利用 BIAcore 分析相互作用的蛋白质
利用 BIAcore 分析相互作用的蛋白质
BIAcore表面等离子共振广泛应用于:
(1)研究各种生物分子(如多肽、蛋白质、寡核苷酸,以及病毒、细菌、小分子化合物)之间的相互作用过程;(2)特异性抗体检测或质控、疾病机制、药物筛选;
(3)相关药物动力学实时监测、配体垂钓、免疫调节、结构-功能关系等。
操作方法
利用BIAcore分析相互作用的蛋白质
原理
Biacore是基于表面等离子体共振(SPR)技术来实时跟踪在天然状态下生物分子间的相互作用,无需任何标记物。表面等离子体共振(surface plasmonresonance,SPR)是一种光学现象,在传感芯片发生全反射界面上有一层约50nm厚的金属膜,偏振光入射到棱镜的一端,在棱镜与金属膜的界面会产生表面等离子波,当入射光波的传播常数与表面等离子波的传播常数匹配时,金属膜内的自由电子会产生共振,即表面等离子共振体。分析时,先将一种生物分子即配体(蛋白、抗体等)偶联在生物传感器表面,再将含有另一种能与靶分子产生相互作用的生物分子(分析物)的溶液注入并流经生物传感器表面。生物分子间的结合引起生物传感器表面质量的增加,导致折射率的变化,通过监测SPR的角度变化,可自动获得分析物的动力学结合和解离常数、亲和力及特异性等。生物分子间反应的变化即被观察到。
材料与仪器
蛋白样品 步骤 第一阶段 捕获表面的制备和结合试验 材料 缓冲液和溶液 EDC[0.2mol/L 的 N-乙基-N'-(二甲氨基丙基)-碳化二亚胺的水溶液] 氨基乙醇(1ml/L 盐酸乙醇胺,用 NaOH 调节至 pH8.5) Extraclean HEPES 缓冲的盐水缓冲液 HCl(20 mmol/L) NHS(0.05 ml/L 的 N-羟基琥珀酰亚胺水溶液) 抗体 小鼠抗-TSH 单克隆抗体(lmg/ml,溶于 HEPES 缓冲盐水) 兔抗小鼠-Fc 结构域 (RAMc)(30ug/ml, 溶于 l0 mmol/L 的 pH5.0 醋酸钠溶液) TSH(20umol/L,溶于 HEPES 缓冲盐水) 专用装置 BIAcore 仪器 CM-5 传感芯片 方法 RAMc 通过伯氨基与 CM-5 传感芯片表面的结合 1. 将 CM-5 传感芯片模块嵌入 BLAcore 仪器。 2. 全部采用过滤并除气的 HEPES 缓冲盐溶液。 3. 将分别含有 NHS、EDC、乙醇胺和 RAM Fc 以及 20 mmol/L HCl 各 100 的小管置于 BIAcore 自动进样器架的适当位置。 4. 将一个空管置于 BIAcore 自动进样器架上。 5. 开动仪器,以 5ul/min 的流速流过一个流动池。 6. 将 75ul 的 NHS 加入到一个空管中。 7. 在同一管中再加入 75ul 的 EDC。 8. 将含有 NHS 和 EDC 的小管中的成分混匀。 9. 注射 35ul NHS/EDC 混合物使表面活化。 10. 注射 35ul RAM Fc 到活化表面与抗体结合。 11. 注射 35ul 乙醇胺使过量的反应基团失活。 12. 快速注射 10ul 的 20 mmol/LHCl, 然后用 Extradean 除去非共价结合型材料。 13. 通过在开始注射 RAMc 前放置一个基线报道点,并在注射 20 mmol/L HCl 结束后 2 min 放置第二个报道点,来测定结合 RAMc 的水平。 14. 关闭流动液,关闭命令窗口,保存报道文件。 15. 开动仪器,使含有结合 RAMc 的流动池的流速为 10ul/min。 16. 注射 10ul 的 2ug/ml 抗-TSH(这需要总共 40ul 的抗-TSH 溶液)。 17. 快速注射 10ul 的 20 mmol/L HCl,然后用 Extraclean 再生 RAMc 表面。 