病毒DNA/RNA快速提取试剂盒:操作规程与使用指南
病毒DNA/RNA快速提取试剂盒:操作规程与使用指南
Viral DNA/RNA Rapid Extraction Kit 是一款快速、可靠的试剂系统,专为从多种生物样本中分离高质量病毒DNA和RNA而设计,采用简便的柱式操作流程,适用于多种下游分子生物学应用。
- 货号
- D1128032
- 产品名称
- 病毒DNA/RNA快速提取试剂盒
- 核酸提取对象
- 病毒DNA与RNA(可同时或单独提取)
- 适用样本类型
- 血清、血浆、全血、拭子、无细胞体液及其他含病毒样本
- 操作格式
- 离心柱式,无需苯酚-氯仿
- 下游应用兼容性
- RT-PCR、qPCR、测序、NGS文库构建
- 储存条件
- 各组分按说明书标注温度储存,请参阅试剂盒说明书
试剂盒概述与原理
阿拉丁科学病毒DNA/RNA快速提取试剂盒(D1128032)专为从多种生物样本中快速、高效地分离病毒DNA和RNA而设计。该试剂盒采用硅胶膜离心柱格式,在离液盐条件下选择性结合核酸,通过一系列洗涤步骤去除蛋白质、脂质及其他杂质,最终用低盐缓冲液或无核酸酶水洗脱纯化的核酸。
离液裂解缓冲液在接触样本后可迅速灭活核酸酶(RNase和DNase),有效保护特别易降解的病毒RNA的完整性。简化的柱式操作流程无需使用苯酚、氯仿等有害有机溶剂,提高了实验室安全性和通量。所得洗脱液适用于多种高灵敏度下游应用,包括逆转录PCR(RT-PCR)、定量PCR(qPCR)、Sanger测序及二代测序(NGS)文库构建。
所需材料与仪器设备
试剂盒内含组分:
- 裂解/结合缓冲液(离液型,含盐酸胍盐)
- 洗涤缓冲液1(用于去除蛋白质和抑制物)
- 洗涤缓冲液2(乙醇基础;首次使用前请按瓶标说明加入无水乙醇)
- 洗脱缓冲液(低盐、无核酸酶)或无核酸酶水
- 硅胶膜离心柱
- 收集管(2 mL)
- 载体RNA(如有附带;使用前加入裂解缓冲液,以提高低拷贝病毒核酸的回收率)
需自备材料:
- 可达≥10,000 × g的微量离心机
- 涡旋混合仪
- 100%乙醇(分子生物学级)
- 无核酸酶1.5 mL微量离心管(用于洗脱液收集)
- 移液器及无核酸酶气溶胶屏障吸头
- 个人防护装备(手套、实验服、护目镜)
- 可选:加热模块或水浴锅(设定至56–70°C,用于增强裂解效果)
分步提取操作规程
操作前重要提示:确保洗涤缓冲液2已按瓶标说明补加所需体积的100%乙醇。如随盒提供载体RNA,请在裂解缓冲液中加入至推荐浓度配制工作液。将洗脱缓冲液预热至70°C以最大化核酸产量。处理含RNA样本时请在冰上操作,以减少降解。
- 样本裂解:将推荐体积的裂解/结合缓冲液加入样本(如200 µL血清或血浆),涡旋混匀15秒。如规程要求,在56–70°C孵育10分钟,以确保彻底裂解和核酸酶灭活。
- 加入乙醇:向裂解液中加入指定体积的100%乙醇,涡旋或吹打混匀,促进核酸与硅胶膜结合。
- 上柱:将全部裂解液-乙醇混合液转移至置于2 mL收集管中的硅胶膜离心柱,以8,000–10,000 × g离心1分钟,弃去流穿液,将柱重新置于收集管中。若裂解液体积超过柱容量,可分批上样,每次离心后弃去流穿液。
- 第一次洗涤:向柱中加入指定体积洗涤缓冲液1,以8,000–10,000 × g离心1分钟,弃去流穿液。
- 第二次洗涤:向柱中加入指定体积已补加乙醇的洗涤缓冲液2,以8,000–10,000 × g离心1分钟,弃去流穿液。
- 膜干燥:将空柱以最高转速(≥10,000 × g)再离心2分钟,去除残余乙醇,防止其抑制下游酶促反应。
- 洗脱:将离心柱转移至新的、已标记的无核酸酶1.5 mL收集管,将预热的洗脱缓冲液(或无核酸酶水)直接加至膜中央,室温孵育1–3分钟,以8,000–10,000 × g离心1分钟,流穿液即为纯化的病毒DNA/RNA。如需提高产量,可再加一次洗脱缓冲液进行第二次洗脱。
- 储存:洗脱液立即置于冰上供短期使用;长期储存时,RNA洗脱液置−70°C,DNA洗脱液置−20°C,避免反复冻融。
质量控制与下游验证
提取完成后,在进行下游应用前,请通过以下方法评估核酸的质量和浓度:
- 分光光度法分析:使用微量分光光度计(如NanoDrop)检测260 nm(A260)和280 nm(A280)处的吸光度。纯净RNA的A260/A280比值通常约为2.0,纯净DNA约为1.8,比值明显偏离此范围提示可能存在蛋白质或溶剂污染。同时检测A260/A230比值,以评估离液盐或有机溶剂残留,一般可接受值为≥1.8。
- 荧光定量法:对于低浓度或高度稀释的洗脱液,荧光定量分析(如Qubit RNA HS或DNA HS试剂盒)比分光光度法更灵敏、更准确。
