低丰度核酸反转录及扩增实验
低丰度核酸反转录及扩增实验
此方法仅使用一种重组的酶——rTth DNA聚合酶,它可在一个反应中同时进行反转录和扩增,从而不再需要两种不同的缓冲体系。
操作方法
一步法
材料与仪器
核酸 步骤 1. 用过氧化物酶,蛋白酶K和DNA酶预处理载玻片。 2. 配置如下一步反应体系(总体积100 μl) 如需了解更多产品详情,请前往阿拉丁官网查询。
dNTP MnCl2 MgCl2 BSA rTth DNA聚合酶
水浴锅 培养箱
(1)0.5 μl 100 μmol/l 正向引物(终浓度0.5 μmol/l)
(2)0.5 μl 100 μmol/l 反向引物(终浓度0.5 μmol/l)
(3)6 μl 3 mmol/l 4dNTP混合物(终浓度0.12 mmol/l)
(4)2 μl 10 mmol/l MnCl2(终浓度0.2 mmol/l)
(5)10 μl 25 mmol/l MgCl2(终浓度2.5 mmol/l)
(6)2 μl 10×rTth 转录缓冲液(终浓度0.2×)
(7)8 μl 10×螯合缓冲液(终浓度0.8×)
(8)10 μl 1.7 mg/ml BSA(终浓度0.17 mg/ml)
(9)2 μl 2.5 U/ml rTth DNA聚合酶(终浓度9.05 U/ml)
(10)29 μl DEPC处理过的水
3. 用20 μl 吸头加8 μl(如用3孔载玻片)或12~20 μl (如用单孔载玻片)原位PCR扩增体系于各孔上,该液体覆盖整个孔表面。
4. 放20 mm×60 mm 盖玻片于每一载玻片上,小心用指甲油封住盖玻片边缘。 5. 在92℃加热块上,温育玻片90 s。然后转至热循环仪。
6. 用步骤2所配一步反应体系代替原位PCR反应体系。
7. 按如下温度循环程序进行反转录:
(1)1个循环:15 min,70℃
(2)3 min,92℃
(3)15 min,70℃
(4)3 min,92℃
(5)15 min,70℃
8. 按如下温度循环程序进行原位PCR:
(1)29个循环:1 min,93℃(变性)
(2)1 min,53℃(退火)
(3)1 min,72℃(延伸)
(4)最后一步:不定,4℃(维持)
9. 由热循环仪上取下载玻片,浸于100%乙醇中≥5 min 溶解指甲油,用剃须刀或其他小刀橇开盖玻片,刮去残留的指甲油,以便在杂交/检测步骤中能平放上新的盖玻片。
10. 在92℃加热块上温育玻片1 min,然后于室温下用2×SSC浸泡5 min。玻片在4℃可存敢2~3周。
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