18. 为了测定结合到 RAMc 表面的重现性,用可以与抗 TSH 结合引起 250RUs 所需的体积重复注射抗 TSH。 19. 快速注射 10ul 的 20 mmol/L HCl,然后用 Extradean 再生 RAMc 表面。 20. 关闭流动液体,关闭命令窗口,保存报道文件。 21. 开动仪器,使含有结合 RAMc 的流动池的流速为 10pl/min。 22. 注射 10ul 的 2ug/ml 抗-TSH(或者注射第 15~20 步所测得的、与抗-TSH 结合引起 250RUs 所需的体积)。 23. 注射 25ul 的 200nmol/LTSH, 限定 120s 的解离时间(这需要总共 65ul 的 TSH 溶液)。 120s 的解离时间就可以测得抗原-抗体复合物解离的速率。 注射约 20ul 的 200nmol/LTSH 以后,曲线会变平(斜率达到零),表示在抗原和抗体分于间的相互作用达到瞬时稳态。如果曲线没有变平,就再生表面,并将第 23 步中 TSH 的浓度改为 400nmol/L 后,重复第 21~23 步(见图 18-26 和图 18-27)。 24. 快速注射 10ul 的 20 mmol/LHCl, 然后用 Extraclean 再生 RAMc 表面。 25. 关闭流动流,关闭命令窗口,保存报道文件。 第二阶段 抗原-抗体相互作用的动力学分析 材料 缓冲液和溶液 HEPES 缓冲的盐水缓冲液或适当的冲洗缓冲液 抗体 小鼠抗-TSH 单克隆抗体(lmg/ml, 溶于 HEPES 缓冲盐溶液) TSH(20umol/L,溶于 HEPES 缓冲盐溶液) 制备一系列注射用 TSH 稀释液: 1. 制备浓度为 200、100、50、25、10 以及 5nmol/L 的不同稀释液,每一份均溶于 280ul 的流动缓冲液中用于实验。 专用装置 BIAcore 仪器 CM-5 传感芯片,按第一阶段的介绍与 RAMc 结合。 方法 下列程序由三种方法模块或小段所组成:主程序、定义分析程序(DEFINEAPROG) 以及定义样品。注意一共有四个定义分析程序模块,在这四个程序中每一个均代表了主程序中的一部分(模块 1、模块 2、模块 3 以及模块 4)。当用软件编辑一个方法时,方法命令应釆用大写字母书写,用户所定义的参数用小写字母书写。 后跟感叹号(!)的部分注释仪器会认为是文字而非命令代码,会插入解释前一条命令的含义。 注意事项 样本的要求1. 通过等电聚焦或者使用软件预测,确定待分析蛋白的等电点。对等电点高于7或者小于3的蛋白一般不推荐进行 Biacore 分析,特殊需求可与相关技术人员进行个例商讨。 2. 固定于传感片上的靶蛋白(例如:受体蛋白)和待分析蛋白,纯度要达到95%以上。 3. 用 PBS(或者用户蛋白所需的特殊缓冲液)对蛋白溶液进行透析,然后浓缩至 200ug/ml~1mg/ml 的浓度。 4. 化合物溶解在含 1‰ DMSO 的 HBS 缓冲液中,并稀释成 10-5M 和 10-6M 两种浓度进行初步分析;初步分析呈阳性的化合物再用含 1‰ DMSO 的缓冲液稀释成 10-5M, 5×10-6M, 2×10-6M, 1×10-6M, 5×10-7M 和 1×10-7M 的浓度梯度进行动力学常数分析。 5. 如果化合物无法溶解在含 1‰ DMSO 的 HBS 缓冲液中,则可以提高 DMSO的浓度,最高可至 1%的浓度。同时配制相应浓度的DMSO 缓冲液作为对照进行实验。 常见问题 本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。 如需了解更多产品详情,请前往阿拉丁官网查询。
