4 enzyme. Cl-amidine increases p53 expression in CD45 positive immune cells. It triggers the differentiation and apoptosis of multiple cancer cell lines that are p53+/+ and p53−/− (e.g., HL60, HT29, TK6, and U2-OS cells). Cl-amidine induces the expression of p53 and several downstream target genes including the cyclin dependent kinase inhibitor p21, GADD45, and the proapoptotic protein PUMA in U2-OS osteosarcoma cells.
In vivo
Cl-amidine treatment inhibits NZM(New Zealand mixed 2328) NET(neutrophil extracellular trap) formation in vivo and significantly alters circulating autoantibody profiles and complement levels while reducing glomerular IgG deposition. Further, Cl-amidine increases the differentiation capacity of bone marrow endothelial progenitor cells, improves endothelium-dependent vasorelaxation, and markedly delays time to arterial thrombosis induced by photochemical injury. Cl-amidine delays thrombosis development in NZM mice. It inhibits PADs in mice without significant toxicity and improves disease phenotypes in animal models of inflammatory arthritis and inflammatory bowel disease. And It is shown to reduce disease severity in mouse models of ulcerative colitis and RA.
Cell Research(from reference)
Cell lines：CV-1 cells
Concentrations：0-200 μM
Incubation Time：40 h
规格
别名
氯脒TFA | (S)-N-(1-氨基-5-(2-氯乙酰脒)-1-氧代戊烷-2-基)苯甲酰胺 2,2,2-三氟乙酸盐
英文别名
(2S)-5-(2-Chloroethanimidamido)-2-(phenylformamido)pentanamide trifluoroacetic acid salt
规格或纯度
≥97%
英文名称
Cl-amidine TFA
生化机理
氯脒是一种不可逆的泛肽基精氨酸脱氨酶（PAD）抑制剂，对 PAD4、PAD1 和 PAD3 的 IC50 值分别为 5.9 ± 0.3 μM、0.8 ± 0.3 μM、6.2 ± 1.0 μM。氯脒诱导细胞凋亡。
储存条件
-20°C储存
运输条件
超低温运输
作用类型
激活剂
纯度
≥97%
名称和识别符
PubChem SID
分子类型
小分子
IUPAC Name
N-[(2S)-1-amino-5-[(1-amino-2-chloroethylidene)amino]-1-oxopentan-2-yl]benzamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
INCHI
1S/C14H19ClN4O2.C2HF3O2/c15-9-12(16)18-8-4-7-11(13(17)20)19-14(21)10-5-2-1-3-6-10;3-2(4,5)1(6)7/h1-3,5-6,11H,4,7-9H2,(H2,16,18)(H2,17,20)(H,19,21);(H,6,7)/t11-;/m0./s1
InChi Key
WUSNMVYWOLUWDD-MERQFXBCSA-N
Smiles
C1=CC=C(C=C1)C(=O)NC(CCCN=C(CCl)N)C(=O)N.C(=O)(C(F)(F)F)O
Isomeric SMILES
C1=CC=C(C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(CCl)N)C(=O)N.C(=O)(C(F)(F)F)O
关联CAS
分子量
424.80
技术文档
高级数据
系统学分类
分类树（Taxonomy Tree）
| 界（kingdom) | 有机化合物 |
|---|---|
| 超类（Superclass) | 苯类化合物 |
| 类（Class) | 苯及其取代衍生物 |
| 亚类（Subclass） | 苯甲酸及其衍生物 |
| 中间层级节点（Intermediate Tree Nodes） | 苯甲酰胺类 |
| 直接上位类(Direct Parent) | 马尿酸及其衍生物 |
| 其他上位类（Alternative Parents） | N-酰基-α氨基酸及其衍生物 苯甲酰衍生物 脂肪酰胺 α-卤代羧酸 仲羧酸酰胺 伯羧酸酰胺 炔丙基型1,3-偶极有机化合物 甲脒类 一元羧酸及其衍生物 甲脒类 羧酸 碳氢化合物衍生物 有机氧化物 羰基化合物 有机氯化物 有机氟化物 烷基氟化物 烷基氯 |
| 分子骨架（Molecular Framework) | 暂无 |