- 功能验证:最可靠的质量检测方法是功能性下游实验。在裂解前加入已知拷贝数的外源RNA或DNA内对照,可评估提取效率并检测PCR抑制物。每次实验均应设置无模板阴性对照,条件允许时设置阳性提取对照。
- 凝胶电泳(可选):如需评估RNA完整性,可在变性琼脂糖凝胶上电泳,或使用微流控毛细管电泳系统(如Agilent Bioanalyzer或TapeStation)观察核糖体RNA条带并获取RNA完整性指数(RIN)。对于来自无细胞样本(血清、血浆)的病毒RNA,通常不会出现明显的rRNA条带,可通过靶序列的成功扩增来间接判断病毒RNA的完整性。
常见问题排查
当实验结果不理想时,请参考下表进行排查:
| 问题 | 可能原因 | 建议措施 |
|---|---|---|
| 核酸产量低 | 裂解不充分;洗涤缓冲液2未加入乙醇;洗脱缓冲液未预热;样本中病毒载量低 | 确认洗涤缓冲液2已补加乙醇;预热洗脱缓冲液;使用载体RNA;进行第二次洗脱;确认样本质量 |
| PCR抑制/无扩增 | 膜干燥不充分导致乙醇残留;跳过洗涤步骤导致离液盐残留 | 将干燥离心步骤延长至3–5分钟;不得跳过任何洗涤步骤;将洗脱液按1:5–1:10稀释后重新检测 |
| A260/A280比值偏低 | 蛋白质污染;洗涤不充分 | 重复洗涤步骤;确保离心转速和时间正确 |
| A260/A230比值偏低 | 离液盐或有机物残留 | 重复洗涤缓冲液1步骤;确保洗涤缓冲液2已正确补加乙醇 |
| RNA降解 | 移液器、管或操作人员引入RNase污染;样本处理延迟 | 使用经认证的无RNase耗材和无核酸酶水;在冰上操作;采集后尽快处理样本;全程佩戴新鲜手套 |
| 交叉污染 | 涡旋过程中产生气溶胶;收集管重复使用 | 使用气溶胶屏障吸头;切勿重复使用收集管;在专用洁净区进行提取操作,与PCR体系配制区域分开 |
常见问题
病毒DNA/RNA快速提取试剂盒能否同时用于血清和拭子样本?
是的。该试剂盒适用于多种生物样本类型,包括血清、血浆、鼻咽或口咽拭子(置于病毒保存液中)、全血及其他无细胞体液。请根据说明书针对不同样本基质的建议调整投入样本量和裂解缓冲液用量。
为什么推荐使用载体RNA,应如何配制?
载体RNA(通常为poly-A RNA或MS2噬菌体RNA)加入裂解缓冲液中,通过占据硅胶膜上的非特异性结合位点并与目标核酸共沉淀,从而提高低丰度病毒核酸的回收率。配制方法:将冻干载体RNA溶于无核酸酶水,配制至说明书规定浓度,于使用前立即将推荐体积加入裂解缓冲液。未用完的载体RNA储备液应置−70°C保存。
提取的病毒RNA应如何储存以防止降解?
病毒RNA极易受RNase降解。短期储存(24小时以内)可置于冰上或4°C。长期储存时,应将RNA分装为单次用量以避免反复冻融,并储存于−70°C(首选)或−80°C。避免长期保存于−20°C,因普通−20°C冰箱的自动除霜循环可导致温度波动,从而降解RNA。
本试剂盒推荐的最大样本投入量是多少?
请参阅试剂盒说明书中针对各样本类型的具体推荐投入量,因不同样本基质的最大投入量可能有所不同。血清或血浆的典型投入量通常为每柱140–200 µL,但请务必遵循试剂盒随附的具体说明以确保最佳性能。
本试剂盒是否兼容自动化液体处理平台?
此类离心柱试剂盒通常可适配半自动或全自动核酸提取平台。如需已验证的自动化操作规程及兼容仪器信息,请咨询阿拉丁科学技术支持,具体适配可能需要对体积及离心或负压参数进行优化。
参考文献
- Boom R, et al. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. Journal of Clinical Microbiology. 1990;28(3):495-503. PMID:1691208
- Chomczynski P, Sacchi N. The single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction: twenty-something years on. Nature Protocols. 2006;1(2):581-585. doi:10.1038/nprot.2006.83
- Aladdin Scientific. Viral DNA/RNA Rapid Extraction Kit (D1128032) Product Page. Aladdin Scientific Official Website.
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
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