EDC 氨基乙醇 Extraclean HEPES 缓冲的盐水缓冲液 HCl NHS 小鼠抗-TSH 单克隆抗体 兔抗小鼠-Fc 结构域 TSH TSH 稀释液
BIAcore 仪器 CM-5 传感芯片
将贮存溶液稀释到适当的浓度。
Extraclean 是一种用于表面再生的溶液, 可由 BIAcore 购得。
10 mmol/L HEPES(pH7.4)
150 mmol/L NaCl
3 mmol/L EDTA
0.005%(V/V) 吐温-20
该缓冲液可以从 BIAcore 购得。
EDC, 氨基乙醇以及 NHS 是由 BIAcore 购得的 Amine-coupling Kit 中的一部分
该抗体可以从 Alexon Trend,Inc. 购得。
该抗体可以从 BIAcore 购得。
TSH 可以从 Alexon Trend,Inc. 购得。
该仪器包括 BIAcore 控制软件和 BIA 评价软件。
设备和软件可以从 BIAcore,Inc. 购得,相关的信息可査阅 www.biacore.com。
这一步要用约 45 min。通过下拉菜单或 BIAcore 控制软件工具栏中的图标来执行操作命令。
如果采用的是 Immobilization Wizard,则可以进行这一步。(Wizards 是 BIA2000 和 BIA3000 中 BlAcore 控制软件 3.0 版本或更高版本的标准配制。)使用 Wizard 的话,按规定体积添加样品。结合 RAM Fc 的 RUs 目标数为 13000。
固定 RAMc 的最终 RUs 值应该介于 10000 到 13000 之间;如果所得值偏低,可能是由于所用的 RAMc 浓度太低,或使用了贮存期超过 2 个月的 NHS 或 EDC 溶液。RAMc 的 RUs 值较低的表面仍然可以使用,但抗 TSH 的体积必须按经验进行调整;通常地,需要更多的抗-TSH 以达到期里的结合水平。
在这时 BIAcore 可以处于预备(继续)状态,也可以在下一阶段直接使用表面。当缓冲液在仪器内保持流动时,RAMc 表面在机器里是非常稳定的。另外,芯片也可以拿出来保存在 4°C、含有少量水的 50 ml 锥形管中;以这种方式保存时表面可以稳定凡个星期。
检测抗-TSH 与 RAMc 表面的结合这一步要用约 20 min。通过下拉菜单或 BLAcore 控制软件工具栏中的图标来执行操作命令。
10ul 的抗-TSH 可以提髙约 250 个 KUs。如果 RAMc 表面的结含不能达到这种水平,再生(见第 17 步)并重复注射不同体积的抗-TSH,直至确定所需的注射体积。
检测 TSH 与捕获抗-TSH 表面的结合
这一步要用约 20 min。通过下拉菜单或 BIAcore 控制软件工具栏中的图标来执行操作命令。

将贮存溶液稀释到适当的浓度。
10 mmol/LHEPES(pH7.4)
150 mmol/LNaCl
3 mmol/LEDTA
0.005%(V/V) 吐温-20
该缓冲液可以从 BIAcore 购得。
该抗体可以从 Alexon Trend,Inc. 购得。
将抗体稀释到 2ug/ml 并制备 1000ul 或所需体积)来达到第一阶段第 15~20 步所测得的目标共振单位。
TSH 可以从 Alexon Trend,Inc. 购得。
2. 每个浓度按每份 70ul 分装于四个 7 mm 塑料小瓶中,每个小瓶加盖。
3. 将小瓶按样品循环参数的指示放置在 BIAcore 管架的适当位置。
该仪器包括 BIAcore 控制软件和 BIA 评价软件。
设备和软件可以从 BIAcore,Inc. 购得,相关的信息可査阅 www.biacore.com。





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