| 取代基（Substituents） | 氟化烷基 - 氟化烷基 - 烷基溴化物 - α-氨基酸或其衍生物 - α-卤代羧酸 - α-卤代羧酸或其衍生物 - 氨基脒 - 芳香族同单环化合物 - 苯甲酰 - 羰基 - 羧酰胺基 - 羧酰亚胺 - 羧酰胺基 - 羧酰胺基 - 羧酸衍生物 - 脂肪酰基 - 脂肪酰胺 - 马尿酸或其衍生物 - 烃衍生物 - 单羧酸或其衍生物 - N-乙酰基-α-氨基酸或其衍生物 - N-取代-α-氨基酸 - 有机1,3-双极性化合物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机氯化物 - 有机氟化物 - 有机卤化物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 醛基胺 - 丙炔型1,3-双极性有机化合物 - 醛基 |
| 描述（Description） | 该化合物属于马尿酸及其衍生物类有机化合物。这类化合物含有马尿酸或其衍生物，其结构特征为苯甲酰基连接在甘氨酸的N端。 |
| 外部描述符（External Descriptors） | 暂无 |
三维结构
交互式化学结构模型
产品属性
| ALogP | 1.333 |
|---|---|
| hba_count | 3 |
| HBD Count | 3 |
| Rotatable Bond | 10 |
关联靶点（人）
PADI1
Tchem
1 型蛋白质精氨酸脱亚胺酶(Protein-arginine deiminase type-1)
(1 活性数据)
HL-60
(67320 活性数据)
PADI4
Tchem
Protein-arginine deiminase type-4
(309 活性数据)
PADI1
Tchem
Protein-arginine deiminase type-1
(130 活性数据)
PADI2
Tchem
Protein-arginine deiminase type-2
(138 活性数据)
PADI3
Tchem
Protein-arginine deiminase type-3
(118 活性数据)
作用机制
| 作用机制 | Action Type | target ID | Target Name | Target Type | Target Organism | Binding Site Name | 参考文献 |
|---|
化学和物理性质
溶解性
Solubility (25°C) In vitro DMSO: 84 mg/mL warmed with 50ºC Water: bath (197.74 mM); Ethanol: 84 mg/mL warmed with 50ºC Water: bath (197.74 mM); Water: 70 mg/mL warmed with 50ºC Water: bath (164.78 mM);
DMSO(mg / mL) Max Solubility
84
DMSO(mM) Max Solubility
197.740113
Water(mg / mL) Max Solubility
70
Water(mM) Max Solubility
164.7834275
分子量
424.800 g/mol
XLogP3
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
4
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
8
可旋转键计数Rotatable Bond Count
8
精确质量Exact Mass
424.113 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
424.113 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
148.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
28
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
465.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
1
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
2
质检证书（CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
输入批号以搜索分析图谱:
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| 批号(Lot Number) | 证书类型 | 货号 |
|---|---|---|
 F2603403 |
分析证书 | C413918 |
| F2603402 |
分析证书 | C413918 |
| F2603401 |
分析证书 | C413918 |
| F2603379 |
分析证书 | C413918 |
| F2603378 |
分析证书 | C413918 |
| D2312924 |
分析证书 | C413918 |
| D2312977 |
分析证书 | C413918 |
| D2312961 |
分析证书 | C413918 |
| D2312959 |
分析证书 | C413918 |
| D2312946 |
分析证书 | C413918 |
| D2312945 |
分析证书 | C413918 |
| D2312942 |
分析证书 | C413918 |
| D23121012 |
分析证书 | C413918 |
| I2404295 |
分析证书 | C413918 |
| I2404296 |
分析证书 | C413918 |
| D2312986 |
分析证书 | C413918 |
| D2312958 |
分析证书 | C413918 |
溶液计算器
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