模板 DNA 的准备、实验的组织和 PCR 扩增实验
模板 DNA 的准备、实验的组织和 PCR 扩增实验
可以用各种方法分离基因组 DNA, 主要决定于初始材料的种类(血液还是组织)和数量。所有制备的 DNA 都应该储存于 pH8.0 的 TE 缓冲液中并装在灭菌的 Eppendorf 管内。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
操作方法
模板DNA的准备、实验的组织和PCR扩增实验
材料与仪器
PCR 缓冲液 ddH20 基因组 DNA dNTP 寡核苷酸引物 步骤 一、材料 1. 缓冲液、溶液和试剂 含 15 mmol/LMgCl2 的 10XPCR 缓冲液 (GeneAmpPCR 缓冲液 I,AppliedBiosystems) 灭过菌的 ddH20 2. 酶和酶缓冲液 TaqDNA 聚合酶,(AppliedBiosystems 或 Invitrogen) 3. 核酸和寡核苷酸 基因组 DNA 10 mmol/L dNTP(GeneAmpPCRdNTP 混合物,AppliedBiosystems) 寡核苷酸引物(Invitrogen 公司合成,稀释成 lOumol/L) 4. 离心机和转子 用翻转吊桶式转子和微板适配器离心 5. 专用设备 丙烯酸防护板(acrylicshield) 过滤阻挡吸头(filterbarriertips) 多道移液器(Eppendorf 或 ApogentDiscoveries) PCR 仪,96 孔(AppliedBiosystemsGeneAmp9700) 托盘/固定器装置和底座,96 孔(AppliedBiosystems) 管盖,一条 8 个(USAScientific 或 AppliedBiosystems) 小管,0.2 ml,一条 8 个(USAScientific 或 AppliedBiosystems) 二、方法 1. 在冰上融化 dNTP、10XPCR 缓冲液和未标记的引物。Taq 酶在加入反应混合物之前应保存在-20°C。在丙烯酸防护板后融化标记的引物。 2. 每一个反应的混合物包括: 灭菌 ddH20 6.95ul 含 MgCl2 的 10XPCR 缓冲液 1.25ul 10mmol/LdNTP 0.25ul 10mmol/L 未标记引物 0.5ul 标记引物 0.5ul 在优化实验条件过程中,如果 PCR 产物的放射信号强度太低,可以增加标记引物的用量,同时按相应 比例调整 ddH20 的体积。 TaqDNA 聚合酶(终浓度为 0.25U) 0.05ul 对于一个 96 孔微孔板,准备用于 100 个反应的混合物。 3. 混匀,按等份加入放置在冰上的 PCR 板中(9.5ul/样品)。 4. 用多道移液器加入 3ulDNA(60ng),混匀。 5. 把盖子盖紧,将板放入预热到 94°C 的 PCR 仪中。 6. 如果产物大小是 200bp, 扩增 30 个循环。循环参数如下:94°C 初始变性 5 min;30个循环的 94°C 变性 30s; 根据经验确定的退火温度(Tm) 退火 30s;72°C 延伸 30s。最后一步 72°C 延伸 7 min。值可以通过引物序列计算出来,公式为 2(A+T)+4(G+C)。 7. 扩增完成后,将样品于-20°C 冻存,或者直接进入方案 3。 如需了解更多产品详情,请前往阿拉丁官网查询。
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