X-Green II dsDNA Quantification Kit: Protocol & Usage Guide
X-Green II dsDNA Quantification Kit: Protocol & Usage Guide
X-Green II Double-Stranded DNA Quantification Kit (Upgraded Version) is 一款基于荧光原理、具有高灵敏度和高选择性的双链DNA定量试剂系统,专为多种生物样本中双链DNA的准确、快速定量而设计。
- 产品货号
- X1372284
- 检测对象
- 双链DNA(dsDNA)
- 检测方法
- 荧光定量法
- 试剂盒版本
- 升级版(X-Green II)
- 推荐应用
- 适用于纯化样本、PCR产物、基因组DNA及质粒DNA中双链DNA的定量检测
- 储存建议
- 避光保存于推荐温度下,详情参见试剂盒说明书
产品概述与检测原理
X-Green II双链DNA定量试剂盒(升级版)(货号:X1372284)采用专有荧光嵌入染料,该染料与双链DNA选择性结合后荧光显著增强。在无DNA存在时,染料背景荧光极低,且对双链DNA相较于单链DNA(ssDNA)和RNA具有高度选择性,即使在含有上述杂质的样本中也能可靠定量双链DNA。
升级版X-Green II配方旨在与传统嵌入染料法相比提供更高灵敏度和更宽线性动态范围,可实现从皮克级至微克级双链DNA的精准定量。荧光信号通过标准荧光计或荧光酶标仪在与染料相适配的激发和发射波长下进行检测。
所需材料与仪器设备
在开始实验前,请确保以下材料和仪器设备已准备就绪:
- X-Green II双链DNA定量试剂盒(升级版)——包含X-Green II试剂、检测缓冲液及双链DNA标准品
- 可检测该染料激发/发射波长的荧光计或荧光酶标仪
- 经校准的移液器及低吸附吸头
- 微量离心管或黑壁平底微孔板(用于微孔板检测)
- 用于绘制标准曲线的双链DNA标准品(试剂盒已提供)
- 用于试剂配制的去离子水或无核酸酶水
- 计时器和涡旋混匀仪
除试剂盒说明书另有规定外,所有试剂在使用前应恢复至室温。
分步实验操作方案
第一步——配制工作试剂:按照试剂盒说明书规定的比例,将X-Green II染料浓缩液用所提供的检测缓冲液稀释,配制足够覆盖所有标准品和待测样本的工作液。工作试剂应避光保存。
第二步——配制双链DNA标准品:使用试剂盒提供的双链DNA标准品储液,在检测缓冲液中配制一系列覆盖试剂盒推荐浓度范围的梯度稀释标准品。同时设置空白对照(仅含检测缓冲液,不含DNA)用于背景扣除。
第三步——准备待测样本:视情况将待测DNA样本用检测缓冲液稀释,使预期浓度落入标准曲线线性范围内。样本加样体积应与标准品保持一致。
第四步——混匀与孵育:向每个标准品和样本管或微孔板孔中加入工作试剂,轻柔涡旋或混匀,然后按照试剂盒说明书规定的时间(通常为2–5分钟)在室温下避光孵育。
第五步——荧光检测:按照试剂盒文件推荐的激发和发射波长,使用荧光计或酶标仪读取荧光值,并记录所有数据。
第六步——计算DNA浓度:用所有读数减去空白荧光值。以标准品荧光值对已知浓度作图,绘制标准曲线。利用标准曲线内插待测样本中双链DNA的浓度,计算时需乘以相应的稀释倍数。
常见问题排查与最佳操作建议
背景荧光偏高:确保所有管和板不含污染DNA,使用无核酸酶水和洁净耗材。确认工作试剂在配制和孵育过程中全程避光。
标准曲线非线性:检查标准品配制是否准确,以及样本浓度是否落在已验证的线性范围内。避免染料储液反复冻融,以免影响性能。
信号低或无信号:确认荧光计的激发和发射波长设置适用于X-Green II染料。通过核查有效期和储存条件确认试剂完好。确保工作试剂在分装前已充分混匀。
样本抑制:某些样本成分(如高盐、去垢剂、离液剂)可能抑制荧光信号。如怀疑存在抑制,可进一步稀释样本或进行额外纯化步骤。
通用最佳操作建议:每次检测未知样本时均应同步绘制标准曲线。保持一致的移液操作手法。试剂和样本在准备过程中应置于冰上,仅在实验开始前恢复至室温。
储存、稳定性与安全注意事项
储存:按照试剂盒标签和说明书规定的条件储存所有组件。荧光染料试剂通常应避光保存,以防光漂白。各组件的具体温度要求请参见相应标签。
稳定性:不得使用超过有效期的试剂盒组件。避免任何液体组件反复冻融,以免影响试剂性能和检测灵敏度。
安全性:X-Green II染料仅供科研使用(RUO)。尽管荧光嵌入染料与溴化乙锭相比诱变性可能较低,但操作所有染料试剂时仍应采取适当防护措施。处理试剂时请佩戴合适的个人防护装备(PPE),包括手套、实验服和护目镜。所有废弃物的处置须符合当地适用法规及机构生物安全指南。
常见问题
X-Green II双链DNA定量试剂盒可用于哪些类型的DNA样本定量?
该试剂盒适用于多种纯化样本中双链DNA的定量,包括基因组DNA、质粒DNA、PCR扩增产物及其他双链DNA制品。样本应尽量不含抑制物;若怀疑存在抑制,建议用检测缓冲液稀释后再检测。
X-Green II染料对双链DNA相较于RNA和单链DNA是否具有选择性?
是的,X-Green II染料专为高选择性结合双链DNA而设计,对单链DNA和RNA的结合能力极低。这一特性使其特别适合在含有RNA或单链DNA的样本中直接定量双链DNA,无需预先酶处理去除这些杂质,但若RNA含量极高,建议对结果进行验证。
该检测方法是否支持微孔板高通量格式?
是的,X-Green II检测方法兼容单管荧光计检测和荧光微孔板读数仪两种格式。进行微孔板检测时,建议使用黑壁平底微孔板,以降低背景信号并确保各孔荧光读数的准确性。
如何正确处理X-Green II工作试剂以保持检测性能?
按照说明书指引,在实验当天将染料浓缩液用检测缓冲液新鲜配制工作试剂。全程避光保存工作试剂,防止染料降解。为确保最佳检测效果,请在试剂盒说明书规定的时间内使用工作试剂。
若样本荧光值超出标准曲线范围,应如何处理?
若样本读数超过标准曲线上限,应用检测缓冲液进一步稀释样本后重新检测。若读数低于检出限,可在方案允许的情况下增大取样体积,或对样本进行浓缩处理。务必确保最终读数在标准曲线验证的线性范围内进行内插计算。
参考文献
- Aladdin Scientific. X-Green II Double-Stranded DNA Quantification Kit (Upgraded Version) product information and kit insert. SKU X1372284.
- Singer VL, Jones LJ, Yue ST, Haugland RP. Characterization of PicoGreen reagent and development of a fluorescence-based solution assay for double-stranded DNA quantitation. Anal Biochem. 1997;249(2):228-238. doi:10.1006/abio.1997.2177
产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。
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